Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488694
• Subject: NM_001038624.1
• Aligned Length: 1112
• Identities: 965
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGGCGTACTCCACAGTGCAGAGAGTCGCTCTGGCTTCTGGGCTTGTCCTGGCTCTGTCGCTGCTGCTGCCCAA  74
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTACTCCACGGTGCAGAGAGTGGCGCTGGCCTCGGGGCTCGTCCTGGCCGTGTCGCTGCTGCTGCCCAA  74

Query   75  GGCCTTCCTGTCCCGCGGGAAGCGGCAGGAGCCGCCGCCGACACCTGAAGGAAAATTGGGCCGATTTCCACCTA  148
            |||||||.||||.|||||||||||.|.|||||||||||||...||.|||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCTTCTTGTCTCGCGGGAAGCGACCGGAGCCGCCGCCGGGCCCGGAAGGAAAATTGGACCGATTTCCACCTA  148

Query  149  TGATGCATCATCACCAGGCACACTCAGATGGCCAGACTCCTGGGGCTCGTTTCCAGAGGTCTCACCTTGCCGAG  222
            ||||||||||.|||..|||||.|||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  TGATGCATCACCACTCGGCACCCTCAGATGGTCAGACACCAGGGGCTCGTTTCCAGAGGTCTCACCTTGCAGAG  222

Query  223  GCATTTGCAAAGGCCAAAGGATCAGGTGGAGGTGCTGGAGGAGGAGGTAGTGGAAGAGGTCTGATGGGGCAGAT  296
            ||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  223  GCCTTTGCAAAGGCCAAGGGAGCAGGTGGAGGTGCTGGAGGAGGGGGTAGTGGAAGAGGACTGATGGGCCAGAT  296

Query  297  TATTCCAATCTACGGTTTTGGGATTTTTTTATATATACTGTACATTCTATTTAAGCTCTCAAAGGGGAAAACAA  370
            .|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||   ||
Sbjct  297  CATTCCAATCTATGGCTTTGGGATCTTTTTGTACATACTGTACATTTTGTTTAAGCTTTCAAAGGGGAA---AA  367

Query  371  CTGCAGAGGATGGGAAATGCTATACTGCCATGCCTGGAAACACCCACAGGAAAATTACCAGTTTTGAGCTTGCT  444
            |||||||||||.||||.||||..||||||...|||||||||.||||||||||.|||||||..||||||||||.|
Sbjct  368  CTGCAGAGGATCGGAACTGCTCCACTGCCCCACCTGGAAACGCCCACAGGAAGATTACCAACTTTGAGCTTGTT  441

Query  445  CAACTGCAAGAAAAACTGAAGGAGACAGAAGCAGCCATGGAAAAATTATTCAACAGAGTGGGACCTAATGGTGA  518
            |||||.|||||||||||.||.||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  442  CAACTACAAGAAAAACTAAAAGAGACAGAAGAAGCCATGGAAAAATTAATCAACAGAGTTGGACCTAATGGTGA  515

Query  519  G---AGAGCACAGACTGTGACTTCTGACCAAGAGAAACGGTTGCTACATCAGCTCCGAGAAATCACCAGGGTCA  589
            |   |||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  GAGCAGAGCACAGGCTGTGACTTCTGACCAAGAGAAACGATTACTGCATCAGCTCCGAGAAATCACCAGGGTCA  589

Query  590  TGAAAGAAGGAAAATTCATTGACAGATTTTCTCCAGAGAAAGAAGCTGAGGAGGCCCCTTACATGGAGGACTGG  663
            ||||||||||.||.|||||.||||.|   |||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  590  TGAAAGAAGGCAAGTTCATCGACACA---TCTCCAGAGAAGGAAGCTGAGGAAGCCCCATACATGGAGGACTGG  660

Query  664  GAAGGTTACCCTGAAGAGACTTACCCAATTTATGACCTTTCAGACTGTATCAAGCGTAGGCAAGAAACAATCTT  737
            |||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||..||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  661  GAAGGTTACCCAGAAGAGACTTATCCAATATATGACCTTTCGGATGGTATCAAGCGTAGGCAAGAAACAATCCT  734

Query  738  GGTGGATTACCCTGACCCAAAAGAACTTTTCTGCTGAAGAAATAGCTGAAAGAATGGGAATGATAGAAGAGGAA  811
            |||||||||||||||||.||||||.| ..||||||||||||||.||||||..|||||||..|||||||||||||
Sbjct  735  GGTGGATTACCCTGACCTAAAAGAGC-CCTCTGCTGAAGAAATTGCTGAACAAATGGGAGAGATAGAAGAGGAA  807

Query  812  GAATCAGATCATTTGGGTTGGGAAAGTCTGCCCACTGACCCCAGAGCCCAGGAAGATAATTCTGTTACCTCGTG  885
            |.||||||.|.||||.|.|||||...|.|||||||||||||..||||||||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct  808  GGATCAGAGCGTTTGAGCTGGGATCATTTGCCCACTGACCCTGGAGCCCAGAAAGATAATTCTGTTGCCCCGTG  881

Query  886  TGATCCAAAGCCAGAAACATGTTCCTGCTGTTTTCATGAAGACGAGGATCCTGCTGTCTTGGCAGAGAATGCTG  959
            ||||||.||.||||||.||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  882  TGATCCCAAACCAGAATCATGCTCCTGCTGTGTTCATGAAGAGGAGGATCCTGCTGTCTTGGCAGAGAATGCTG  955

Query  960  GATTCAGTGCAGATAGCTACCCTGAGCAAGAGGAAACCACCAAAGAAGAGTGGTCCCAAGACTTTAAAGATGAA  1033
            |.||||||||||||.|||||..|||||||||||||.|||||||.|||.|.|.|.||||.|||||||.|.|||||
Sbjct  956  GTTTCAGTGCAGATGGCTACAGTGAGCAAGAGGAAGCCACCAAGGAAAACTTGCCCCAGGACTTTACAAATGAA  1029

Query 1034  GGGTTGGGCATCAGCACCGATAAAGCATATACA----GGCAGCATGCTGAGGAAGCGTAACCCCCAGGGTTTAG  1103
            |||.||||..|||||||.|||||.||    |||    ||..|.|||.||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1030  GGGCTGGGAGTCAGCACTGATAATGC----ACACGTGGGTGGTATGTTGAGGAAGCGCAACCCCCAGGGTTTTG  1099

Query 1104  AG  1105
            ||
Sbjct 1100  AG  1101