Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488623
• Subject: NM_001033124.1
• Aligned Length: 2488
• Identities: 2026
• Gaps: 131

Alignment

Query    1  ATGTCGGGTGAGGCCTGGCAGCTGCAGCTGGGAGCGCACAGACGGCTGCCCCGCCTGAGCGAGGCGGGCGCCGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGCGATGCTGCGAGGCGGACGGCGCGGGCAGCTTGGCTGGCACAGCTGGGCTGCGGGGCCGGGCAGCCTGCTGG  148
                ||||||||||||...||||.|||||||||.||||||||..||..|||.|||||||..|||||.|||.||.
Sbjct    1  ----ATGCTGCGAGGCCAGCGGCTCGGGCAGCTGGGCTGGCATCGCCCGGCCGCGGGGCTAGGCAGTCTGATGA  70

Query  149  CTTGGCTGATACTGGCATCTGCGGGCGCCGCACCCTGCCCCGATGCCTGCTGCCCCCACGGCTCCTCGGGACTG  222
            |||.|.||||.|||||.|.|||...|||||||.||||.|.|||.|.||||||.|||...|||.|||||||.|||
Sbjct   71  CTTCGTTGATGCTGGCCTGTGCCTCCGCCGCATCCTGTCGCGAGGTCTGCTGTCCCGTGGGCCCCTCGGGGCTG  144

Query  223  CGATGCACCCGGGATGGGGCCCTGGATAGCCTCCACCACCTGCCCGGCGCAGAGAACCTGACTGAGCTCTACAT  296
            ||.||||||.|||..|||.|||||||||.|||||.|..|||||..|||||.|.|||||||||.|||||||||.|
Sbjct  145  CGCTGCACCAGGGCAGGGTCCCTGGATACCCTCCGCGGCCTGCGGGGCGCCGGGAACCTGACGGAGCTCTACGT  218

Query  297  CGAGAACCAGCAGCATCTGCAGCATCTGGAGCTCCGTGATCTGAGGGGCCTGGGGGAGCTGAGAAACCTCACCA  370
            .||.|||||||||||.|||||.|...|||||.|....||.|||..|||||||||||||.||||||.|||.||||
Sbjct  219  GGAAAACCAGCAGCACCTGCAACGCTTGGAGTTTGAGGACCTGCAGGGCCTGGGGGAGTTGAGAAGCCTAACCA  292

Query  371  TCGTGAAGAGTGGTCTCCGTTTCGTGGCGCCAGATGCCTTCCATTTCACTCCTCGGCTCAGTCGCCTGAATCTC  444
            |||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||.
Sbjct  293  TCGTGAAGAGTGGCCTCCGCTTTGTGGCCCCAGATGCCTTCCGTTTCACCCCTCGGCTCAGTCACCTGAATCTG  366

Query  445  TCCTTCAACGCTCTGGAGTCTCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCTTACAGGAACTGGTCCTGTCGGG  518
            ||||.|||.||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||..||||||.||
Sbjct  367  TCCTCCAATGCGTTGGAGTCCCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCCTACAGGACCTGACCCTGTCAGG  440

Query  519  GAACCCTCTGCACTGTTCTTGTGCCCTGCGCTGGCTACAGCGCTGGGAGGAGGAGGGACTGGGCGGAGTGCCTG  592
            ||||||.|||||.|||||.|||||||||..||||||.|||||.||||||.||||.||.|||.|.||.||||.|.
Sbjct  441  GAACCCACTGCATTGTTCCTGTGCCCTGTTCTGGCTCCAGCGTTGGGAGCAGGAAGGGCTGTGTGGTGTGCATA  514

Query  593  AACAGAAGCTGCAGTG--TCATGGGCAAGGGCCCCTGG------------CCCACATG---CCCAATGCCAGCT  649
            .|||||.|||.|| ||  || ||||        |||||            ||||| ||   |.|||..||||.|
Sbjct  515  CACAGACGCTTCA-TGACTC-TGGG--------CCTGGAGACCAGTTCCTCCCAC-TGGGACACAACACCAGTT  577

Query  650  GTGGTGTGCCCACGCTGAAGGTCCAGGTGCCCAATGCCTCGGTGGATGTGGGGGACGACGTGCTGCTGCGGTGC  723
            |||||||.|||||..|||||.|||||.|||||||||.|||.|||||.|||||.||.||||||.|.||||.||||
Sbjct  578  GTGGTGTACCCACAGTGAAGATCCAGATGCCCAATGACTCTGTGGAAGTGGGCGATGACGTGTTTCTGCAGTGC  651

Query  724  CAGGTGGAGGGGCGGGGCCTGGAGCAGGCCGGCTGGATCCTCACAGAGCTGGAGCAGTCAGCCACGGTGATGAA  797
            |||||||||||||.||.|||..|||||||.|.|||||||||||||||||||||...|.|||||||.||||.|||
Sbjct  652  CAGGTGGAGGGGCTGGCCCTACAGCAGGCTGACTGGATCCTCACAGAGCTGGAAGGGGCAGCCACCGTGAAGAA  725

