Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489148
- Subject:
- XR_001785079.1
- Aligned Length:
- 4183
- Identities:
- 2500
- Gaps:
- 1445
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 TGGGAAGGGTGGGGAGAGATGGATAGCAAGCAAGGGAGGGAGAGAGGGAGTGGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 AGGGAGCCCAACGACCATTTAAAGCGATAGCAATCCCTGCCCTCTCCCCAGTGCTTGGCTGTTGGAGAGCGCGA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GCGGCAAGCCAGGGAGCGGGGAGCGCAAGCTGGTGCACGGGCCAGCGGAGCTACAGTGCCAGGTGCCAAAGACT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GGCTGACGCCCTGGGACCCCCCACCCCTCTCCTGCTGCACCTCCTCTGTCTCCTCCACCCTCTGTGCCTACAGA 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 AGTCCCCGGGGCTTCCCCCGAAAGGAGCTCACCTCGAGAAGCCGGGACCTGGGAGAGCCCACCAGCATCCCCTC 370
Query 1 ---------------------------------------ATGGTCCAGCTGAGGAAGCTGCTCCGCGTCCTGAC 35
||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAGCGCCGCCGCCGCTACCGCAGCAGCATCCGGAGCGGCATGGTCCAGCTGGGGAAGCTGCTCCGCGTCCTGAC 444
Query 36 TTTGATGAAGTTCCCCTGCTGCGTGCTGGAGGTGCTCCTGTGCGCGCTGGCGGCGGCGGCGCGCGGCCAGGAGA 109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTGATGAAGTTCCCCTGCTGCGTGCTGGAGGTGCTCCTGTGCGTGCTGGCGGCGGCGGCGCGCGGCCAGGAGA 518
Query 110 TGTACGCCCCGCACTCAATCCGGATCGAGGGGGACGTCACCCTCGGGGGGCTGTTCCCCGTGCACGCCAAGGGT 183
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 519 TGTACGCCCCGCACTCGATCCGGATCGAGGGGGACGTCACCCTTGGGGGGCTGTTCCCAGTGCACGCCAAGGGT 592
Query 184 CCCAGCGGAGTGCCCTGCGGCGACATCAAGAGGGAAAACGGGATCCACAGGCTGGAAGCGATGCTCTACGCCCT 257
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 593 CCCAGCGGAGTGCCCTGCGGCGACATCAAGAGGGAGAATGGGATCCACAGGCTGGAAGCTATGCTTTATGCTCT 666
Query 258 GGACCAGATCAACAGTGATCCCAACCTACTGCCCAACGTGACGCTGGGCGCGCGGATCCTGGACACTTGTTCCA 331
.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGACCAGATCAACAGCGATCCCAACCTGCTGCCCAACGTAACGTTAGGCGCGCGGATCCTGGACACTTGTTCCA 740
Query 332 GGGACACTTACGCGCTCGAACAGTCGCTTACTTTCGTCCAGGCGCTCATCCAGAAGGACACCTCCGACGTGCGC 405
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 741 GGGACACTTATGCGCTCGAACAGTCGCTCACTTTCGTCCAGGCGCTTATCCAGAAGGACACCTCCGACGTGCGT 814
Query 406 TGCACCAACGGCGAACCGCCGGTTTTCGTCAAGCCGGAGAAAGTAGTTGGAGTGATTGGGGCTTCGGGGAGTTC 479
|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 815 TGCACCAACGGAGAGCCCCCGGTTTTCGTCAAGCCAGAGAAAGTAGTTGGAGTGATTGGGGCTTCGGGGAGCTC 888
Query 480 GGTCTCCATCATGGTAGCCAACATCCTGAGGCTCTTCCAGATCCCCCAGATTAGTTATGCATCAACGGCACCCG 553
.||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 889 CGTCTCCATCATGGTAGCCAACATCTTGAGGCTTTTCCAGATACCTCAGATTAGTTATGCATCCACGGCTCCTG 962
Query 554 AGCTAAGTGATGACCGGCGCTATGACTTCTTCTCTCGCGTGGTGCCACCCGATTCCTTCCAAGCCCAGGCCATG 627
|.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 963 AACTCAGTGATGACCGTCGCTATGACTTCTTCTCTCGCGTGGTCCCACCTGATTCCTTCCAAGCCCAAGCTATG 1036
Query 628 GTAGACATTGTAAAGGCCCTAGGCTGGAATTATGTGTCTACCCTCGCATCGGAAGGAAGTTATGGAGAGAAAGG 701
|||||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1037 GTAGACATTGTAAAGGCATTGGGCTGGAATTATGTATCTACTCTTGCATCTGAAGGAAGCTATGGAGAGAAAGG 1110
Query 702 TGTGGAGTCCTTCACGCAGATTTCCAAAGAGGCAGGTGGACTCTGCATTGCCCAGTCCGTGAGAATCCCCCAGG 775
