Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488623
• Subject: XM_006501124.2
• Aligned Length: 2470
• Identities: 2026
• Gaps: 113

Alignment

Query    1  ATGTCGGGTGAGGCCTGGCAGCTGCAGCTGGGAGCGCACAGACGGCTGCCCCGCCTGAGCGAGGCGGGCGCCGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGCGATGCTGCGAGGCGGACGGCGCGGGCAGCTTGGCTGGCACAGCTGGGCTGCGGGGCCGGGCAGCCTGCTGG  148
                ||||||||||||...||||.|||||||||.||||||||..||..|||.|||||||..|||||.|||.||.
Sbjct    1  ----ATGCTGCGAGGCCAGCGGCTCGGGCAGCTGGGCTGGCATCGCCCGGCCGCGGGGCTAGGCAGTCTGATGA  70

Query  149  CTTGGCTGATACTGGCATCTGCGGGCGCCGCACCCTGCCCCGATGCCTGCTGCCCCCACGGCTCCTCGGGACTG  222
            |||.|.||||.|||||.|.|||...|||||||.||||.|.|||.|.||||||.|||...|||.|||||||.|||
Sbjct   71  CTTCGTTGATGCTGGCCTGTGCCTCCGCCGCATCCTGTCGCGAGGTCTGCTGTCCCGTGGGCCCCTCGGGGCTG  144

Query  223  CGATGCACCCGGGATGGGGCCCTGGATAGCCTCCACCACCTGCCCGGCGCAGAGAACCTGACTGAGCTCTACAT  296
            ||.||||||.|||..|||.|||||||||.|||||.|..|||||..|||||.|.|||||||||.|||||||||.|
Sbjct  145  CGCTGCACCAGGGCAGGGTCCCTGGATACCCTCCGCGGCCTGCGGGGCGCCGGGAACCTGACGGAGCTCTACGT  218

Query  297  CGAGAACCAGCAGCATCTGCAGCATCTGGAGCTCCGTGATCTGAGGGGCCTGGGGGAGCTGAGAAACCTCACCA  370
            .||.|||||||||||.|||||.|...|||||.|....||.|||..|||||||||||||.||||||.|||.||||
Sbjct  219  GGAAAACCAGCAGCACCTGCAACGCTTGGAGTTTGAGGACCTGCAGGGCCTGGGGGAGTTGAGAAGCCTAACCA  292

Query  371  TCGTGAAGAGTGGTCTCCGTTTCGTGGCGCCAGATGCCTTCCATTTCACTCCTCGGCTCAGTCGCCTGAATCTC  444
            |||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||||||.
Sbjct  293  TCGTGAAGAGTGGCCTCCGCTTTGTGGCCCCAGATGCCTTCCGTTTCACCCCTCGGCTCAGTCACCTGAATCTG  366

Query  445  TCCTTCAACGCTCTGGAGTCTCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCTTACAGGAACTGGTCCTGTCGGG  518
            ||||.|||.||..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||..||||||.||
Sbjct  367  TCCTCCAATGCGTTGGAGTCCCTCTCCTGGAAAACTGTGCAGGGCCTCTCCCTACAGGACCTGACCCTGTCAGG  440

Query  519  GAACCCTCTGCACTGTTCTTGTGCCCTGCGCTGGCTACAGCGCTGGGAGGAGGAGGGACTGGGCGGAGTGCCTG  592
            ||||||.|||||.|||||.|||||||||..||||||.|||||.||||||.||||.||.|||.|.||.||||.|.
Sbjct  441  GAACCCACTGCATTGTTCCTGTGCCCTGTTCTGGCTCCAGCGTTGGGAGCAGGAAGGGCTGTGTGGTGTGCATA  514

Query  593  AACAGAAGCTGCAGTG--TCATGGGCAAGGGCCCCTGG------------CCCACATG---CCCAATGCCAGCT  649
            .|||||.|||.|| ||  || ||||        |||||            ||||| ||   |.|||..||||.|
Sbjct  515  CACAGACGCTTCA-TGACTC-TGGG--------CCTGGAGACCAGTTCCTCCCAC-TGGGACACAACACCAGTT  577

Query  650  GTGGTGTGCCCACGCTGAAGGTCCAGGTGCCCAATGCCTCGGTGGATGTGGGGGACGACGTGCTGCTGCGGTGC  723
            |||||||.|||||..|||||.|||||.|||||||||.|||.|||||.|||||.||.||||||.|.||||.||||
Sbjct  578  GTGGTGTACCCACAGTGAAGATCCAGATGCCCAATGACTCTGTGGAAGTGGGCGATGACGTGTTTCTGCAGTGC  651

