Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489026
• Subject: NM_028198.3
• Aligned Length: 3615
• Identities: 3130
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGGCGATGGATCAAGTAAACGCGCTGTGCGAGCAGCTGGTGAAAGCGGTGACGGTCATGATGGACCCCAACTC  74
            ||||.||||||.|||||.|||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct    1  ATGGAGATGGAGCAAGTGAACGCGCTGTGCGAGGAGCTAGTGAAAGCGGTGACGGTCATGATGGACCCCAGCTC  74

Query   75  CACCCAGCGCTACCGGCTGGAAGCCCTCAAGTTTTGTGAGGAGTTTAAAGAAAAGTGTCCTATCTGTGTCCCCT  148
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|
Sbjct   75  TACCCAGCGCTACCGGCTGGAAGCCCTCAAGTTTTGTGAAGAGTTTAAAGAAAAATGCCCTATCTGTGTTCCAT  148

Query  149  GTGGCTTGAGGTTGGCTGAGAAAACACAAGTTGCCATCGTCAGACATTTTGGCCTTCAGATCCTGGAACACGTT  222
            |||||||||.|||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  149  GTGGCTTGAAGTTGGCTGAAAAAACACAAATTGCCATCGTCAGACATTTTGGCCTTCAGATCCTGGAGCATGTT  222

Query  223  GTCAAGTTTCGGTGGAACGGCATGTCTCGATTGGAGAAGGTGTATCTGAAGAACAGTGTCATGGAGCTGATTGC  296
            |||||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  GTCAAGTTTCGATGGAACAGCATGTCCCGATTGGAGAAGGTCTATCTGAAGAACAGTGTCATGGAGCTGATCGC  296

Query  297  AAATGGAACATTGAACATTTTGGAAGAGGAGAACCATATTAAAGATGCTCTGTCTCGAATTGTAGTGGAAATGA  370
            ||||||||||.|||..||||||||.|||||||||||.||||||||||.|||||||.|||||||.||.||.||||
Sbjct  297  AAATGGAACACTGAGGATTTTGGAGGAGGAGAACCACATTAAAGATGTTCTGTCTAGAATTGTGGTAGAGATGA  370

Query  371  TCAAGCGAGAGTGGCCACAGCATTGGCCTGACATGCTAATAGAATTGGACACTCTTTCCAAACAAGGGGAAACA  444
            ||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|.||..|||||||||||.
Sbjct  371  TCAAACGAGAGTGGCCACAGCACTGGCCTGACATGCTCATGGAGTTGGATACTCTCTTCAGGCAAGGGGAAACG  444

Query  445  CAGACAGAATTGGTGATGTTTATCCTTTTGCGACTGGCAGAGGATGTAGTGACTTTTCAGACACTTCCCCCTCA  518
            ||||..||.|||||||||||.||||||.|.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||.||||
Sbjct  445  CAGAGGGAGTTGGTGATGTTCATCCTTCTCCGACTGGCCGAGGATGTAGTGACCTTTCAGACGCTCCCCACTCA  518

Query  519  AAGAAGAAGGGACATCCAGCAAACATTAACCCAGAACATGGAAAGGATCTTCAGTTTTCTGCTTAACACACTTC  592
            ||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|.||||||.||.||.||.||||
Sbjct  519  AAGAAGAAGGGATATTCAGCAAACATTGACGCAGAACATGGAAAGAATCTTGAATTTTCTACTCAATACGCTTC  592

Query  593  AAGAAAATGTAAACAAGTATCAGCAAGTGAAGACAGATACTTCTCAGGAGTCAAAGGCGCAAGCAAACTGTCGA  666
            |.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||.|.|||||||||.||.||||.|||||.|||||||||
Sbjct  593  AGGAAAATGTAAACAAGTACCAACAAATGAAGACAGATTCATCTCAGGAGGCAGAGGCTCAAGCCAACTGTCGA  666

Query  667  GTAGGAGTTGCAGCACTGAATACTCTAGCAGGCTATATTGACTGGGTGTCTATGAGTCACATCACTGCTGAAAA  740
            |||.|.||.||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|||..||.||||||||.||.||
Sbjct  667  GTAAGCGTGGCGGCCCTGAACACTCTAGCCGGCTACATTGACTGGGTATCTTTGAACCATATCACTGCCGAGAA  740