|||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1111 TGTGGAGTCCTTCACACAAATTTCCAAAGAAGCAGGTGGACTCTGCATTGCCCAGTCCGTGAGAATTCCCCAAG 1184
Query 776 AACGCAAAGACAGGACCATTGACTTTGATAGAATTATCAAACAGCTCCTGGACACCCCCAACTCCAGGGCCGTC 849
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1185 AACGCAAAGACAGGACCATTGACTTTGATAGAATTATCAAACAGCTCTTGGACACCCCCAACTCCAGGGCTGTC 1258
Query 850 GTGATTTTTGCCAACGATGAGGATATAAAGCAGATCCTTGCAGCAGCCAAAAGAGCTGACCAAGTTGGCCATTT 923
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1259 GTGATTTTTGCCAACGATGAGGATATAAAGCAGATCCTTGCAGCAGCCAAAAGAGCTGACCAAGTAGGACATTT 1332
Query 924 TCTTTGGGTGGGATCAGACAGCTGGGGATCCAAAATAAACCCACTGCACCAGCATGAAGATATCGCAGAAGGGG 997
|||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1333 TCTCTGGGTTGGGTCAGACAGCTGGGGTTCCAAAATCAACCCACTGCATCAGCATGAAGATATTGCAGAAGGAG 1406
Query 998 CCATCACCATTCAGCCCAAGCGAGCCACGGTGGAAGGGTTTGATGCCTACTTTACGTCCCGTACACTTGAAAAC 1071
||||||||||.||.||.|||.||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1407 CCATCACCATCCAACCTAAGAGAGCGACTGTGGAAGGATTTGATGCTTACTTCACATCCCGGACACTTGAAAAC 1480
Query 1072 AACAGAAGAAATGTATGGTTTGCCGAATACTGGGAGGAAAACTTCAACTGCAAGTTGACGATTAGTGGGTCAAA 1145
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 1481 AACAGGAGAAATGTATGGTTTGCCGAATACTGGGAAGAAAACTTCAACTGCAAGTTGACAATTAGTGGATCCAA 1554
Query 1146 AAAAGAAGACACAGATCGCAAATGCACAGGACAGGAGAGAATTGGAAAAGATTCCAACTATGAGCAGGAGGGTA 1219
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1555 AAAAGAAGACACGGATCGCAAATGCACAGGACAGGAGCGAATTGGAAAAGACTCTAATTATGAGCAGGAGGGTA 1628
Query 1220 AAGTCCAGTTCGTGATTGACGCAGTCTATGCTATGGCTCACGCCCTTCACCACATGAACAAGGATCTCTGTGCT 1293
||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1629 AAGTACAGTTTGTGATCGATGCTGTCTATGCCATGGCACATGCCCTTCATCACATGAATAAGGATCTGTGTGCT 1702
Query 1294 GACTACCGGGGTGTCTGCCCAGAGATGGAGCAAGCTGGAGGCAAGAAGTTGCTGAAGTATATACGCAATGTTAA 1367
|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||.||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1703 GACTACCGGGGAGTGTGCCCAGAAATGGAGCAAGCAGGGGGCAAGAAGTTGTTGAAGTATATCCGCAATGTTAA 1776
Query 1368 TTTCAATGGTAGTGCTGGCACTCCAGTGATGTTTAACAAGAACGGGGATGCACCTGGGCGTTATGACATCTTTC 1441
.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|
Sbjct 1777 CTTCAATGGTAGTGCTGGAACCCCAGTGATGTTTAACAAAAATGGTGATGCTCCAGGACGATATGACATCTTCC 1850
Query 1442 AGTACCAGACCACAAACACCAGCAACCCGGGTTACCGTCTGATCGGGCAGTGGACAGACGAACTTCAGCTCAAT 1515
||||||||||.||||||||.|.|||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1851 AGTACCAGACAACAAACACTACCAATCCTGGTTATCGTCTCATTGGGCAGTGGACAGATGAACTGCAGCTCAAT 1924
Query 1516 ATAGAAGACATGCAGTGGGGTAAAGGAGTCCGAGAGATACCCGCCTCAGTGTGCACACTACCATGTAAGCCAGG 1589
|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||..||||.|||||||||.|.|||||.|||||.||
Sbjct 1925 ATAGAGGACATGCAGTGGGGCAAAGGAGTCCGGGAGATCCCACCCTCTGTGTGCACATTGCCATGCAAGCCTGG 1998
Query 1590 ACAGAGAAAGAAGACACAGAAAGGAACTCCTTGCTGTTGGACCTGTGAGCCTTGCGATGGTTACCAGTACCAGT 1663
.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1999 GCAGAGGAAGAAGACACAGAAGGGAACCCCTTGCTGCTGGACTTGTGAGCCCTGTGATGGATACCAGTATCAAT 2072
Query 1664 TTGATGAGATGACATGCCAGCATTGCCCCTATGACCAGAGGCCCAATGAAAATCGAACCGGATGCCAGGATATT 1737
||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||.|.||.
