Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489537
- Subject:
- XM_006716440.3
- Aligned Length:
- 3400
- Identities:
- 2579
- Gaps:
- 820
Alignment
Query 1 ATGAAGTATTCTTGCTGTGCTCTGGTTTTGGCTGTCCTGGGCACAGAATTGCTGGGAAGCCTCTGTTCGACTGT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGTATTCTTGCTGTGCTCTGGTTTTGGCTGTCCTGGGCACAGAATTGCTGGGAAGCCTCTGTTCGACTGT 74
Query 75 CAGATCCCCGAGGTTCAGAGGACGGATACAGCAGGAACGAAAAAACATCCGACCCAACATTATTCTTGTGCTTA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGATCCCCGAGGTTCAGAGGACGGATACAGCAGGAACGAAAAAACATCCGACCCAACATTATTCTTGTGCTTA 148
Query 149 CCGATGATCAAGATGTGGAGCTGGGGTCCCTGCAAGTCATGAACAAAACGAGAAAGATTATGGAACATGGGGGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCGATGATCAAGATGTGGAGCTGGGGTCCCTGCAAGTCATGAACAAAACGAGAAAGATTATGGAACATGGGGGG 222
Query 223 GCCACCTTCATCAATGCCTTTGTGACTACACCCATGTGCTGCCCGTCACGGTCCTCCATGCTCACCGGGAAGTA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCCACCTTCATCAATGCCTTTGTGACTACACCCATGTGCTGCCCGTCACGGTCCTCCATGCTCACCGGGAAGTA 296
Query 297 TGTGCACAATCACAATGTCTACACCAACAACGAGAACTGCTCTTCCCCCTCGTGGCAGGCCATGCATGAGCCTC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGTGCACAATCACAATGTCTACACCAACAACGAGAACTGCTCTTCCCCCTCGTGGCAGGCCATGCATGAGCCTC 370
Query 371 GGACTTTTGCTGTATATCTTAACAACACTGGCTACAGAACAGCCTTTTTTGGAAAATACCTCAATGAATATAAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGACTTTTGCTGTATATCTTAACAACACTGGCTACAGAACAGCCTTTTTTGGAAAATACCTCAATGAATATAAT 444
Query 445 GGCAGCTACATCCCCCCTGGGTGGCGAGAATGGCTTGGATTAATCAAGAATTCTCGCTTCTATAATTACACTGT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCAGCTACATCCCCCCTGGGTGGCGAGAATGGCTTGGATTAATCAAGAATTCTCGCTTCTATAATTACACTGT 518
Query 519 TTGTCGCAATGGCATCAAAGAAAAGCATGGATTTGATTATGCAAAGGACTACTTCACAGACTTAATCACTAACG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TTGTCGCAATGGCATCAAAGAAAAGCATGGATTTGATTATGCAAAGGACTACTTCACAGACTTAATCACTAACG 592
Query 593 AGAGCATTAATTACTTCAAAATGTCTAAGAGAATGTATCCCCATAGGCCCGTTATGATGGTGATCAGCCACGCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGAGCATTAATTACTTCAAAATGTCTAAGAGAATGTATCCCCATAGGCCCGTTATGATGGTGATCAGCCACGCT 666
Query 667 GCGCCCCACGGCCCCGAGGACTCAGCCCCACAGTTTTCTAAACTGTACCCCAATGCTTCCCAACACATAACTCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCGCCCCACGGCCCCGAGGACTCAGCCCCACAGTTTTCTAAACTGTACCCCAATGCTTCCCAACACATAACTCC 740
Query 741 TAGTTATAACTATGCACCAAATATGGATAAACACTGGATTATGCAGTACACAGGACCAATGCTGCCCATCCACA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TAGTTATAACTATGCACCAAATATGGATAAACACTGGATTATGCAGTACACAGGACCAATGCTGCCCATCCACA 814
Query 815 TGGAATTTACAAACATTCTACAGCGCAAAAGGCTCCAGACTTTGATGTCAGTGGATGATTCTGTGGAGAGGCTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGAATTTACAAACATTCTACAGCGCAAAAGGCTCCAGACTTTGATGTCAGTGGATGATTCTGTGGAGAGGCTG 888