Query  798  ATCTGGGGGTCTGCCATCCCTGGGGCTGACCCTGGCCAATGTCACCAGTGACCTCAACAGGAAGAACTTGACGT  871
            ||.|||.|.||||||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||..||||||
Sbjct  726  ATTTGGAGATCTGCCATCCCTGGGGCTGATTCTGGTCAATGTCACCAGTGATCTCAACAAGAAGAATGTGACGT  799

Query  872  GCTGGGCAGAGAACGATGTGGGCCGGGCAGAGGTCTCTGTTCAGGTCAACGTCTCCTTCCCGGCCAGTGTGCAG  945
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||.||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  800  GCTGGGCAGAGAATGATGTGGGCCGGGCCGAGGTCTCTGTCCAAGTCAGCGTCTCCTTCCCAGCCAGTGTGCAC  873

Query  946  CTGCACACGGCGGTGGAGATGCACCACTGGTGCATCCCCTTCTCTGTGGATGGGCAGCCGGCACCGTCTCTGCG  1019
            |||..|...|||||||||..|||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  874  CTGGGCCTAGCGGTGGAGCAGCATCATTGGTGCATCCCCTTCTCGGTGGACGGGCAGCCAGCACCGTCTCTGCG  947

Query 1020  CTGGCTCTTCAATGGCTCCGTGCTCAATGAGACCAGCTTCATCTTCACTGAGTTCCTGGAGCCGGCAG----CC  1089
            ||||.|.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||.|||||.|.|| |    |.
Sbjct  948  CTGGTTGTTCAACGGCTCTGTGCTCAACGAGACCAGTTTCATCTTCACTCAGTTCTTGGAGTCTGC-GCTGACT  1020

Query 1090  AATGAGACCGTGCGGCACGGGTGTCTGCGCCTCAACCAGCCCACCCACGTCAACAACGGCAACTACACGCTGCT  1163
            |||||||||.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1021  AATGAGACCATGCGGCACGGCTGCCTGCGCCTCAATCAGCCCACGCATGTCAACAACGGGAACTACACCCTGCT  1094

Query 1164  GGCTGCCAACCCCTTCGGCCAGGCCTCCGCCTCCATCATGGCTGCCTTCATGGACAACCCTTTCGAGTTCAACC  1237
            |||.||||||||||.|||||||||..||||||||.||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1095  GGCGGCCAACCCCTACGGCCAGGCTGCCGCCTCCGTCATGGCTGCTTTTATGGACAACCCTTTTGAGTTCAACC  1168

Query 1238  CCGAGGACCCCATCCCT------------------GACACTAACAGCACATCTGGAGACCCGGTGGAGAAGAAG  1293
            |.|||||||||||||||                  |||..||||||||||||..|||||||.|||||||||||.
Sbjct 1169  CTGAGGACCCCATCCCTGTCTCCTTCTCGCCAGTGGACGGTAACAGCACATCAAGAGACCCAGTGGAGAAGAAA  1242

Query 1294  GACGAAACACCTTTTGGGGTCTCGGTGGCTGTGGGCCTGGCCGTCTTTGCCTGCCTCTTCCTTTCTACGCTGCT  1367
            ||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.||||..|||||||||||||.|.||.||
Sbjct 1243  GATGAAACCCCTTTTGGGGTCTCTGTGGCTGTGGGCCTAGCCGTCTCTGCCGCCCTCTTCCTTTCTGCCCTCCT  1316

Query 1368  CCTTGTGCTCAACAAATGTGGACGGAGAAACAAGTTTGGGATCAACCGCCCGGCTGTGCTGGCTCCAGAGGATG  1441
            .||||||||||||||||||||||.|||.|.|||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||||
Sbjct 1317  TCTTGTGCTCAACAAATGTGGACAGAGGAGCAAATTTGGGATCAACCGCCCTGCTGTATTAGCTCCAGAGGATG  1390

Query 1442  GGCTGGCCATGTCCCTGCATTTCATGACATTGGGTGGCAGCTCCCTGTCCCCCACCGAGGGCAAAGGCTCTGGG  1515
            ||||||||||||||||.||.|||||||||.||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1391  GGCTGGCCATGTCCCTACACTTCATGACACTGGGTGGCAGTTCTCTTTCCCCTACTGAGGGCAAAGGCTCCGGA  1464

Query 1516  CTCCAAGGCCACATCATCGAGAACCCACAATACTTCAGTGATGCCTGTGTTCACCACATCAAGCGCCGGGACAT  1589
            |||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||.||||||
Sbjct 1465  CTCCAGGGCCACATCATGGAGAACCCACAGTACTTCAGTGATACCTGTGTCCATCACATCAAGCGCCAGGACAT  1538

