Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000488694
• Subject: NM_001346693.2
• Aligned Length: 1192
• Identities: 955
• Gaps: 235

Alignment

Query    1  ATGGCGTACTCCACAGTGCAGAGAGTCGCTCTGGCTTCTGGGCTTGTCCTGGCTCTGTCGCTGCTGCTGCCCAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGCCTTCCTGTCCCGCGGGAAGCGGCAGGAGCCGCCGCCGACACCTGAAGGAAAATTGGGCCGATTTCCACCTA  148
                                                                                     |
Sbjct    1  -------------------------------------------------------------------------A  1

Query  149  TGATGCATCATCACCAGGCACACTCAGATGGCCAGACTCCTGGGGCTCGTTTCCAGAGGTCTCACCTTGCCGAG  222
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    2  TGATGCATCATCACCAGGCACCCTCAGATGGCCAGACTCCTGGGGCTCGTTTCCAGAGGTCTCACCTTGCCGAG  75

Query  223  GCATTTGCAAAGGCCAAAGGATCAGGTGGAGGTGCTGGAGGAGGAGGTAGTGGAAGAGGTCTGATGGGGCAGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   76  GCATTTGCAAAGGCCAAAGGATCAGGTGGAGGTGCTGGAGGAGGAGGTAGTGGAAGAGGTCTGATGGGGCAGAT  149

Query  297  TATTCCAATCTACGGTTTTGGGATTTTTTTATATATACTGTACATTCTATTTAAGCTCTCAAAGGGGAAAACAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  150  TATTCCAATCTACGGTTTTGGGATTTTTTTATATATACTGTACATTCTATTTAAGCTCTCAAAGGGGAAAACAA  223

Query  371  CTGCAGAGGATGGGAAATGCTATACTGCCATGCCTGGAAACACCCACAGGAAAATTACCAGTTTTGAGCTTGCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  224  CTGCAGAGGATGGGAAATGCTATACTGCCATGCCTGGAAACACCCACAGGAAAATTACCAGTTTTGAGCTTGCT  297

Query  445  CAACTGCAAGAAAAACTGAAGGAGACAGAAGCAGCCATGGAAAAATTATTCAACAGAGTGGGACCTAATGGTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  298  CAACTGCAAGAAAAACTGAAGGAGACAGAAGCAGCCATGGAAAAATTAATCAACAGAGTGGGACCTAATGGTGA  371

Query  519  G-------------------------------------------------------------------------  519
            |                                                                         
Sbjct  372  GAGTACCCAGACAGACCATAGTGATGTTTACGTCCATTGCCTAGGAGTATTTACCACTAAATGGTTGGATTGTC  445

Query  520  --------------AGAGCACAGACTGTGACTTCTGACCAAGAGAAACGGTTGCTACATCAGCTCCGAGAAATC  579
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  446  TGATATTTCTAAGCAGAGCACAGACTGTGACTTCTGACCAAGAGAAACGGTTGCTACATCAGCTCCGAGAAATC  519

Query  580  ACCAGGGTCATGAAAGAAGGAAAATTCATTGACAGATTTTCTCCAGAGAAAGAAGCTGAGGAGGCCCCTTACAT  653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  520  ACCAGGGTCATGAAAGAAGGAAAATTCATTGACAGATTTTCTCCAGAGAAAGAAGCTGAGGAGGCCCCTTACAT  593

Query  654  GGAGGACTGGGAAGGTTACCCTGAAGAGACTTACCCAATTTATGACCTTTCAGACTGTATCAAGCGTAGGCAAG  727
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  594  GGAGGACTGGGAAGGTTACCCTGAAGAGACTTACCCAATTTATGACCTTTCAGACTGTATCAAGCGTAGGCAAG  667

Query  728  AAACAATCTTGGTGGATTACCCTGACCCAAAAGAACTTTTCTGCTGAAGAAATAGCTGAAAGAATGGGAATGAT  801
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  668  AAACAATCTTGGTGGATTACCCTGACCCAAAAGAAC-TTTCTGCTGAAGAAATAGCTGAAAGAATGGGAATGAT  740

Query  802  AGAAGAGGAAGAATCAGATCATTTGGGTTGGGAAAGTCTGCCCACTGACCCCAGAGCCCAGGAAGATAATTCTG  875
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAAGAGGAAGAATCAGATCATTTGGGTTGGGAAAGTCTGCCCACTGACCCCAGAGCCCAGGAAGATAATTCTG  814

Query  876  TTACCTCGTGTGATCCAAAGCCAGAAACATGTTCCTGCTGTTTTCATGAAGACGAGGATCCTGCTGTCTTGGCA  949
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTACCTCGTGTGATCCAAAGCCAGAAACATGTTCCTGCTGTTTTCATGAAGACGAGGATCCTGCTGTCTTGGCA  888

Query  950  GAGAATGCTGGATTCAGTGCAGATAGCTACCCTGAGCAAGAGGAAACCACCAAAGAAGAGTGGTCCCAAGACTT  1023
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGAATGCTGGATTCAGTGCAGATAGCTACCCTGAGCAAGAGGAAACCACCAAAGAAGAGTGGTCCCAAGACTT  962

Query 1024  TAAAGATGAAGGGTTGGGCATCAGCACCGATAAAGCATATACAGGCAGCATGCTGAGGAAGCGTAACCCCCAGG  1097
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAAAGATGAAGGGTTGGGCATCAGCACCGATAAAGCATATACAGGCAGCATGCTGAGGAAGCGTAACCCCCAGG  1036

Query 1098  GTTTAGAG  1105
            ||||||||
Sbjct 1037  GTTTAGAG  1044