Query 889 TATAACATGCTCGTGGAGACGGGGGAGCTGGAGAATACTTACATCATTTACACCGCCGACCATGGTTACCATAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TATAACATGCTCGTGGAGACGGGGGAGCTGGAGAATACTTACATCATTTACACCGCCGACCATGGTTACCATAT 962
Query 963 TGGGCAGTTTGGACTGGTCAAGGGGAAATCCATGCCATATGACTTTGATATTCGTGTGCCTTTTTTTATTCGTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGGGCAGTTTGGACTGGTCAAGGGGAAATCCATGCCATATGACTTTGATATTCGTGTGCCTTTTTTTATTCGTG 1036
Query 1037 GTCCAAGTGTAGAACCAGGATCAATAGTCCCACAGATCGTTCTCAACATTGACTTGGCCCCCACGATCCTGGAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTCCAAGTGTAGAACCAGGATCAATAGTCCCACAGATCGTTCTCAACATTGACTTGGCCCCCACGATCCTGGAT 1110
Query 1111 ATTGCTGGGCTCGACACACCTCCTGATGTGGACGGCAAGTCTGTCCTCAAACTTCTGGACCCAGAAAAGCCAGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATTGCTGGGCTCGACACACCTCCTGATGTGGACGGCAAGTCTGTCCTCAAACTTCTGGACCCAGAAAAGCCAGG 1184
Query 1185 TAACAGGTTTCGAACAAACAAGAAGGCCAAAATTTGGCGTGATACATTCCTAGTGGAAAGAGGCAAATTTCTAC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TAACAGGTTTCGAACAAACAAGAAGGCCAAAATTTGGCGTGATACATTCCTAGTGGAAAGAGGCAAATTTCTAC 1258
Query 1259 GTAAGAAGGAAGAATCCAGCAAGAATATCCAACAGTCAAATCACTTGCCCAAATATGAACGGGTCAAAGAACTA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTAAGAAGGAAGAATCCAGCAAGAATATCCAACAGTCAAATCACTTGCCCAAATATGAACGGGTCAAAGAACTA 1332
Query 1333 TGCCAGCAGGCCAGGTACCAGACAGCCTGTGAACAACCGGGGCAGAAGTGGCAATGCATTGAGGATACATCTGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TGCCAGCAGGCCAGGTACCAGACAGCCTGTGAACAACCGGGGCAGAAGTGGCAATGCATTGAGGATACATCTGG 1406
Query 1407 CAAGCTTCGAATTCACAAGTGTAAAGGACCCAGTGACCTGCTCACAGTCCGGCAGAGCACGCGGAACCTCTACG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAAGCTTCGAATTCACAAGTGTAAAGGACCCAGTGACCTGCTCACAGTCCGGCAGAGCACGCGGAACCTCTACG 1480
Query 1481 CTCGCGGCTTCCATGACAAAGACAAAGAGTGCAGTTGTAGGGAGTCTGGTTACCGTGCCAGCAGAAGCCAAAGA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTCGCGGCTTCCATGACAAAGACAAAGAGTGCAGTTGTAGGGAGTCTGGTTACCGTGCCAGCAGAAGCCAAAGA 1554
Query 1555 AAGAGTCAACGGCAATTCTTGAGAAACCAGGGGACTCCAAAGTACAAGCCCAGATTTGTCCATACTCGGCAGAC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AAGAGTCAACGGCAATTCTTGAGAAACCAGGGGACTCCAAAGTACAAGCCCAGATTTGTCCATACTCGGCAGAC 1628
Query 1629 ACGTTCCTTGTCCGTCGAATTTGAAGGTGAAATATATGACATAAATCTGGAAGAAGAAGAAGAATTGCAAGTGT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ACGTTCCTTGTCCGTCGAATTTGAAGGTGAAATATATGACATAAATCTGGAAGAAGAAGAAGAATTGCAAGTGT 1702
Query 1703 TGCAACCAAGAAACATTGCTAAGCGTCATGATGAAGGCCACAAGGGGCCAAGAGATCTCCAGGCTTCCAGTGGT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGCAACCAAGAAACATTGCTAAGCGTCATGATGAAGGCCACAAGGGGCCAAGAGATCTCCAGGCTTCCAGTGGT 1776
Query 1777 GGCAACAGGGGCAGGATGCTGGCAGATAGCAGCAACGCCGTGGGCCCACCTACCACTGTCCGAGTGACACACAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GGCAACAGGGGCAGGATGCTGGCAGATAGCAGCAACGCCGTGGGCCCACCTACCACTGTCCGAGTGACACACAA 1850