Query  724  CAGGTGGAGGGGCGGGGCCTGGAGCAGGCCGGCTGGATCCTCACAGAGCTGGAGCAGTCAGCCACGGTGATGAA  797
            |||||||||||||.||.|||..|||||||.|.|||||||||||||||||||||...|.|||||||.||||.|||
Sbjct  652  CAGGTGGAGGGGCTGGCCCTACAGCAGGCTGACTGGATCCTCACAGAGCTGGAAGGGGCAGCCACCGTGAAGAA  725

Query  798  ATCTGGGGGTCTGCCATCCCTGGGGCTGACCCTGGCCAATGTCACCAGTGACCTCAACAGGAAGAACTTGACGT  871
            ||.|||.|.||||||||||||||||||||..||||.|||||||||||||||.|||||||.||||||..||||||
Sbjct  726  ATTTGGAGATCTGCCATCCCTGGGGCTGATTCTGGTCAATGTCACCAGTGATCTCAACAAGAAGAATGTGACGT  799

Query  872  GCTGGGCAGAGAACGATGTGGGCCGGGCAGAGGTCTCTGTTCAGGTCAACGTCTCCTTCCCGGCCAGTGTGCAG  945
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||.||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  800  GCTGGGCAGAGAATGATGTGGGCCGGGCCGAGGTCTCTGTCCAAGTCAGCGTCTCCTTCCCAGCCAGTGTGCAC  873

Query  946  CTGCACACGGCGGTGGAGATGCACCACTGGTGCATCCCCTTCTCTGTGGATGGGCAGCCGGCACCGTCTCTGCG  1019
            |||..|...|||||||||..|||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  874  CTGGGCCTAGCGGTGGAGCAGCATCATTGGTGCATCCCCTTCTCGGTGGACGGGCAGCCAGCACCGTCTCTGCG  947

Query 1020  CTGGCTCTTCAATGGCTCCGTGCTCAATGAGACCAGCTTCATCTTCACTGAGTTCCTGGAGCCGGCAG----CC  1089
            ||||.|.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||.|||||.|.|| |    |.
Sbjct  948  CTGGTTGTTCAACGGCTCTGTGCTCAACGAGACCAGTTTCATCTTCACTCAGTTCTTGGAGTCTGC-GCTGACT  1020

Query 1090  AATGAGACCGTGCGGCACGGGTGTCTGCGCCTCAACCAGCCCACCCACGTCAACAACGGCAACTACACGCTGCT  1163
            |||||||||.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1021  AATGAGACCATGCGGCACGGCTGCCTGCGCCTCAATCAGCCCACGCATGTCAACAACGGGAACTACACCCTGCT  1094

Query 1164  GGCTGCCAACCCCTTCGGCCAGGCCTCCGCCTCCATCATGGCTGCCTTCATGGACAACCCTTTCGAGTTCAACC  1237
            |||.||||||||||.|||||||||..||||||||.||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1095  GGCGGCCAACCCCTACGGCCAGGCTGCCGCCTCCGTCATGGCTGCTTTTATGGACAACCCTTTTGAGTTCAACC  1168

Query 1238  CCGAGGACCCCATCCCTGACACTAACAGCACATCTGGAGACCCGGTGGAGAAGAAGGACGAAACACCTTTTGGG  1311
            |.||||||||||||||||||..||||||||||||..|||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 1169  CTGAGGACCCCATCCCTGACGGTAACAGCACATCAAGAGACCCAGTGGAGAAGAAAGATGAAACCCCTTTTGGG  1242

Query 1312  GTCTCGGTGGCTGTGGGCCTGGCCGTCTTTGCCTGCCTCTTCCTTTCTACGCTGCTCCTTGTGCTCAACAAATG  1385
            |||||.||||||||||||||.|||||||.||||..|||||||||||||.|.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1243  GTCTCTGTGGCTGTGGGCCTAGCCGTCTCTGCCGCCCTCTTCCTTTCTGCCCTCCTTCTTGTGCTCAACAAATG  1316

Query 1386  TGGACGGAGAAACAAGTTTGGGATCAACCGCCCGGCTGTGCTGGCTCCAGAGGATGGGCTGGCCATGTCCCTGC  1459
            |||||.|||.|.|||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1317  TGGACAGAGGAGCAAATTTGGGATCAACCGCCCTGCTGTATTAGCTCCAGAGGATGGGCTGGCCATGTCCCTAC  1390

Query 1460  ATTTCATGACATTGGGTGGCAGCTCCCTGTCCCCCACCGAGGGCAAAGGCTCTGGGCTCCAAGGCCACATCATC  1533
            |.|||||||||.||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 1391  ACTTCATGACACTGGGTGGCAGTTCTCTTTCCCCTACTGAGGGCAAAGGCTCCGGACTCCAGGGCCACATCATG  1464

Query 1534  GAGAACCCACAATACTTCAGTGATGCCTGTGTTCACCACATCAAGCGCCGGGACATCGTGCTCAAGTGGGAGCT  1607
            |||||||||||.||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||||.|||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1465  GAGAACCCACAGTACTTCAGTGATACCTGTGTCCATCACATCAAGCGCCAGGACATCATTCTCAAGTGGGAGCT  1538

