Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489471
• Subject: XM_030254519.1
• Aligned Length: 1163
• Identities: 883
• Gaps: 22

Alignment

Query    1  ATGAGCAGAAGCAAGCGT-GACAACAATTTTTATAGTGTAGAGATTGGAGATTCTACATTCACAGTCCTGAAAC  73
            |||||||.||||||| || ||||||.|.||.||.|||||.||..|.||.||.||.||.|||||.||.||.||.|
Sbjct    1  ATGAGCAAAAGCAAG-GTGGACAACCAGTTCTACAGTGTGGAAGTGGGGGACTCAACCTTCACCGTTCTTAAGC  73

Query   74  GATATCAGAATTTAAAACCTATAGGCTCAGGAGCTCAAGGAATAGTATGCGCAGCTTATGATGCCATTCTTGAA  147
            |.||.|||||..|.||.||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.||.||.||.||..|.|||||.
Sbjct   74  GCTACCAGAACCTGAAGCCAATTGGCTCTGGGGCTCAGGGAATAGTCTGTGCTGCGTACGACGCTGTCCTTGAC  147

Query  148  AGAAATGTTGCAATCAAGAAGCTAAGCCGACCATTTCAGAATCAGACTCATGCCAAGCGGGCCTACAGAGAGCT  221
            ||||||||.||.||.||||||||.|||.||||.||.|||||.||.|||||.||||||.||||.|||.|.|||||
Sbjct  148  AGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTTCCAGAACCAAACTCACGCCAAGAGGGCTTACCGGGAGCT  221

Query  222  AGTTCTTATGAAATGTGTTAATCACAAAAATATAATTGGCCTTTTGAATGTTTTCACACCACAGAAATCCCTAG  295
            .||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.|||.||.|.||.||||||||.|||||.||||||.|.||.|
Sbjct  222  GGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTATTAGCTTATTAAATGTTTTTACACCCCAGAAAACACTGG  295

Query  296  AAGAATTTCAAGATGTTTACATAGTCATGGAGCTCATGGATGCAAATCTTTGCCAAGTGATTCAGATGGAGCTA  369
            |.||.||.||||||||.|||.||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  296  AGGAGTTCCAAGATGTCTACTTAGTGATGGAACTGATGGACGCCAACCTGTGTCAGGTGATTCAGATGGAGCTG  369

Query  370  GATCATGAAAGAATGTCCTACCTTCTCTATCAGATGCTGTGTGGAATCAAGCACCTTCATTCTGCTGGAATTAT  443
            ||.||.||..|.|||||.|||.|.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||
Sbjct  370  GACCACGAGCGGATGTCTTACTTGCTGTACCAGATGCTGTGTGGCATCAAGCACCTCCACTCCGCTGGGATCAT  443

Query  444  TCATCGGGACTTAAAGCCCAGTAATATAGTAGTAAAATCTGATTGCACTTTGAAGATTCTTGACTTCGGTCTGG  517
            .||..||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||..||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct  444  CCACAGGGACTTAAAACCCAGTAACATTGTAGTCAAGTCTGATTGCACACTGAAAATCCTCGACTTCGGACTGG  517

Query  518  CCAGGACTGCAGGAACGAGTTTTATGATGACGCCTTATGTAGTGACTCGCTACTACAGAGCACCCGAGGTCATC  591
            |||||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||||||
Sbjct  518  CCAGGACAGCGGGTACAAGCTTCATGATGACTCCGTATGTGGTGACGCGATATTACAGAGCCCCTGAGGTCATC  591

Query  592  CTTGGCATGGGCTACAAGGAAAACGTGGATTTATGGTCTGTGGGGTGCATTATGGGAGAAATGGTTTGCCACAA  665
            ||.|||||||||||||||||.|||||.||..|.|||||.||.||||||||.||||||||||||||       ||
Sbjct  592  CTGGGCATGGGCTACAAGGAGAACGTTGACCTGTGGTCAGTAGGGTGCATCATGGGAGAAATGGT-------AA  658

Query  666  AA-------TCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGATCAGTGGAATAAAGTTATTGAACAGCTTGGAACACCA  732
            ||       |.||.||.||.||.|..||..|||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||.
Sbjct  659  AAGGCACAGTGCTGTTCCCTGGCACTGATCATATTGACCAGTGGAACAAAGTCATCGAGCAGCTAGGAACTCCG  732

Query  733  TGTCCTGAATTCATGAAGAAACTGCAACCAACAGTAAGGACTTACGTTGAAAACAGACCTAAATATGCTGGATA  806
            |||||.||.||||||||||||.||||.||.|||||.||.|..|||||.||.||..|.||.||.||.||.|||..
Sbjct  733  TGTCCAGAGTTCATGAAGAAATTGCAGCCCACAGTCAGAAACTACGTGGAGAATCGGCCCAAGTACGCAGGACT  806

Query  807  TAGCTTTGAGAAACTCTTCCCTGATGTCCTTTTCCCAGCTGACTCAGAACACAACAAACTTAAAGCCAGTCAGG  880
            .|.|||....||.|||||.||.|||..|||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct  807  CACCTTCCCCAAGCTCTTTCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGATTCTGAGCACAATAAACTTAAAGCCAGCCAAG  880

Query  881  CAAGGGATTTGTTATCCAAAATGCTGGTAATAGATGCATCTAAAAGGATCTCTGTAGATGAAGCTCTCCAACAC  954
            |.|||||||||||.||.||.|||.|.||.||.||..||.|.||.|||||.||.||.||.||.||.||.||.||.
Sbjct  881  CCAGGGATTTGTTGTCTAAGATGTTAGTGATTGACCCAGCGAAGAGGATATCGGTGGACGACGCACTGCAGCAT  954

Query  955  CCGTACATCAATGTCTGGTATGATCCTTCTGAAGCAGAAGCTCCACCACCAAAGATCCCTGACAAGCAGTTAGA  1028
            |||||||||||.||.|||||.||.||..||||||..||.||.||.||.||..||||...|||.||||||.|.||
Sbjct  955  CCGTACATCAACGTTTGGTACGACCCGGCTGAAGTGGAGGCGCCTCCGCCTCAGATATATGATAAGCAGCTGGA  1028

Query 1029  TGAAAGGGAACACACAATAGAAGAGTGGAAAGAATTGATATATAAGGAAGTTATGGACTTGGAGGAGAGAACCA  1102
            |||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||.|.||.||.|||||.||.|||.|||..||.||||..||.|
Sbjct 1029  TGAAAGGGAGCACACCATCGAAGAATGGAAAGAACTTATCTACAAGGAGGTAATGAACTCAGAAGAGAAGACTA  1102

Query 1103  AGAATGG---AGTTATACGGGGGCAGCCCTCTCCTTTAGCACAGGTGCAGCAG  1152
            |||||||   |||.|.|   ||.||||||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct 1103  AGAATGGCGTAGTCAAA---GGCCAGCCCTCGCCTTCAGCACAGGTGCAGCAG  1152