Query  741  CTGTAAACTCCTGGAGATACTGTGTTTGCTGTTGAATGAACAGGAACTTCAGTTGGGAGCCGCTGAGTGTCTTC  814
            ||||||||||.||||||..|||||..||||..|.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  741  CTGTAAACTCGTGGAGACTCTGTGCCTGCTTCTCAATGAGCAGGAGCTGCAGTTGGGAGCCGCCGAGTGTCTGC  814

Query  815  TCATTGCAGTCAGCAGAAAAGGCAAGTTGGAAGACCGGAAGCCCTTGATGGTCTTATTTGGAGATGTTGCCATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||.|||||||.||.|.|||||||||||.||||||
Sbjct  815  TCATTGCAGTCAGCAGAAAAGGCAAGCTGGAGGACCGGAAGCGCTTGATGATCCTGTTTGGAGATGTCGCCATG  888

Query  889  CATTATATACTCTCCGCCGCACAGACTGCTGATGGAGGAGGTTTGGTAGAAAAACACTACGTCTTTCTGAAGAG  962
            ||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||.||||.||||||||
Sbjct  889  CATTATATTCTCTCGGCCGCACAGACTGCAGATGGAGGAGGCTTGGTCGAAAAACACTACCTCTTCCTGAAGAG  962

Query  963  GCTCTGTCAGGTGTTGTGTGCGCTGGGCAATCAGCTGTGTGCATTGCTGGGTGCAGATTCTGATGTAGAAACAC  1036
            .||.|||||||||||.|||||.|||||.||||.|||.||||||.||||||....||||.||.|..||.||||||
Sbjct  963  ACTTTGTCAGGTGTTATGTGCACTGGGAAATCTGCTATGTGCACTGCTGGCCTTAGATGCTAACATACAAACAC  1036

Query 1037  C-ATCAAACTTTGGAAAATACCTGGAATCTTTTCTTGCTTTCACAACCCATCCAAGTCAGTTTCTACGCTCTTC  1109
            | || |||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1037  CTAT-AAACTTTGGAATGTACCTGGAATCTTTTCTTGCTTTCACAACCCATCCAAGTCAGTTTTTACGCTCTTC  1109

Query 1110  AACTCAGATGACTTGGGGAGCCCTCTTCAGGCATGAAATCCTGTCCCGTGATCCTTTGCTATTAGCAATAATAC  1183
            |||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||....||.||||||.||||||
Sbjct 1110  AACCCATATGACGTGGGGAGCCCTCTTCAGGCATGAAGTTCTGTCCCGTGATCCGGCACTGTTAGCAGTAATAC  1183

Query 1184  CAAAATATCTTCGTGCTTCCATGACTAACTTGGTCAAGATGGGCTTTCCTTCTAAAACAGACAGCCCTAGCTGT  1257
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1184  CAAAATATCTTCGTGCTTCTATGACAAACTTGGTCAAGATGGGCTTTCCTTCTAAAACAGATAGCCCCAGCTGT  1257

Query 1258  GAATATTCTCGGTTTGATTTTGATAGCGATGAGGACTTCAATGCTTTCTTCAACTCCTCCCGAGCACAACAAGG  1331
            ||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1258  GAATATTCCCGATTTGATTTCGATAGTGATGAGGACTTCAATGCTTTCTTCAACTCCTCCCGAGCCCAGCATGG  1331

Query 1332  AGAGGTGATGAGGTTGGCATGTCGTTTGGATCCCAAAACTAGCTTCCAGATGGCTGGGGAGTGGCTAAAGTATC  1405
            |||||||.||||||..|..|||||..|||||||.||.|||||||||||||||||.|..||.|||||.|||||||
Sbjct 1332  AGAGGTGGTGAGGTGTGTGTGTCGACTGGATCCTAAGACTAGCTTCCAGATGGCGGCAGAATGGCTCAAGTATC  1405

Query 1406  AACTATCAACTTTTCTTGATGCTGGTTCTGTGAATTCTTGTTCTGCAGTTGGAACTGGAGAAGGAAGCCTCTGT  1479
            |.||.|||.|||.|.||||..||||..|||||||.||.||||||.|||.||||||||||||.|||.||.||||.
Sbjct 1406  AGCTGTCAGCTTCTATTGACACTGGACCTGTGAACTCATGTTCTACAGCTGGAACTGGAGAGGGAGGCTTCTGC  1479

