Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489060
- Subject:
- NM_001281749.3
- Aligned Length:
- 4113
- Identities:
- 3607
- Gaps:
- 504
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGCGGCGGCGGCGAGCGGAGCTGGCGGGGCTGCCGGGGCCGGGACTGGGGGAGCCGGGCCCGCGGGCCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCTGCTGCCTCCGCCCGCGCCGGGGTCCCCAGCCGCCCCCGCTGCCGTGTCCCCTGCGGCCGGCCAGCCGCGTC 148
Query 1 --------------------------ATGCCCGCCCGTATCGGCTACTACGAGATCGACCGCACCATCGGCAAG 48
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCCCAGCCCCGGCCTCCCGCGGACCCATGCCCGCCCGTATCGGCTACTACGAGATCGACCGCACCATCGGCAAG 222
Query 49 GGCAACTTCGCGGTGGTCAAGCGGGCCACGCACCTCGTCACCAAGGCCAAGGTTGCTATCAAGATCATAGATAA 122
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGCAACTTCGCGGTGGTCAAGCGGGCCACGCACCTCGTCACCAAGGCCAAGGTTGCTATCAAGATCATAGATAA 296
Query 123 GACCCAGCTGGATGAAGAAAACTTGAAGAAGATTTTCCGGGAAGTTCAAATTATGAAGATGCTTTGCCACCCCC 196
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GACCCAGCTGGATGAAGAAAACTTGAAGAAGATTTTCCGGGAAGTTCAAATTATGAAGATGCTTTGCCACCCCC 370
Query 197 ATATCATCAGGCTCTACCAGGTTATGGAGACAGAACGGATGATTTATCTGGTGACAGAATATGCTAGTGGAGGG 270
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATATCATCAGGCTCTACCAGGTTATGGAGACAGAACGGATGATTTATCTGGTGACAGAATATGCTAGTGGAGGG 444
Query 271 GAAATATTTGACCACCTGGTGGCCCATGGTAGAATGGCAGAAAAGGAGGCACGTCGGAAGTTCAAACAGATCGT 344
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAATATTTGACCACCTGGTGGCCCATGGTAGAATGGCAGAAAAGGAGGCACGTCGGAAGTTCAAACAGATCGT 518
Query 345 CACAGCTGTCTATTTTTGTCACTGTCGGAACATTGTTCATCGTGATTTAAAAGCTGAAAATTTACTTCTGGATG 418
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CACAGCTGTCTATTTTTGTCACTGTCGGAACATTGTTCATCGTGATTTAAAAGCTGAAAATTTACTTCTGGATG 592
Query 419 CCAATCTGAATATCAAAATAGCAGATTTTGGTTTCAGTAACCTCTTCACTCCTGGGCAGCTGCTGAAGACCTGG 492
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCAATCTGAATATCAAAATAGCAGATTTTGGTTTCAGTAACCTCTTCACTCCTGGGCAGCTGCTGAAGACCTGG 666
Query 493 TGTGGCAGCCCTCCCTATGCTGCACCTGAACTCTTTGAAGGAAAAGAATATGATGGGCCCAAAGTGGACATCTG 566
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TGTGGCAGCCCTCCCTATGCTGCACCTGAACTCTTTGAAGGAAAAGAATATGATGGGCCCAAAGTGGACATCTG 740
Query 567 GAGCCTTGGAGTTGTCCTCTACGTGCTTGTGTGCGGTGCCCTGCCATTTGATGGAAGCACACTGCAGAATCTGC 640
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GAGCCTTGGAGTTGTCCTCTACGTGCTTGTGTGCGGTGCCCTGCCATTTGATGGAAGCACACTGCAGAATCTGC 814
Query 641 GGGCCCGCGTGCTGAGTGGAAAGTTCCGCATCCCATTTTTTATGTCCACAGAATGTGAGCATTTGATCCGCCAT 714
