Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489060
• Subject: XM_017017424.1
• Aligned Length: 4113
• Identities: 3463
• Gaps: 648

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGCGGCGGCGGCGAGCGGAGCTGGCGGGGCTGCCGGGGCCGGGACTGGGGGAGCCGGGCCCGCGGGCCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCTGCTGCCTCCGCCCGCGCCGGGGTCCCCAGCCGCCCCCGCTGCCGTGTCCCCTGCGGCCGGCCAGCCGCGTC  148

Query    1  --------------------------ATGCCCGCCCGTATCGGCTACTACGAGATCGACCGCACCATCGGCAAG  48
                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCCAGCCCCGGCCTCCCGCGGACCCATGCCCGCCCGTATCGGCTACTACGAGATCGACCGCACCATCGGCAAG  222

Query   49  GGCAACTTCGCGGTGGTCAAGCGGGCCACGCACCTCGTCACCAAGGCCAAGGTTGCTATCAAGATCATAGATAA  122
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGCAACTTCGCGGTGGTCAAGCGGGCCACGCACCTCGTCACCAAGGCCAAGGTTGCTATCAAGATCATAGATAA  296

Query  123  GACCCAGCTGGATGAAGAAAACTTGAAGAAGATTTTCCGGGAAGTTCAAATTATGAAGATGCTTTGCCACCCCC  196
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACCCAGCTGGATGAAGAAAACTTGAAGAAGATTTTCCGGGAAGTTCAAATTATGAAGATGCTTTGCCACCCCC  370

Query  197  ATATCATCAGGCTCTACCAGGTTATGGAGACAGAACGGATGATTTATCTGGTGACAGAATATGCTAGTGGAGGG  270
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATATCATCAGGCTCTACCAGGTTATGGAGACAGAACGGATGATTTATCTGGTGACAGAATATGCTAGTGGAGGG  444

Query  271  GAAATATTTGACCACCTGGTGGCCCATGGTAGAATGGCAGAAAAGGAGGCACGTCGGAAGTTCAAACAGATCGT  344
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAATATTTGACCACCTGGTGGCCCATGGTAGAATGGCAGAAAAGGAGGCACGTCGGAAGTTCAAACAGATCGT  518

Query  345  CACAGCTGTCTATTTTTGTCACTGTCGGAACATTGTTCATCGTGATTTAAAAGCTGAAAATTTACTTCTGGATG  418
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACAGCTGTCTATTTTTGTCACTGTCGGAACATTGTTCATCGTGATTTAAAAGCTGAAAATTTACTTCTGGATG  592

Query  419  CCAATCTGAATATCAAAATAGCAGATTTTGGTTTCAGTAACCTCTTCACTCCTGGGCAGCTGCTGAAGACCTGG  492
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAATCTGAATATCAAAATAGCAGATTTTGGTTTCAGTAACCTCTTCACTCCTGGGCAGCTGCTGAAGACCTGG  666

Query  493  TGTGGCAGCCCTCCCTATGCTGCACCTGAACTCTTTGAAGGAAAAGAATATGATGGGCCCAAAGTGGACATCTG  566
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGTGGCAGCCCTCCCTATGCTGCACCTGAACTCTTTGAAGGAAAAGAATATGATGGGCCCAAAGTGGACATCTG  740

Query  567  GAGCCTTGGAGTTGTCCTCTACGTGCTTGTGTGCGGTGCCCTGCCATTTGATGGAAGCACACTGCAGAATCTGC  640
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAGCCTTGGAGTTGTCCTCTACGTGCTTGTGTGCGGTGCCCTGCCATTTGATGGAAGCACACTGCAGAATCTGC  814

Query  641  GGGCCCGCGTGCTGAGTGGAAAGTTCCGCATCCCATTTTTTATGTCCACAGAATGTGAGCATTTGATCCGCCAT  714
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGCCCGCGTGCTGAGTGGAAAGTTCCGCATCCCATTTTTTATGTCCACAGAATGTGAGCATTTGATCCGCCAT  888