Sbjct 2073 TTGATGAGATGACATGTCAGCATTGTCCCTATGACCAGAGGCCCAATGAGAACCGAACTGGCTGTCAGAACATC 2146
Query 1738 CCCATCATCAAACTGGAGTGGCACTCCCCCTGGGCTGTGATTCCTGTCTTCCTGGCAATGTTGGGGATCATTGC 1811
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CCAATCATCAAACTGGAGTGGCACTCCCCCTGGGCTGTAATTCCTGTCTTCCTGGCAATGTTGGGGATCATTGC 2220
Query 1812 CACCATCTTTGTCATGGCCACTTTCATCCGCTACAATGACACGCCCATTGTCCGGGCATCTGGGCGGGAACTCA 1885
||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CACCATCTTTGTCATGGCAACCTTCATCCGCTACAATGATACACCCATCGTCAGGGCATCTGGGCGGGAACTCA 2294
Query 1886 GCTATGTTCTTTTGACGGGCATCTTTCTTTGCTACATCATCACTTTCCTGATGATTGCCAAACCAGATGTGGCA 1959
||||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2295 GCTATGTTTTATTGACAGGCATCTTTCTCTGCTATATCATCACCTTCCTAATGATTGCCAAGCCAGATGTGGCA 2368
Query 1960 GTGTGTTCTTTCCGGCGAGTTTTCTTGGGCTTGGGTATGTGCATCAGTTATGCAGCCCTCTTGACGAAAACAAA 2033
||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||
Sbjct 2369 GTGTGTTCCTTCCGACGTGTCTTCTTGGGGTTGGGTATGTGTATTAGTTATGCAGCCCTTTTAACAAAAACCAA 2442
Query 2034 TCGGATTTATCGCATATTTGAGCAGGGCAAGAAATCAGTAACAGCTCCCAGACTCATAAGCCCAACATCACAAC 2107
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 TCGGATTTATCGCATATTCGAGCAGGGCAAGAAATCGGTGACAGCTCCCAGACTCATAAGCCCAACATCACAAC 2516
Query 2108 TGGCAATCACTTCCAGTTTAATATCAGTTCAGCTTCTAGGGGTGTTCATTTGGTTTGGTGTTGATCCACCCAAC 2181
|||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 2517 TGGCAATTACCTCCAGTTTAATATCGGTGCAACTTCTAGGTGTCTTTATTTGGTTTGGGGTTGACCCACCCAAC 2590
Query 2182 ATCATCATAGACTATGATGAACACAAGACAATGAACCCTGAGCAAGCCAGAGGGGTTCTCAAGTGTGACATTAC 2255
||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 2591 ATCATCATAGACTACGATGAGCATAAGACAATGAACCCAGAACAAGCCAGGGGAGTTCTCAAATGTGACATCAC 2664
Query 2256 AGATCTCCAAATCATTTGCTCCTTGGGATATAGCATTCTTCTCATGGTCACATGTACTGTGTATGCCATCAAGA 2329
|||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AGACCTTCAGATCATTTGTTCTTTGGGATATAGCATTCTTCTCATGGTCACATGTACTGTGTATGCCATCAAGA 2738
Query 2330 CTCGGGGTGTACCCGAGAATTTTAACGAAGCCAAGCCCATTGGATTCACTATGTACACGACATGTATAGTATGG 2403
|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2739 CTCGGGGTGTACCAGAGAATTTTAATGAAGCCAAGCCCATTGGATTCACTATGTACACGACTTGTATCGTATGG 2812
Query 2404 CTTGCCTTCATTCCAATTTTTTTTGGCACCGCTCAATCAGCGGAAAAGCTCTACATACAAACTACCACGCTTAC 2477
|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2813 CTTGCCTTCATCCCAATATTTTTTGGCACAGCGCAATCAGCAGAAAAGCTCTACATACAAACCACCACGCTTAC 2886
Query 2478 AATCTCCATGAACCTAAGTGCATCAGTGGCGCTGGGGATGCTATACATGCCGAAAGTGTACATCATCATTTTCC 2551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 AATCTCCATGAACCTAAGTGCATCAGTGGCGCTGGGGATGCTATACATGCCGAAAGTGTACATCATCATTTTCC 2960
Query 2552 ACCCTGAACTCAATGTCCAGAAACGGAAGCGAAGCTTCAAGGCGGTAGTCACAGCAGCCACCATGTCATCGAGG 2625
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 ACCCTGAACTCAATGTCCAGAAACGGAAGCGAAGCTTCAAGGCCGTAGTCACAGCAGCCACCATGTCATCGAGG 3034
Query 2626 CTGTCACACAAACCCAGTGACAGACCCAACGGTGAGGCAAAGACCGAGCTCTGTGAAAACGTAGACCCAAACAG 2699
|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||.