Query 1608  GGGGGAGGGCGCCTTTGGGAAGGTCTTCCTTGCTGAGTGCCACAACCTCCTGCCTGAGCAGGACAAGATGCTGG  1681
            .||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||.|||||||.|||..|||.||||||||||||||.|
Sbjct 1539  AGGGGAGGGAGCCTTTGGAAAGGTCTTTCTCGCTGAGTGCTACAACCTTCTGAATGATCAGGACAAGATGCTCG  1612

Query 1682  TGGCTGTCAAGGCACTGAAGGAGGCGTCCGAGAGTGCTCGGCAGGACTTCCAACGTGAGGCTGAGCTGCTCACC  1755
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1613  TGGCTGTCAAGGCACTGAAGGAGGCATCCGAGAATGCTCGGCAGGACTTTCAGCGTGAGGCCGAGCTGCTCACC  1686

Query 1756  ATGCTGCAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTCGGCGTCTGCACCGAGGGCCGCCCCCTGCTCATGGTCTTTGA  1829
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||..||||..||||||||||||||||
Sbjct 1687  ATGCTACAGCACCAGCACATCGTGCGCTTCTTTGGAGTCTGCACCGAGGGTGGCCCGTTGCTCATGGTCTTTGA  1760

Query 1830  GTATATGCGGCACGGGGACCTCAACCGCTTCCTCCGATCCCATGGACCTGATGCCAAGCTGCTGGCTGGTGGGG  1903
            |||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1761  GTACATGCGCCACGGGGACCTCAACCGTTTCCTCCGGTCCCACGGACCTGATGCAAAGCTGCTGGCTGGTGGTG  1834

Query 1904  AGGATGTGGCTCCAGGCCCCCTGGGTCTGGGGCAGCTGCTGGCCGTGGCTAGCCAGGTCGCTGCGGGGATGGTG  1977
            |||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.
Sbjct 1835  AGGATGTGGCTCCTGGTCCTCTGGGCCTTGGGCAGCTTCTGGCTGTGGCTAGCCAGGTGGCTGCTGGTATGGTA  1908

Query 1978  TACCTGGCGGGTCTGCATTTTGTGCACCGGGACCTGGCCACACGCAACTGTCTAGTGGGCCAGGGACTGGTGGT  2051
            ||.||.||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1909  TATCTAGCCAGCCTGCACTTTGTGCACCGGGATCTGGCCACACGCAACTGTCTGGTGGGTCAGGGACTAGTGGT  1982

Query 2052  CAAGATTGGTGATTTTGGCATGAGCAGGGATATCTACAGCACCGACTATTACCGTGTGGGAGGCCGCACCATGC  2125
            .||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 1983  GAAGATTGGAGACTTTGGCATGAGCAGAGACATCTATAGCACAGACTATTACCGAGTGGGAGGTCGGACCATGC  2056

Query 2126  TGCCCATTCGCTGGATGCCGCCCGAGAGCATCCTGTACCGTAAGTTCACCACCGAGAGCGACGTGTGGAGCTTC  2199
            |||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 2057  TGCCCATCCGCTGGATGCCACCCGAGAGCATCCTCTACCGCAAGTTCAGCACCGAGAGCGATGTGTGGAGCTTT  2130

Query 2200  GGCGTGGTGCTCTGGGAGATCTTCACCTACGGCAAGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAACACGGAGGCAATCGA  2273
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2131  GGGGTGGTGCTCTGGGAGATCTTCACCTATGGAAAGCAGCCCTGGTACCAGCTCTCCAACACTGAGGCGATCGA  2204

Query 2274  CTGCATCACGCAGGGACGTGAGTTGGAGCGGCCACGTGCCTGCCCACCAGAGGTCTACGCCATCATGCGGGGCT  2347
            .||.|||||||||||.||.|||.||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 2205  GTGTATCACGCAGGGCCGGGAGCTGGAGCGGCCGCGCGCCTGCCCTCCTGATGTCTACGCCATCATGCGAGGCT  2278

Query 2348  GCTGGCAGCGGGAGCCCCAGCAACGCCACAGCATCAAGGATGTGCACGCCCGGCTGCAAGCCCTGGCCCAGGCA  2421
            ||||||||||.||.||.||||||||||.||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.
Sbjct 2279  GCTGGCAGCGAGAACCGCAGCAACGCCTCAGCATGAAGGATGTGCACGCGCGTCTGCAGGCCCTGGCACAGGCG  2352

Query 2422  CC-TCCTGTCTACCTGGATGTCCTGGGC  2448
            || .||.|| ||||||||.||.||||||
Sbjct 2353  CCACCCAGT-TACCTGGACGTTCTGGGC  2379