Query  715  ATGTTGGTGTTAGATCCCAATAAGCGCCTCTCCATGGAGCAGATCTGCAAGCACAAGTGGATGAAGCTAGGGGA  788
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATGTTGGTGTTAGATCCCAATAAGCGCCTCTCCATGGAGCAGATCTGCAAGCACAAGTGGATGAAGCTAGGGGA  962

Query  789  CGCCGATCCCAACTTTGACAGGTTAATAGCTGAATGCCAACAACTAAAGGAAGAAAGACAGGTGGACCCCCTGA  862
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGCCGATCCCAACTTTGACAGGTTAATAGCTGAATGCCAACAACTAAAGGAAGAAAGACAGGTGGACCCCCTGA  1036

Query  863  ATGAGGATGTCCTCTTGGCCATGGAGGACATGGGACTGGACAAAGAACAGACACTGCAGTCATTAAGATCAGAT  936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
Sbjct 1037  ATGAGGATGTCCTCTTGGCCATGGAGGACATGGGACTGGACAAAGAACAGACACTG------------------  1092

Query  937  GCCTATGATCACTATAGTGCAATCTACAGCCTGCTGTGTGATCGACATAAGAGACATAAAACCCTGCGTCTCGG  1010
                                                                                      
Sbjct 1093  --------------------------------------------------------------------------  1092

Query 1011  AGCACTTCCTAGCATGCCCCGAGCCCTGGCCTTTCAAGCACCAGTCAATATCCAGGCGGAGCAGGCAGGTACTG  1084
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1093  ----------------------------------------------------CAGGCGGAGCAGGCAGGTACTG  1114

Query 1085  CTATGAACATCAGCGTTCCCCAGGTGCAGCTGATCAACCCAGAGAACCAAATTGTGGAGCCGGATGGGACACTG  1158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115  CTATGAACATCAGCGTTCCCCAGGTGCAGCTGATCAACCCAGAGAACCAAATTGTGGAGCCGGATGGGACACTG  1188

Query 1159  AATTTGGACAGTGATGAGGGTGAAGAGCCTTCCCCTGAAGCATTGGTGCGCTATTTGTCAATGAGGAGGCACAC  1232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189  AATTTGGACAGTGATGAGGGTGAAGAGCCTTCCCCTGAAGCATTGGTGCGCTATTTGTCAATGAGGAGGCACAC  1262

Query 1233  AGTGGGTGTGGCTGACCCACGCACGGAAGTTATGGAAGATCTGCAGAAGCTCCTACCTGGCTTTCCTGGAGTCA  1306
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263  AGTGGGTGTGGCTGACCCACGCACGGAAGTTATGGAAGATCTGCAGAAGCTCCTACCTGGCTTTCCTGGAGTCA  1336

Query 1307  ACCCCCAGGCTCCATTCCTGCAGGTGGCCCCTAATGTGAACTTCATGCACAACCTGTTGCCTATGCAAAACTTG  1380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337  ACCCCCAGGCTCCATTCCTGCAGGTGGCCCCTAATGTGAACTTCATGCACAACCTGTTGCCTATGCAAAACTTG  1410

Query 1381  CAACCAACCGGGCAACTTGAGTACAAGGAGCAGTCTCTCCTACAGCCGCCCACGCTACAGCTGTTGAATGGAAT  1454
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411  CAACCAACCGGGCAACTTGAGTACAAGGAGCAGTCTCTCCTACAGCCGCCCACGCTACAGCTGTTGAATGGAAT  1484

Query 1455  GGGCCCCCTTGGCCGGAGGGCATCAGATGGAGGAGCCAACATCCAACTGCATGCCCAGCAGCTGCTGAAGCGCC  1528
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485  GGGCCCCCTTGGCCGGAGGGCATCAGATGGAGGAGCCAACATCCAACTGCATGCCCAGCAGCTGCTGAAGCGCC  1558