Query 1480  TCCGTCTTCTCACCTTCATTCGTGCAGTGGGAAGCCATGACTCTTTTTTTGGAAAGTGTTATCACCCAGATGTT  1553
            |||.|||||||||||||||..||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||.|||||||||
Sbjct 1480  TCCATCTTCTCACCTTCATATGTGCAGTGGGAAGCTATGACTTTTTTTTTGGAAAGTGTGATCAACCAGATGTT  1553

Query 1554  TCGAACACTAAATAGAGAAGAAATTCCTGTTAATGATGGAATAGAGCTATTGCAGATGGTTCTGAACTTTGATA  1627
            ||||||||||.|.|.||||||..|.||.||||.||||||.||||||||..|||||.||||..||||||||||.|
Sbjct 1554  TCGAACACTAGACAAAGAAGAGCTCCCGGTTAGTGATGGGATAGAGCTGCTGCAGCTGGTGTTGAACTTTGAAA  1627

Query 1628  CCAAGGATCCCCTCATCCTGTCCTGCGTCCTTACTAATGTCTCTGCACTCTTTCCATTTGTCACCTACAGACCA  1701
            .|||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||..||.
Sbjct 1628  TCAAGGATCCCCTCGTCCTGTCCTGCGTCCTCACTAATGTCTCAGCGCTCTTCCCATTTGTCACATACAAGCCT  1701

Query 1702  GAGTTCCTGCCCCAGGTCTTCTCTAAGCTATTTTCATCTGTCACTTTTGAAACTGTTGAAGAAAGTAAGGCCCC  1775
            |.||||.||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|||||||||.||||||..||||||||||||||
Sbjct 1702  GCGTTCTTGCCCCAGGTCTTCTCTAAGCTCTTTTCATTTGTTACTTTTGAATCTGTTGGGGAAAGTAAGGCCCC  1775

Query 1776  CAGAACCCGGGCAGTGAGGAATGTGAGGAGGCATGCTTGTTCCTCCATCATCAAGATGTGTCGTGACTACCCCC  1849
            |||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||..
Sbjct 1776  CAGGACTCGGGCAGTCAGGAATGTAAGGAGACATGCTTGTTCCTCCATCAACAAGATGTGTCGGGACTACCCAG  1849

Query 1850  AGCTTGTGCTGCCCAATTTTGACATGCTTTATAACCATGTGAAGCAACTCCTCTCCAATGAGCTACTCCTGACA  1923
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1850  ACCTTGTTCTGCCCAATTTTGACATGCTTTATAGCCACGTGAAGCAACTCCTCTCCAATGAGCTCCTCCTGACC  1923

Query 1924  CAAATGGAGAAGTGTGCCCTCATGGAAGCCCTGGTTCTCATTAGCAACCAATTTAAGAACTACGAGCGTCAGAA  1997
            ||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.|||.|.||.|||||.|||||
Sbjct 1924  CAGATGGAGAAGTGCGCCCTCATGGAAGCTCTGGTTCTCGTTAGCAACCAATTCAAGGATTATGAGCGGCAGAA  1997

Query 1998  GGTGTTCCTAGAGGAGCTGATGGCACCAGTGGCCAGCATCTGGCTTTCTCAAGACATGCACAGAGTGCTGTCAG  2071
            |.|.|||||||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||||.||||.|||..|||||.||||||||
Sbjct 1998  GTTATTCCTAGAGGAGCTGATGGCACCGGTGGTCAACATCTGGCTTTCTGAAGAAATGTGCAGAGCGCTGTCAG  2071

Query 2072  ATGTTGATGCTTTCATTGCGTATGTGGGTACAGATCAGAAGAGCTGTGACCCAGGCCTGGAGGATCCGTGTGGC  2145
            ||.||||..|.||||||||.|||||||||.|.||||.|||.|||||||||||||...||||||||||.||||||
Sbjct 2072  ATATTGACTCCTTCATTGCCTATGTGGGTGCTGATCTGAAAAGCTGTGACCCAGCTGTGGAGGATCCATGTGGC  2145