Sbjct 3035 CTGTCACACAAACCCAGTGACAGGCCCAATGGTGAGGCAAAGACAGAACTTTGTGAAAATGTAGACCCAAACAA 3108
Query 2700 C------CCTGCTGCAAAAAAGAAGT------ATGTCAGTTATAATAACCTGGT----TATC------------ 2745
| ||..|.|.||.|||| ||| |.|||.| ||||.|||| ||||
Sbjct 3109 CTGTATACCACCAGTAAGAAAG-AGTGTACAAAAGTCCG------TAACTTGGTACACTATCCCACCAACAGTA 3175
Query 2746 -------------------------------------------------------------------------- 2745
Sbjct 3176 TAGCTTTTGACTGCTTTCCAAAAGTCACATATGAACTTGGCAGTTCCCACTGGCGGTGCGTTTGAGATGGCAAT 3249
Query 2746 -------------------------------------------------------------------------- 2745
Sbjct 3250 ATGGCTCAGTGGTTAACAGCAATCACTTCTCTGGCAGAGGACATGGGTTCACTTCCTAGAACCCACATGGTAAC 3323
Query 2746 -------------------------------------------------------------------------- 2745
Sbjct 3324 TCACAACCACATATATCTTCTGGCATAGTGGGCCCAATACCCATTTCTAGTCACTGTGGACTGTCACATGCATA 3397
Query 2746 -------------------------------------------------------------------------- 2745
Sbjct 3398 CTGCACACTCAGACTTACTCAGGCTCACACACATATATCAAGTTTAAAATGTAATGTTTTTAGAGTTTTCTTTG 3471
Query 2746 -------------------------------------------------------------------------- 2745
Sbjct 3472 GTGGATAACTGGTAGCTTTCTAATCACCTGAGTGGGTTTTTTTTTTTCCAGAGACAGTCATTGAAGACAAGTTT 3545
Query 2746 -------------------------------------------------------------------------- 2745
Sbjct 3546 TGTCTTTTAGAACCAAATGTCATTTTAATTTAAAAAGAAAAATGTGTGTTCTTAGCCAAGGTCAGCTTATTTCT 3619
Query 2746 -------------------------------------------------------------------------- 2745
Sbjct 3620 TAAAATTCTCTCCTATCCAAGTGCTATGAGGAAGGCTCATCTCAAAATTCAACTGATGATTCTTTTCTGGTTTC 3693
Query 2746 -------------------------------------------------------------------------- 2745
Sbjct 3694 TAACTACTAAAGATGTACCTCACCTTTGCAGATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCT 3767
Query 2746 -------------------------------------------------------------------------- 2745
Sbjct 3768 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAACTGAAGCTTGGACACAT 3841
Query 2746 -------------------------------------------------------------------------- 2745
Sbjct 3842 GTTAAGTTAACTTTCTCTTGGAATCACAGAGCATCTCCAAGGTCTCAACTTGTACAAGGAGGGTGCTAGAGCAA 3915
Query 2746 -------------------------------------------------------------------------- 2745
Sbjct 3916 TTTCCCACCCACTGGTGTTCTTGCTTAGCTGACCCAAACCCTTAGATGATTTTAATGTGAACAACTACTTCACA 3989
Query 2746 -------------------------------------------------------------------------- 2745
Sbjct 3990 TCGGAACGAGTGAAGGATACTGCAACTTGCTCACTCCCCTATTGGCTGTTTTGTCTGCATCTTCTTTCTGTAAC 4063
Query 2746 -------------------------------------------------------------------------- 2745
Sbjct 4064 ACTCCCATAATAAGTTTGTGTCAAACAATCCTCTTGCATCTGATTTTTGTCTGGAAAAAAACCTGTGAGATTTT 4137
Query 2746 --------------------------------------- 2745
Sbjct 4138 CAGATGGAAATATCAATAAACCACATGACCTGTCTTCAA 4176