Query 1529  CACGGGGACCCTCTCCGCTTGTCACCATGACACCAGCAGTGCCAGCAGTTACCCCTGTGGACGAGGAGAGCTCA  1602
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559  CACGGGGACCCTCTCCGCTTGTCACCATGACACCAGCAGTGCCAGCAGTTACCCCTGTGGACGAGGAGAGCTCA  1632

Query 1603  GACGGGGAGCCAGACCAGGAAGCTGTGCAGAGGTACTTGGCAAATAGGTCCAAAAGACATACACTGGCCATGAC  1676
            |||||||||||||||||||||||||||||||                                           
Sbjct 1633  GACGGGGAGCCAGACCAGGAAGCTGTGCAGA-------------------------------------------  1663

Query 1677  CAACCCTACAGCTGAGATCCCACCGGACCTACAACGGCAGCTAGGACAGCAGCCTTTCCGTTCCCGGGTCTGGC  1750
                                                                                      
Sbjct 1664  --------------------------------------------------------------------------  1663

Query 1751  CTCCTCACCTGGTACCTGATCAGCATCGCTCTACCTACAAGGACTCCAACACTCTGCACCTCCCTACGGAGCGT  1824
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1664  ---------------------------GCTCTACCTACAAGGACTCCAACACTCTGCACCTCCCTACGGAGCGT  1710

Query 1825  TTCTCCCCTGTGCGCCGGTTCTCAGATGGGGCTGCGAGCATCCAGGCCTTCAAAGCTCACCTGGAAAAAATGGG  1898
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1711  TTCTCCCCTGTGCGCCGGTTCTCAGATGGGGCTGCGAGCATCCAGGCCTTCAAAGCTCACCTGGAAAAAATGGG  1784

Query 1899  CAACAACAGCAGCATCAAACAGCTGCAGCAGGAGTGTGAGCAGCTGCAGAAGATGTACGGGGGGCAGATTGATG  1972
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1785  CAACAACAGCAGCATCAAACAGCTGCAGCAGGAGTGTGAGCAGCTGCAGAAGATGTACGGGGGGCAGATTGATG  1858

Query 1973  AAAGAACCCTGGAGAAGACCCAGCAGCAGCATATGTTATACCAGCAGGAGCAGCACCATCAAATTCTCCAGCAA  2046
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1859  AAAGAACCCTGGAGAAGACCCAGCAGCAGCATATGTTATACCAGCAGGAGCAGCACCATCAAATTCTCCAGCAA  1932

Query 2047  CAAATTCAAGACTCTATCTGTCCTCCTCAGCCATCTCCACCTCTTCAGGCTGCATGTGAAAATCAGCCAGCCCT  2120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1933  CAAATTCAAGACTCTATCTGTCCTCCTCAGCCATCTCCACCTCTTCAGGCTGCATGTGAAAATCAGCCAGCCCT  2006

Query 2121  CCTTACCCATCAGCTCCAGAGGTTAAGGATTCAGCCTTCAAGCCCACCCCCCAACCACCCCAACAACCATCTCT  2194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2007  CCTTACCCATCAGCTCCAGAGGTTAAGGATTCAGCCTTCAAGCCCACCCCCCAACCACCCCAACAACCATCTCT  2080

Query 2195  TCAGGCAGCCCAGTAATAGTCCTCCCCCCATGAGCAGTGCCATGATCCAGCCTCACGGGGCTGCATCTTCTTCC  2268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2081  TCAGGCAGCCCAGTAATAGTCCTCCCCCCATGAGCAGTGCCATGATCCAGCCTCACGGGGCTGCATCTTCTTCC  2154

Query 2269  CAGTTTCAAGGCTTACCTTCCCGCAGTGCAATCTTTCAGCAGCAACCTGAGAACTGTTCCTCTCCTCCCAACGT  2342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2155  CAGTTTCAAGGCTTACCTTCCCGCAGTGCAATCTTTCAGCAGCAACCTGAGAACTGTTCCTCTCCTCCCAACGT  2228