Query 2146  TTAAACCGTGCACGAATGAGCTTTTGTGTATACAGCATTCTGGGTGTGGTGAAACGAACTTGCTGGCCCACTGA  2219
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||..|||.|||.|||.|||||||..|.||
Sbjct 2146  TTGAACCGTGCACGAATGAGCTTTTGTGTGTACAGCATCCTGGGGGTTATGAGACGCACTAGCTGGCCTTCCGA  2219

Query 2220  CCTAGAAGAGGCCAAAGCTGGGGGATTTGTGGTGGGTTATACATCCAGTGGAAATCCAATCTTCCGTAACCCCT  2293
            |||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2220  CCTAGAAGAAGCCAAAGCTGGGGGCTTTGTGGTGGGCTACACACCCAGTGGAAATCCCATCTTCCGTAACCCCT  2293

Query 2294  GCACAGAGCAGATTCTGAAACTTCTTGACAATTTGCTTGCGCTTATAAGAACCCACAATACATTATATGCACCA  2367
            |||||||||||||.||.|.||||||.||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||.||||||.||||.
Sbjct 2294  GCACAGAGCAGATCCTCAGACTTCTCGACAATTTGCTTGCCCTTGTAAGAACTCACAATACTTTATATACACCG  2367

Query 2368  GAAATGCTAGCCAAAATGGCAGAGCCTTTCACCAAGGCTCTGGATATGCTTGACGCGGAAAAATCTGCTATATT  2441
            |||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||..|.||||||.|.||.|||||
Sbjct 2368  GAAATGCTAACGAAAATGGCAGAACCTTTCACCAAGGCTCTGGATATAGTTGAATCTGAAAAAACGGCAATATT  2441

Query 2442  AGGATTACCTCAACCTCTCTTGGAACTCAATGACTCTCCTGTCTTCAAAACCGTCT-TGGAAAGAATGCAGCGT  2514
            ||||||||||||.||||||||||||.||||.|||...|||||||..|.|||| .|| ||||.||.||||||||.
Sbjct 2442  AGGATTACCTCAGCCTCTCTTGGAATTCAACGACCACCCTGTCTATAGAACC-ACTCTGGAGAGGATGCAGCGG  2514

Query 2515  TTCTTCTCTACCCTCTATGAAAACTGTTTTCATATCCTAGGGAAGGCAGGCCCTTCCATGCAGCAAGACTTCTA  2588
            |||||....|..||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2515  TTCTTTGGCATTCTCTATGAAAACTGTTACCATATCCTAGGGAAGGCAGGCCCTTCCATGCAGCAAGATTTCTA  2588

Query 2589  TACTGTGGAGGACCTTGCTACCCAGCTTCTCAGCTCAGCCTTTGTCAACTTGAACAATATTCCTGACTACCGAC  2662
            .||||||||||||||||||.|||||||.||..|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||.|||.|
Sbjct 2589  CACTGTGGAGGACCTTGCTTCCCAGCTCCTTGGATCAGCTTTCGTCAACTTGAACAATATTCCTGACTTCCGGC  2662

Query 2663  TCAGACCCATGCTTCGTGTCTTTGTAAAGCCTCTGGTGCTCTTCTGTCCCCCAGAGCACTATGAAGCCCTGGTA  2736
            |.|||.|.||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||.||||.|||||||||.|||||.||
Sbjct 2663  TTAGATCTATGCTTCGTGTCTTCGTGAAGCCCCTCGTGCTCTTCTGCCCCTCAGAACACTATGAAACCCTGATA  2736

Query 2737  TCCCCCATCCTCGGACCTCTTTTCACCTACCTCCATATGAGGCTTTCTCAGAAATGGCAAGTTATCAACCAAAG  2810
            ||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 2737  TCTCCCATCCTTGGACCTCTCTTCACCTACCTCCACATGAGGCTCTCTCAGAAGTGGCATGTCATCAACCAGAG  2810

Query 2811  GAGCCTGCTGTGTGGAGAAGATGAGGCTGCAGATGAAAACCCAGAGTCTCAAGAGATGCTGGAGGAGCAACTGG  2884
            ||||.|.||||||||||||||||||..||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct 2811  GAGCATCCTGTGTGGAGAAGATGAGATTGCAGAGGACAACCCCGAGTCTCAGGAAATGCTCGAGGAACAGCTGG  2884