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGGCCCGCGTGCTGAGTGGAAAGTTCCGCATCCCATTTTTTATGTCCACAGAATGTGAGCATTTGATCCGCCAT 888
Query 715 ATGTTGGTGTTAGATCCCAATAAGCGCCTCTCCATGGAGCAGATCTGCAAGCACAAGTGGATGAAGCTAGGGGA 788
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATGTTGGTGTTAGATCCCAATAAGCGCCTCTCCATGGAGCAGATCTGCAAGCACAAGTGGATGAAGCTAGGGGA 962
Query 789 CGCCGATCCCAACTTTGACAGGTTAATAGCTGAATGCCAACAACTAAAGGAAGAAAGACAGGTGGACCCCCTGA 862
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CGCCGATCCCAACTTTGACAGGTTAATAGCTGAATGCCAACAACTAAAGGAAGAAAGACAGGTGGACCCCCTGA 1036
Query 863 ATGAGGATGTCCTCTTGGCCATGGAGGACATGGGACTGGACAAAGAACAGACACTGCAGTCATTAAGATCAGAT 936
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATGAGGATGTCCTCTTGGCCATGGAGGACATGGGACTGGACAAAGAACAGACACTG------------------ 1092
Query 937 GCCTATGATCACTATAGTGCAATCTACAGCCTGCTGTGTGATCGACATAAGAGACATAAAACCCTGCGTCTCGG 1010
Sbjct 1093 -------------------------------------------------------------------------- 1092
Query 1011 AGCACTTCCTAGCATGCCCCGAGCCCTGGCCTTTCAAGCACCAGTCAATATCCAGGCGGAGCAGGCAGGTACTG 1084
||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093 ----------------------------------------------------CAGGCGGAGCAGGCAGGTACTG 1114
Query 1085 CTATGAACATCAGCGTTCCCCAGGTGCAGCTGATCAACCCAGAGAACCAAATTGTGGAGCCGGATGGGACACTG 1158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115 CTATGAACATCAGCGTTCCCCAGGTGCAGCTGATCAACCCAGAGAACCAAATTGTGGAGCCGGATGGGACACTG 1188
Query 1159 AATTTGGACAGTGATGAGGGTGAAGAGCCTTCCCCTGAAGCATTGGTGCGCTATTTGTCAATGAGGAGGCACAC 1232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189 AATTTGGACAGTGATGAGGGTGAAGAGCCTTCCCCTGAAGCATTGGTGCGCTATTTGTCAATGAGGAGGCACAC 1262
Query 1233 AGTGGGTGTGGCTGACCCACGCACGGAAGTTATGGAAGATCTGCAGAAGCTCCTACCTGGCTTTCCTGGAGTCA 1306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263 AGTGGGTGTGGCTGACCCACGCACGGAAGTTATGGAAGATCTGCAGAAGCTCCTACCTGGCTTTCCTGGAGTCA 1336
Query 1307 ACCCCCAGGCTCCATTCCTGCAGGTGGCCCCTAATGTGAACTTCATGCACAACCTGTTGCCTATGCAAAACTTG 1380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337 ACCCCCAGGCTCCATTCCTGCAGGTGGCCCCTAATGTGAACTTCATGCACAACCTGTTGCCTATGCAAAACTTG 1410
Query 1381 CAACCAACCGGGCAACTTGAGTACAAGGAGCAGTCTCTCCTACAGCCGCCCACGCTACAGCTGTTGAATGGAAT 1454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411 CAACCAACCGGGCAACTTGAGTACAAGGAGCAGTCTCTCCTACAGCCGCCCACGCTACAGCTGTTGAATGGAAT 1484
Query 1455 GGGCCCCCTTGGCCGGAGGGCATCAGATGGAGGAGCCAACATCCAACTGCATGCCCAGCAGCTGCTGAAGCGCC 1528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485 GGGCCCCCTTGGCCGGAGGGCATCAGATGGAGGAGCCAACATCCAACTGCATGCCCAGCAGCTGCTGAAGCGCC 1558
