Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000488504
- Subject:
- NM_022420.2
- Aligned Length:
- 1237
- Identities:
- 1049
- Gaps:
- 35
Alignment
Query 1 ATGTTCGTGGCATCAGAGAGAAAGATGAGAGCTCACCAGGTGCTCACCTTCCTCCTGCTCTTCGTGATCACCTC 74
||||||.|||..|.||||||||||||||||.|.||.||.|||.|..||||.|.|||||||.|.|||||..||||
Sbjct 1 ATGTTCCTGGTGTTAGAGAGAAAGATGAGAACCCATCAAGTGTTTCCCTTGCCCCTGCTCCTGGTGATTGCCTC 74
Query 75 GGTGGCCTCTGAAAACGCCAGCACATCCCGAGGCTGTGGGCTGGACCTCCTCCCTCAGTACGTGTCCCTGTGCG 148
.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGTGGCTTCAGAGAACGCCAGCACGTCCCGGGGCTGTGGACTGGACCTTCTTCCTCAGTACGTGTCCCTGTGCG 148
Query 149 ACCTGGACGCCATCTGGGGCATTGTGGTGGAGGCGGTGGCCGGGGCGGGCGCCCTGATCACACTGCTCCTGATG 222
||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 ACCTGGACGCCATCTGGGGCATCGTGGTGGAGGCAGTGGCCGGGGCGGGGGCCCTGATCACACTGCTTCTGATG 222
Query 223 CTCATCCTCCTGGTGCGGCTGCCCTTCATCAAGGAGAAGGAGAAGAAGAGCCCTGTGGGCCTCCACTTTCTGTT 296
|||||.|||||.|||.|.||.||||||||||||||.|||||.|.||||.|.||||||.|||||||.||.||.||
Sbjct 223 CTCATTCTCCTAGTGAGACTACCCTTCATCAAGGACAAGGAAAGGAAGCGGCCTGTGTGCCTCCATTTCCTCTT 296
Query 297 CCTCCTGGGGACCCTGGGCCTCTTTGGGCTGACGTTTGCCTTCATCATCCAGGAGGACGAGACCATCTGCTCTG 370
|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||..|||||||||.||||||||..
Sbjct 297 CCTGCTGGGGACCCTGGGCCTCTTTGGCCTGACGTTTGCCTTCATCATCCAGATGGACGAGACAATCTGCTCCA 370
Query 371 TCCGCCGCTTCCTCTGGGGCGTCCTCTTTGCGCTCTGCTTCTCCTGCCTGCTGAGCCAGGCATGGCGCGTGCGG 444
||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 371 TCCGACGCTTCCTCTGGGGTGTCCTCTTCGCGCTCTGCTTTTCCTGCCTGCTGAGCCAGGCGTGGCGGGTGCGG 444
Query 445 AGGCTGGTGCGGCATGGCACGGGCCCCGCGGGCTGGCAGCTGGTGGGCCTGGCGCTGTGCCTGATGCTGGTGCA 518
|||||||||||.||.|||||..||||.||..||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGGCTGGTGCGCCAGGGCACAAGCCCGGCCAGCTGGCAGCTGGTGAGCCTGGCACTGTGCCTGATGCTGGTGCA 518
Query 519 AGTCATCATCGCTGTGGAGTGGCTGGTGCTCACCGTGCTGCGTGACACAAGGCCAGCCTGCGCCTACGAGCCCA 592
.||||||||.||....||||||||||||||.||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGTCATCATTGCCACTGAGTGGCTGGTGCTGACTGTGCTGCGTGACACGAAGCCAGCCTGCGCCTACGAGCCCA 592
Query 593 TGGACTTTGTGATGGCCCTCATCTACGACATGGTACTGCTTGTGGTCACCCTGGGGCTGGCCCTCTTCACTCTG 666
||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|...|||||||||..|.|.||||||||||.|||
Sbjct 593 TGGATTTTGTGATGGCGCTCATCTACGACATGGTGCTGCTGGCCATCACCCTGGCCCAGTCCCTCTTCACGCTG 666
Query 667 TGCGGCAAGTTCAAGAGGTGGAAGCTGAACGGGGCCTTCCTCCTCATCACAGCCTTCCTCTCTGTGCTCATCTG 740
||.|||||||||||..||||||||.|||||||.||||||.|||||.||||..||||||||||||.|||||||||
Sbjct 667 TGTGGCAAGTTCAAACGGTGGAAGGTGAACGGAGCCTTCATCCTCGTCACTACCTTCCTCTCTGCGCTCATCTG 740
Query 741 GGTGGCCTGGATGACCATGTACCTCTTCGGCAATGTC---AAGCTGCAGCAGGGGGATGCCTGGAACGACCCCA 811
|||||.||||||||||||||||||||||||||| .|| || |..|||||||.||||||||||.||||||||
Sbjct 741 GGTGGTCTGGATGACCATGTACCTCTTCGGCAA-CTCATTAA--TTAAGCAGGGAGATGCCTGGAGCGACCCCA 811
Query 812 CCTTGGCCATCACGCTGGCGGCCAGCGGCTGGGTCTTCGTCATCTTCCACGCCATCCCTGAGATCCACTGCACC 885
||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||.||||
Sbjct 812 CCTTGGCCATTACACTGGCAGCCAGCGGATGGGTCTTTGTCATCTTCCATGCCATTCCGGAGATCCACTACACC 885
Query 886 CTTCTGCCAGCCCTGCAGGAGAACACGCCCAACTACTTCGACACGTCGCAGCCCAGGATGCGGGAGACGGCCTT 959
|||||.|||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 886 CTTCTCCCACCCCTGCAGGAGAACCCACCCAACTACTTCGACACTTCACAGCCCAGGATGCGGGAGACAGCATT 959
Query 960 CGAGGAGGACGTGCAGCTGCCGCGGGCCTATATGGAGAACAAGGCCTTCTCCATGGATGAACACAATGCAGCTC 1033
.||.|||||..||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct 960 TGATGAGGAAATGCACCTGCCTCGGGCCTACATGGAGAACAAGGCCTTCTCAATGGATGAACATAACGCAGCTC 1033
Query 1034 TCCGAACAGCA---GGATTTCCCAACG---------------------GCAGCTTGGGAAA-AAGACCCAGTGG 1082
|||||.||||| ||.|||.||||.| |||||.||||||| ||| |||| |
Sbjct 1034 TCCGATCAGCAGTGGGCTTTTCCAATGGAAGCTTGGAGCAAAGATCTAGCAGCCTGGGAAAGAAG-CCCA---G 1103
Query 1083 CAGCTTGGGGAAAAGACCCAGCGCTCCGTTTAGAAGCAACGTGTATCAGCCAACTGAGATGGCCGTCGTGCTCA 1156
|||||||||.||..|.|||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1104 CAGCTTGGGAAACCGGCCCAGTGCACCGTTCAGAAGCAATGTGTATCAGCCGACCGAGATGGCCGTCGTGCTCA 1177
Query 1157 ACGGTGGGACCATCCCAACTGCTCCGCCAAGTCACACAGGAAGACACCTTTGG 1209
|.||.|||||.||||||||||||||||||..||||||.||||||||||.||||
Sbjct 1178 ATGGAGGGACTATCCCAACTGCTCCGCCATCTCACACGGGAAGACACCATTGG 1230