Query 2885  TGAGGATGTTAACCCGAGAAGTCATGGACCTAATCACGGTTTGCTGTGTTTCAAAGAAGGGTGCTGACCACAGT  2958
            ||||||||.|.||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||.||.||||||..|||.||||||| .
Sbjct 2885  TGAGGATGCTCACCCGAGAAGCCATGGACCTAATCATGGCTTGCTGTGTGTCGAAGAAGACTGCCGACCACA-C  2957

Query 2959  AG-TGCTCCCCCAGCAGATGGAGACGATGAAGAAATGATGGCCACAGAGGTCACCCCCTCAGCTATGGCAGAGC  3031
            || .||||||.|.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||..|||||||..||.|||..||||
Sbjct 2958  AGCCGCTCCCACTGCAGATGGAGATGATGAAGAGATGATGGCCACTGAAGTAGCCCCCTCGTCTGTGGTGGAGC  3031

Query 3032  TTACAGACCTGGGCAAATGTCTGATGAAGCATGAGGATGTTTGTACAGCGCTATTAATTACAGCCTTCAATTCC  3105
            |.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.||..||||.|||||.||.|||||.
Sbjct 3032  TCACAGACCTGGGCAAATGCCTCATGAAGCACGAGGATGTCTGCACAGCACTGCTAATCACAGCATTTAATTCT  3105

Query 3106  CTGGCCTGGAAAGATACTCTGTCCTGCCAGAGGACAACCTCACAGCTCTGCTGGCCTCTCCTCAAACAAGTGCT  3179
            |||.|||||||.||.||.|||||.|||||||||.|.|||.||||||||||||||||.|||||||||||.|||.|
Sbjct 3106  CTGACCTGGAAGGACACACTGTCTTGCCAGAGGGCTACCACACAGCTCTGCTGGCCCCTCCTCAAACAGGTGAT  3179

Query 3180  GTCAGGGACACTGCTCGCAGATGCAGTTACGTGGCTTTTCACCAGTGTGCTGAAAGGCTTACAGATGCACGGGC  3253
            |||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||
Sbjct 3180  GTCTGGGACCCTGCTCGCAGACGCTGTCACTTGGCTTTTCACCAGTGTGCTGAAAGGACTGCAGATGCACGGGC  3253

Query 3254  AGCACGACGGGTGCATGGCTTCCCTGGTCCATCTGGCCTTCCAGATATATGAGGCACTGCGCCCCAGGTACCTG  3327
            |||||||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 3254  AGCACGATGGGTGCATGGCTTCCCTGGTCCACTTGGCCTTCCAGATATACGAGGCGCTGCGCCCCAGGTACCTA  3327

Query 3328  GAGATAAGAGCTGTAATGGAGCAAATCCCTGAAATACAGAAGGACTCACTGGACCAGTTTGACTGCAAGCTTTT  3401
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 3328  GAGATAAGAGCAGTAATGGAGCAGATCCCTGAAATAAACAAGGAGTCTCTGGACCAATTTGACTGCAAGCTTTT  3401

Query 3402  AAACCCCTCCCTGCAGAAAGTGGCTGACAAGCGCCGAAAGGACCAATTCAAACGCCTCATTGCTGGTTGCATTG  3475
            ||||||||||||.||.||||..|||||.||.||.||.||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||||
Sbjct 3402  AAACCCCTCCCTTCAAAAAGCAGCTGATAAACGACGGAAGGACCACTTCAAACGTCTAATCGCTGGCTGCATTG  3475

Query 3476  GGAAACCCTTGGGAGAGCAGTTCCGAAAAGAAGTTCACATTAAGAATCTTCCCTCACTTTTCAAAAAAACAAAG  3549
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..||||||||||||.|.||.
Sbjct 3476  GGAAACCCTTGGGAGAACAGTTCCGAAAAGAAGTTCACATTAAGAACCTTCCCTGGCTTTTCAAAAAACCCAAA  3549

Query 3550  CCAATGCTGGAGACGGAGGTGCTGGACAATGATGGGGGTGGCCTGGCCACCATCTTTGAACCC  3612
            ||||||.|||||||.||.||||||||||.|||.|.||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 3550  CCAATGTTGGAGACAGAAGTGCTGGACAGTGAGGAGGGTGGACTGGCCACCATCTTTGAACCC  3612