Query 1529 CACGGGGACCCTCTCCGCTTGTCACCATGACACCAGCAGTGCCAGCAGTTACCCCTGTGGACGAGGAGAGCTCA 1602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559 CACGGGGACCCTCTCCGCTTGTCACCATGACACCAGCAGTGCCAGCAGTTACCCCTGTGGACGAGGAGAGCTCA 1632
Query 1603 GACGGGGAGCCAGACCAGGAAGCTGTGCAGAGGTACTTGGCAAATAGGTCCAAAAGACATACACTGGCCATGAC 1676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1633 GACGGGGAGCCAGACCAGGAAGCTGTGCAGAGGTACTTGGCAAATAGGTCCAAAAGACATACACTGGCCATGAC 1706
Query 1677 CAACCCTACAGCTGAGATCCCACCGGACCTACAACGGCAGCTAGGACAGCAGCCTTTCCGTTCCCGGGTCTGGC 1750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1707 CAACCCTACAGCTGAGATCCCACCGGACCTACAACGGCAGCTAGGACAGCAGCCTTTCCGTTCCCGGGTCTGGC 1780
Query 1751 CTCCTCACCTGGTACCTGATCAGCATCGCTCTACCTACAAGGACTCCAACACTCTGCACCTCCCTACGGAGCGT 1824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1781 CTCCTCACCTGGTACCTGATCAGCATCGCTCTACCTACAAGGACTCCAACACTCTGCACCTCCCTACGGAGCGT 1854
Query 1825 TTCTCCCCTGTGCGCCGGTTCTCAGATGGGGCTGCGAGCATCCAGGCCTTCAAAGCTCACCTGGAAAAAATGGG 1898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855 TTCTCCCCTGTGCGCCGGTTCTCAGATGGGGCTGCGAGCATCCAGGCCTTCAAAGCTCACCTGGAAAAAATGGG 1928
Query 1899 CAACAACAGCAGCATCAAACAGCTGCAGCAGGAGTGTGAGCAGCTGCAGAAGATGTACGGGGGGCAGATTGATG 1972
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1929 CAACAACAGCAGCATCAAACAGCTGCAGCAGGAGTGTGAGCAGCTGCAGAAGATGTACGGGGGGCAGATTGATG 2002
Query 1973 AAAGAACCCTGGAGAAGACCCAGCAGCAGCATATGTTATACCAGCAGGAGCAGCACCATCAAATTCTCCAGCAA 2046
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2003 AAAGAACCCTGGAGAAGACCCAGCAGCAGCATATGTTATACCAGCAGGAGCAGCACCATCAAATTCTCCAGCAA 2076
Query 2047 CAAATTCAAGACTCTATCTGTCCTCCTCAGCCATCTCCACCTCTTCAGGCTGCATGTGAAAATCAGCCAGCCCT 2120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2077 CAAATTCAAGACTCTATCTGTCCTCCTCAGCCATCTCCACCTCTTCAGGCTGCATGTGAAAATCAGCCAGCCCT 2150
Query 2121 CCTTACCCATCAGCTCCAGAGGTTAAGGATTCAGCCTTCAAGCCCACCCCCCAACCACCCCAACAACCATCTCT 2194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2151 CCTTACCCATCAGCTCCAGAGGTTAAGGATTCAGCCTTCAAGCCCACCCCCCAACCACCCCAACAACCATCTCT 2224
Query 2195 TCAGGCAGCCCAGTAATAGTCCTCCCCCCATGAGCAGTGCCATGATCCAGCCTCACGGGGCTGCATCTTCTTCC 2268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2225 TCAGGCAGCCCAGTAATAGTCCTCCCCCCATGAGCAGTGCCATGATCCAGCCTCACGGGGCTGCATCTTCTTCC 2298
Query 2269 CAGTTTCAAGGCTTACCTTCCCGCAGTGCAATCTTTCAGCAGCAACCTGAGAACTGTTCCTCTCCTCCCAACGT 2342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2299 CAGTTTCAAGGCTTACCTTCCCGCAGTGCAATCTTTCAGCAGCAACCTGAGAACTGTTCCTCTCCTCCCAACGT 2372