Query 2343  GGCACTAACCTGCTTGGGTATGCAGCAGCCTGCTCAGTCACAGCAGGTCACCATCCAAGTCCAAGAGCCTGTTG  2416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2229  GGCACTAACCTGCTTGGGTATGCAGCAGCCTGCTCAGTCACAGCAGGTCACCATCCAAGTCCAAGAGCCTGTTG  2302

Query 2417  ACATGCTCAGCAACATGCCAGGCACAGCTGCAGGCTCCAGTGGGCGCGGCATCTCCATCAGCCCCAGTGCTGGT  2490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2303  ACATGCTCAGCAACATGCCAGGCACAGCTGCAGGCTCCAGTGGGCGCGGCATCTCCATCAGCCCCAGTGCTGGT  2376

Query 2491  CAGATGCAGATGCAGCACCGTACCAACCTGATGGCCACCCTCAGCTATGGGCACCGTCCCTTGTCCAAGCAGCT  2564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2377  CAGATGCAGATGCAGCACCGTACCAACCTGATGGCCACCCTCAGCTATGGGCACCGTCCCTTGTCCAAGCAGCT  2450

Query 2565  GAGTGCTGACAGTGCAGAGGCTCACAGCTTGAACGTGAATCGGTTCTCCCCTGCTAACTACGACCAGGCGCATT  2638
            ||||||||||||||||||||||||                                                  
Sbjct 2451  GAGTGCTGACAGTGCAGAGGCTCA--------------------------------------------------  2474

Query 2639  TACACCCCCATCTGTTTTCGGACCAGTCCCGGGGTTCCCCCAGCAGCTACAGCCCTTCAACAGGAGTGGGGTTC  2712
                                                                                      
Sbjct 2475  --------------------------------------------------------------------------  2474

Query 2713  TCTCCAACCCAAGCCCTGAAAGTCCCTCCACTTGACCAATTCCCCACCTTCCCTCCCAGTGCACATCAGCAGCC  2786
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct 2475  --------------------------------------------------------CAGTGCACATCAGCAGCC  2492

Query 2787  GCCACACTATACCACGTCGGCACTACAGCAGGCCCTGCTGTCTCCCACGCCGCCAGACTATACAAGACACCAGC  2860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2493  GCCACACTATACCACGTCGGCACTACAGCAGGCCCTGCTGTCTCCCACGCCGCCAGACTATACAAGACACCAGC  2566

Query 2861  AGGTACCCCACATCCTTCAAGGACTGCTTTCTCCCCGGCATTCGCTCACCGGCCACTCGGACATCCGGCTGCCC  2934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2567  AGGTACCCCACATCCTTCAAGGACTGCTTTCTCCCCGGCATTCGCTCACCGGCCACTCGGACATCCGGCTGCCC  2640

Query 2935  CCAACAGAGTTTGCACAGCTCATTAAAAGGCAGCAGCAACAACGGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAGCA  3008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2641  CCAACAGAGTTTGCACAGCTCATTAAAAGGCAGCAGCAACAACGGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAACAGCA  2714

Query 3009  AGAATACCAGGAACTGTTCAGGCACATGAACCAAGGGGATGCGGGGAGTCTGGCTCCCAGCCTTGGGGGACAGA  3082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2715  AGAATACCAGGAACTGTTCAGGCACATGAACCAAGGGGATGCGGGGAGTCTGGCTCCCAGCCTTGGGGGACAGA  2788

Query 3083  GCATGACAGAGCGCCAGGCTTTATCTTATCAAAATGCTGACTCTTATCACCATCACACCAGCCCCCAGCATCTG  3156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2789  GCATGACAGAGCGCCAGGCTTTATCTTATCAAAATGCTGACTCTTATCACCATCACACCAGCCCCCAGCATCTG  2862

