Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489052
• Subject: XM_006718317.4
• Aligned Length: 1191
• Identities: 1104
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  ATGGCGTACTCCACAGTGCAGAGAGTCGCTCTGGCTTCTGGGCTTGTCCTGGCTCTGTCGCTGCTGCTGCCCAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTACTCCACAGTGCAGAGAGTCGCTCTGGCTTCTGGGCTTGTCCTGGCTCTGTCGCTGCTGCTGCCCAA  74

Query   75  GGCCTTCCTGTCCCGCGGGAAGCGGCAGGAGCCGCCGCCGACACCTGAAGGAAAATTGGGCCGATTTCCACCTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCTTCCTGTCCCGCGGGAAGCGGCAGGAGCCGCCGCCGACACCTGAAGGAAAATTGGGCCGATTTCCACCTA  148

Query  149  TGATGCATCATCACCAGGCACCCTCAGATGGCCAGACTCCTGGGGCTCGTTTCCAGAGGTCTCACCTTGCCGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGATGCATCATCACCAGGCACCCTCAGATGGCCAGACTCCTGGGGCTCGTTTCCAGAGGTCTCACCTTGCCGAG  222

Query  223  GCATTTGCAAAGGCCAAAGGATCAGGTGGAGGTGCTGGAGGAGGAGGTAGTGGAAGAGGTCTGATGGGGCAGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCATTTGCAAAGGCCAAAGGATCAGGTGGAGGTGCTGGAGGAGGAGGTAGTGGAAGAGGTCTGATGGGGCAGAT  296

Query  297  TATTCCAATCTACGGTTTTGGGATTTTTTTATATATACTGTACATTCTATTTAAGCTCTCAAAGGGGAAAACAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TATTCCAATCTACGGTTTTGGGATTTTTTTATATATACTGTACATTCTATTTAAGCTCTCAAAGGGGAAAACAA  370

Query  371  CTGCAGAGGATGGGAAATGCTATACTGCCATGCCTGGAAACACCCACAGGAAAATTACCAGTTTTGAGCTTGCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGCAGAGGATGGGAAATGCTATACTGCCATGCCTGGAAACACCCACAGGAAAATTACCAGTTTTGAGCTTGCT  444

Query  445  CAACTGCAAGAAAAACTGAAGGAGACAGAAGCAGCCATGGAAAAATTAATCAACAGAGTGGGACCTAATGGTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAACTGCAAGAAAAACTGAAGGAGACAGAAGCAGCCATGGAAAAATTAATCAACAGAGTGGGACCTAATGGTGA  518

Query  519  G-------------------------------------------------------------------------  519
            |                                                                         
Sbjct  519  GAGTACCCAGACAGACCATAGTGATGTTTACGTCCATTGCCTAGGAGTATTTACCACTAAATGGTTGGATTGTC  592

Query  520  --------------AGAGCACAGACTGTGACTTCTGACCAAGAGAAACGGTTGCTACATCAGCTCCGAGAAATC  579
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGATATTTCTAAGCAGAGCACAGACTGTGACTTCTGACCAAGAGAAACGGTTGCTACATCAGCTCCGAGAAATC  666

Query  580  ACCAGGGTCATGAAAGAAGGAAAATTCATTGACAGATTTTCTCCAGAGAAAGAAGCTGAGGAGGCCCCTTACAT  653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACCAGGGTCATGAAAGAAGGAAAATTCATTGACAGATTTTCTCCAGAGAAAGAAGCTGAGGAGGCCCCTTACAT  740

Query  654  GGAGGACTGGGAAGGTTACCCTGAAGAGACTTACCCAATTTATGACCTTTCAGACTGTATCAAGCGTAGGCAAG  727
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAGGACTGGGAAGGTTACCCTGAAGAGACTTACCCAATTTATGACCTTTCAGACTGTATCAAGCGTAGGCAAG  814

Query  728  AAACAATCTTGGTGGATTACCCTGACCCAAAAGAACTTTCTGCTGAAGAAATAGCTGAAAGAATGGGAATGATA  801
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAACAATCTTGGTGGATTACCCTGACCCAAAAGAACTTTCTGCTGAAGAAATAGCTGAAAGAATGGGAATGATA  888

Query  802  GAAGAGGAAGAATCAGATCATTTGGGTTGGGAAAGTCTGCCCACTGACCCCAGAGCCCAGGAAGATAATTCTGT  875
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAGAGGAAGAATCAGATCATTTGGGTTGGGAAAGTCTGCCCACTGACCCCAGAGCCCAGGAAGATAATTCTGT  962

Query  876  TACCTCGTGTGATCCAAAGCCAGAAACATGTTCCTGCTGTTTTCATGAAGACGAGGATCCTGCTGTCTTGGCAG  949
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TACCTCGTGTGATCCAAAGCCAGAAACATGTTCCTGCTGTTTTCATGAAGACGAGGATCCTGCTGTCTTGGCAG  1036

Query  950  AGAATGCTGGATTCAGTGCAGATAGCTACCCTGAGCAAGAGGAAACCACCAAAGAAGAGTGGTCCCAAGACTTT  1023
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAATGCTGGATTCAGTGCAGATAGCTACCCTGAGCAAGAGGAAACCACCAAAGAAGAGTGGTCCCAAGACTTT  1110

Query 1024  AAAGATGAAGGGTTGGGCATCAGCACCGATAAAGCATATACAGGCAGCATGCTGAGGAAGCGTAACCCCCAGGG  1097
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGATGAAGGGTTGGGCATCAGCACCGATAAAGCATATACAGGCAGCATGCTGAGGAAGCGTAACCCCCAGGG  1184

Query 1098  TTTAGAG  1104
            |||||||
Sbjct 1185  TTTAGAG  1191