Query 2343 GGCACTAACCTGCTTGGGTATGCAGCAGCCTGCTCAGTCACAGCAGGTCACCATCCAAGTCCAAGAGCCTGTTG 2416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2373 GGCACTAACCTGCTTGGGTATGCAGCAGCCTGCTCAGTCACAGCAGGTCACCATCCAAGTCCAAGAGCCTGTTG 2446
Query 2417 ACATGCTCAGCAACATGCCAGGCACAGCTGCAGGCTCCAGTGGGCGCGGCATCTCCATCAGCCCCAGTGCTGGT 2490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2447 ACATGCTCAGCAACATGCCAGGCACAGCTGCAGGCTCCAGTGGGCGCGGCATCTCCATCAGCCCCAGTGCTGGT 2520
Query 2491 CAGATGCAGATGCAGCACCGTACCAACCTGATGGCCACCCTCAGCTATGGGCACCGTCCCTTGTCCAAGCAGCT 2564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2521 CAGATGCAGATGCAGCACCGTACCAACCTGATGGCCACCCTCAGCTATGGGCACCGTCCCTTGTCCAAGCAGCT 2594
Query 2565 GAGTGCTGACAGTGCAGAGGCTCACAGCTTGAACGTGAATCGGTTCTCCCCTGCTAACTACGACCAGGCGCATT 2638
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2595 GAGTGCTGACAGTGCAGAGGCTCA-------------------------------------------------- 2618
Query 2639 TACACCCCCATCTGTTTTCGGACCAGTCCCGGGGTTCCCCCAGCAGCTACAGCCCTTCAACAGGAGTGGGGTTC 2712
Sbjct 2619 -------------------------------------------------------------------------- 2618
Query 2713 TCTCCAACCCAAGCCCTGAAAGTCCCTCCACTTGACCAATTCCCCACCTTCCCTCCCAGTGCACATCAGCAGCC 2786
||||||||||||||||||
Sbjct 2619 --------------------------------------------------------CAGTGCACATCAGCAGCC 2636
Query 2787 GCCACACTATACCACGTCGGCACTACAGCAGGCCCTGCTGTCTCCCACGCCGCCAGACTATACAAGACACCAGC 2860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2637 GCCACACTATACCACGTCGGCACTACAGCAGGCCCTGCTGTCTCCCACGCCGCCAGACTATACAAGACACCAGC 2710
Query 2861 AGGTACCCCACATCCTTCAAGGACTGCTTTCTCCCCGGCATTCGCTCACCGGCCACTCGGACATCCGGCTGCCC 2934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2711 AGGTACCCCACATCCTTCAAGGACTGCTTTCTCCCCGGCATTCGCTCACCGGCCACTCGGACATCCGGCTGCCC 2784
Query 2935 CCAACAGAGTTTGCACAGCTCATTAAAAGGCAGCAGCAACAACGGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAGCA 3008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2785 CCAACAGAGTTTGCACAGCTCATTAAAAGGCAGCAGCAACAACGGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAGCA 2858
Query 3009 AGAATACCAGGAACTGTTCAGGCACATGAACCAAGGGGATGCGGGGAGTCTGGCTCCCAGCCTTGGGGGACAGA 3082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2859 AGAATACCAGGAACTGTTCAGGCACATGAACCAAGGGGATGCGGGGAGTCTGGCTCCCAGCCTTGGGGGACAGA 2932
Query 3083 GCATGACAGAGCGCCAGGCTTTATCTTATCAAAATGCTGACTCTTATCACCATCACACCAGCCCCCAGCATCTG 3156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2933 GCATGACAGAGCGCCAGGCTTTATCTTATCAAAATGCTGACTCTTATCACCATCACACCAGCCCCCAGCATCTG 3006