Query 1590  CGTGCTCAAGTGGGAGCTGGGGGAGGGCGCCTTTGGGAAGGTCTTCCTTGCTGAGTGCCACAACCTCCTGCCTG  1663
            |.|.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||.|||||||.|||..||
Sbjct 1539  CATTCTCAAGTGGGAGCTAGGGGAGGGAGCCTTTGGAAAGGTCTTTCTCGCTGAGTGCTACAACCTTCTGAATG  1612

Query 1664  AGCAGGACAAGATGCTGGTGGCTGTCAAGGCACTGAAGGAGGCGTCCGAGAGTGCTCGGCAGGACTTCCAACGT  1737
            |.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1613  ATCAGGACAAGATGCTCGTGGCTGTCAAGGCACTGAAGGAGGCATCCGAGAATGCTCGGCAGGACTTTCAGCGT  1686

Query 1738  GAGGCTGAGCTGCTCACCATGCTGCAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTCGGCGTCTGCACCGAGGGCCGCCC  1811
            |||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..||||
Sbjct 1687  GAGGCCGAGCTGCTCACCATGCTACAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTTGGAGTCTGCACCGAGGGTGGCCC  1760

Query 1812  CCTGCTCATGGTCTTTGAGTATATGCGGCACGGGGACCTCAACCGCTTCCTCCGATCCCATGGACCTGATGCCA  1885
            ..|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 1761  GTTGCTCATGGTCTTTGAGTACATGCGCCACGGGGACCTCAACCGTTTCCTCCGGTCCCACGGACCTGATGCAA  1834

Query 1886  AGCTGCTGGCTGGTGGGGAGGATGTGGCTCCAGGCCCCCTGGGTCTGGGGCAGCTGCTGGCCGTGGCTAGCCAG  1959
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1835  AGCTGCTGGCTGGTGGTGAGGATGTGGCTCCTGGTCCTCTGGGCCTTGGGCAGCTTCTGGCTGTGGCTAGCCAG  1908

Query 1960  GTCGCTGCGGGGATGGTGTACCTGGCGGGTCTGCATTTTGTGCACCGGGACCTGGCCACACGCAACTGTCTAGT  2033
            ||.|||||.||.|||||.||.||.||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1909  GTGGCTGCTGGTATGGTATATCTAGCCAGCCTGCACTTTGTGCACCGGGATCTGGCCACACGCAACTGTCTGGT  1982

Query 2034  GGGCCAGGGACTGGTGGTCAAGATTGGTGATTTTGGCATGAGCAGGGATATCTACAGCACCGACTATTACCGTG  2107
            |||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 1983  GGGTCAGGGACTAGTGGTGAAGATTGGAGACTTTGGCATGAGCAGAGACATCTATAGCACAGACTATTACCGAG  2056

Query 2108  TGGGAGGCCGCACCATGCTGCCCATTCGCTGGATGCCGCCCGAGAGCATCCTGTACCGTAAGTTCACCACCGAG  2181
            |||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||.|||||||
Sbjct 2057  TGGGAGGTCGGACCATGCTGCCCATCCGCTGGATGCCACCCGAGAGCATCCTCTACCGCAAGTTCAGCACCGAG  2130

Query 2182  AGCGACGTGTGGAGCTTCGGCGTGGTGCTCTGGGAGATCTTCACCTACGGCAAGCAGCCCTGGTACCAGCTCTC  2255
            |||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2131  AGCGATGTGTGGAGCTTTGGGGTGGTGCTCTGGGAGATCTTCACCTATGGAAAGCAGCCCTGGTACCAGCTCTC  2204

Query 2256  CAACACGGAGGCAATCGACTGCATCACGCAGGGACGTGAGTTGGAGCGGCCACGTGCCTGCCCACCAGAGGTCT  2329
            ||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||.||||||||||.||.||||||||.||.||.||||
Sbjct 2205  CAACACTGAGGCGATCGAGTGTATCACGCAGGGCCGGGAGCTGGAGCGGCCGCGCGCCTGCCCTCCTGATGTCT  2278

Query 2330  ACGCCATCATGCGGGGCTGCTGGCAGCGGGAGCCCCAGCAACGCCACAGCATCAAGGATGTGCACGCCCGGCTG  2403
            |||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||.||||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2279  ACGCCATCATGCGAGGCTGCTGGCAGCGAGAACCGCAGCAACGCCTCAGCATGAAGGATGTGCACGCGCGTCTG  2352

Query 2404  CAAGCCCTGGCCCAGGCACC-TCCTGTCTACCTGGATGTCCTGGGC  2448
            ||.||||||||.|||||.|| .||.|| ||||||||.||.||||||
Sbjct 2353  CAGGCCCTGGCACAGGCGCCACCCAGT-TACCTGGACGTTCTGGGC  2397