Query 3157  CTACAAATCAGGGCACAAGAATGTGTCTCACAGGCTTCCTCACCCACCCCGCCCCACGGGTATGCTCACCAGCC  3230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2863  CTACAAATCAGGGCACAAGAATGTGTCTCACAGGCTTCCTCACCCACCCCGCCCCACGGGTATGCTCACCAGCC  2936

Query 3231  GGCACTGATGCATTCAGAGAGCATGGAGGAGGACTGCTCGTGTGAGGGGGCCAAGGATGGCTTCCAAGACAGTA  3304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2937  GGCACTGATGCATTCAGAGAGCATGGAGGAGGACTGCTCGTGTGAGGGGGCCAAGGATGGCTTCCAAGACAGTA  3010

Query 3305  AGAGTTCAAGTACATTGACCAAAGGTTGCCATGACAGCCCTCTGCTCTTGAGTACCGGTGGACCTGGGGACCGT  3378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 3011  AGAGTTCAAGTACATTGACCAAAGGTTGCCATGACAGCCCTCTGCTCTTGAGTACCGGTGGACCTGGGGACCCT  3084

Query 3379  GAATCTTTGCTAGGAACTGTGAGTCATGCCCAAGAATTGGGGATACATCCCTATGGTCATCAGCCAACTGCTGC  3452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3085  GAATCTTTGCTAGGAACTGTGAGTCATGCCCAAGAATTGGGGATACATCCCTATGGTCATCAGCCAACTGCTGC  3158

Query 3453  ATTCAGTAAAAATAAGGTGCCCAGCAGAGAGCCTGTCATAGGGAACTGCATGGATAGAAGTTCTCCAGGACAAG  3526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3159  ATTCAGTAAAAATAAGGTGCCCAGCAGAGAGCCTGTCATAGGGAACTGCATGGATAGAAGTTCTCCAGGACAAG  3232

Query 3527  CAGTGGAGCTGCCGGATCACAATGGGCTCGGGTACCCAGCACGCCCCTCCGTCCATGAGCACCACAGGCCCCGG  3600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3233  CAGTGGAGCTGCCGGATCACAATGGGCTCGGGTACCCAGCACGCCCCTCCGTCCATGAGCACCACAGGCCCCGG  3306

Query 3601  GCCCTCCAGAGACACCACACGATCCAGAACAGCGACGATGCTTATGTACAGCTGGATAACTTGCCAGGAATGAG  3674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3307  GCCCTCCAGAGACACCACACGATCCAGAACAGCGACGATGCTTATGTACAGCTGGATAACTTGCCAGGAATGAG  3380

Query 3675  TCTCGTGGCTGGGAAAGCACTTAGCTCTGCCCGGATGTCGGATGCAGTTCTCAATCAGTCTTCGCTCATGGGCA  3748
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 3381  TCTCGTGGCTGGGAAAGCACTTAGCTCTGCCCGGATGTCGGATGCAGTTCTCAGTCAGTCTTCGCTCATGGGCA  3454

Query 3749  GCCAGCAGTTTCAGGATGGGGAAAATGAGGAATGTGGGGCAAGCCTGGGAGGTCATGAGCACCCAGACCTGAGT  3822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3455  GCCAGCAGTTTCAGGATGGGGAAAATGAGGAATGTGGGGCAAGCCTGGGAGGTCATGAGCACCCAGACCTGAGT  3528

Query 3823  GATGGCAGCCAGCATTTAAACTCCTCTTGCTATCCATCTACGTGTATTACAGACATTCTGCTCAGCTACAAGCA  3896
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3529  GATGGCAGCCAGCATTTAAACTCCTCTTGCTATCCATCTACGTGTATTACAGACATTCTGCTCAGCTACAAGCA  3602

Query 3897  CCCCGAAGTCTCCTTCAGCATGGAGCAGGCAGGCGTGTAAGCT  3939
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct 3603  CCCCGAAGTCTCCTTCAGCATGGAGCAGGCAGGCGTG------  3639