Query 3157 CTACAAATCAGGGCACAAGAATGTGTCTCACAGGCTTCCTCACCCACCCCGCCCCACGGGTATGCTCACCAGCC 3230
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3007 CTACAAATCAGGGCACAAGAATGTGTCTCACAGGCTTCCTCACCCACCCCGCCCCACGGGTATGCTCACCAGCC 3080
Query 3231 GGCACTGATGCATTCAGAGAGCATGGAGGAGGACTGCTCGTGTGAGGGGGCCAAGGATGGCTTCCAAGACAGTA 3304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3081 GGCACTGATGCATTCAGAGAGCATGGAGGAGGACTGCTCGTGTGAGGGGGCCAAGGATGGCTTCCAAGACAGTA 3154
Query 3305 AGAGTTCAAGTACATTGACCAAAGGTTGCCATGACAGCCCTCTGCTCTTGAGTACCGGTGGACCTGGGGACCGT 3378
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 3155 AGAGTTCAAGTACATTGACCAAAGGTTGCCATGACAGCCCTCTGCTCTTGAGTACCGGTGGACCTGGGGACCCT 3228
Query 3379 GAATCTTTGCTAGGAACTGTGAGTCATGCCCAAGAATTGGGGATACATCCCTATGGTCATCAGCCAACTGCTGC 3452
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3229 GAATCTTTGCTAGGAACTGTGAGTCATGCCCAAGAATTGGGGATACATCCCTATGGTCATCAGCCAACTGCTGC 3302
Query 3453 ATTCAGTAAAAATAAGGTGCCCAGCAGAGAGCCTGTCATAGGGAACTGCATGGATAGAAGTTCTCCAGGACAAG 3526
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3303 ATTCAGTAAAAATAAGGTGCCCAGCAGAGAGCCTGTCATAGGGAACTGCATGGATAGAAGTTCTCCAGGACAAG 3376
Query 3527 CAGTGGAGCTGCCGGATCACAATGGGCTCGGGTACCCAGCACGCCCCTCCGTCCATGAGCACCACAGGCCCCGG 3600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3377 CAGTGGAGCTGCCGGATCACAATGGGCTCGGGTACCCAGCACGCCCCTCCGTCCATGAGCACCACAGGCCCCGG 3450
Query 3601 GCCCTCCAGAGACACCACACGATCCAGAACAGCGACGATGCTTATGTACAGCTGGATAACTTGCCAGGAATGAG 3674
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3451 GCCCTCCAGAGACACCACACGATCCAGAACAGCGACGATGCTTATGTACAGCTGGATAACTTGCCAGGAATGAG 3524
Query 3675 TCTCGTGGCTGGGAAAGCACTTAGCTCTGCCCGGATGTCGGATGCAGTTCTCAATCAGTCTTCGCTCATGGGCA 3748
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 3525 TCTCGTGGCTGGGAAAGCACTTAGCTCTGCCCGGATGTCGGATGCAGTTCTCAGTCAGTCTTCGCTCATGGGCA 3598
Query 3749 GCCAGCAGTTTCAGGATGGGGAAAATGAGGAATGTGGGGCAAGCCTGGGAGGTCATGAGCACCCAGACCTGAGT 3822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3599 GCCAGCAGTTTCAGGATGGGGAAAATGAGGAATGTGGGGCAAGCCTGGGAGGTCATGAGCACCCAGACCTGAGT 3672
Query 3823 GATGGCAGCCAGCATTTAAACTCCTCTTGCTATCCATCTACGTGTATTACAGACATTCTGCTCAGCTACAAGCA 3896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3673 GATGGCAGCCAGCATTTAAACTCCTCTTGCTATCCATCTACGTGTATTACAGACATTCTGCTCAGCTACAAGCA 3746
Query 3897 CCCCGAAGTCTCCTTCAGCATGGAGCAGGCAGGCGTGTAAGCT 3939
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3747 CCCCGAAGTCTCCTTCAGCATGGAGCAGGCAGGCGTG------ 3783