Query 1851 GTGTTTTATTCTTCCCAATGACTCTATCCATTGTGAGAGAGAACTGTACCAATCGGCCAGAGCGTGGAAGGACC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GTGTTTTATTCTTCCCAATGACTCTATCCATTGTGAGAGAGAACTGTACCAATCGGCCAGAGCGTGGAAGGACC 1924
Query 1925 ATAAGGCATACATTGACAAAGAGATTGAAGCTCTGCAAGATAAAATTAAGAATTTAAGAGAAGTGAGAGGACAT 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ATAAGGCATACATTGACAAAGAGATTGAAGCTCTGCAAGATAAAATTAAGAATTTAAGAGAAGTGAGAGGACAT 1998
Query 1999 CTGAAGAGAAGGAAGCCTGAGGAATGTAGCTGCAGTAAACAAAGCTATTACAATAAAGAGAAAGGTGTAAAAAA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTGAAGAGAAGGAAGCCTGAGGAATGTAGCTGCAGTAAACAAAGCTATTACAATAAAGAGAAAGGTGTAAAAAA 2072
Query 2073 GCAAGAGAAATTAAAGAGCCATCTTCACCCATTCAAGGAGGCTGCTCAGGAAGTAGATAGCAAACTGCAACTTT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GCAAGAGAAATTAAAGAGCCATCTTCACCCATTCAAGGAGGCTGCTCAGGAAGTAGATAGCAAACTGCAACTTT 2146
Query 2147 TCAAGGAGAACAACCGTAGGAGGAAGAAGGAGAGGAAGGAGAAGAGACGGCAGAGGAAGGGGGAAGAGTGCAGC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TCAAGGAGAACAACCGTAGGAGGAAGAAGGAGAGGAAGGAGAAGAGACGGCAGAGGAAGGGGGAAGAGTGCAGC 2220
Query 2221 CTGCCTGGCCTCACTTGCTTCACGCATGACAACAACCACTGGCAGACAGCCCCGTTCTGGAACCTGGGATCTTT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTGCCTGGCCTCACTTGCTTCACGCATGACAACAACCACTGGCAGACAGCCCCGTTCTGGAACCTGGGATCTTT 2294
Query 2295 CTGTGCTTGCACGAGTTCTAACAATAACACCTACTGGTGTTTGCGTACAGTTAATGAGACGCATAATTTTCTTT 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CTGTGCTTGCACGAGTTCTAACAATAACACCTACTGGTGTTTGCGTACAGTTAATGAGACGCATAATTTTCTTT 2368
Query 2369 TCTGTGAGTTTGCTACTGGCTTTTTGGAGTATTTTGATATGAATACAGATCCTTATCAGCTCACAAATACAGTG 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TCTGTGAGTTTGCTACTGGCTTTTTGGAGTATTTTGATATGAATACAGATCCTTATCAGCTCACAAATACAGTG 2442
Query 2443 CACACGGTAGAACGAGGCATTTTGAATCAGCTACACGTACAACTAATGGAGCTCAGAAGCTGTCAAGGATATAA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CACACGGTAGAACGAGGCATTTTGAATCAGCTACACGTACAACTAATGGAGCTCAGAAGCTGTCAAGGATATAA 2516
Query 2517 GCAGTGCAACCCAAGACCTAAGAATCTTGATGTTGGAAATAAAGATGGAGGAAGCTATGACCTACACAGAGGAC 2590
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 2517 GCAGTGCAACCCAAGACCTAAGAATCTTGATGTT----------------------------------GAGGAC 2556
Query 2591 AGTTATGGGATGGATGGGAAGGTG-------------------------------------------------- 2614
|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2557 AGTTATGGGATGGATGGGAAGGTTAATCAGCCCCGTCTCACTGCAGACATCAACTGGCAAGGCCTAGAGGAGCT 2630
Query 2615 -------------------------------------------------------------------------- 2614
Sbjct 2631 ACACAGTGTGAATGAAAACATCTATGAGTACAGACAAAACTACAGACTTAGTCTGGTGGACTGGACTAATTACT 2704
Query 2615 -------------------------------------------------------------------------- 2614
Sbjct 2705 TGAAGGATTTAGATAGAGTATTTGCACTGCTGAAGAGTCACTATGAGCAAAATAAAACAAATAAGACTCAAACT 2778
Query 2615 -------------------------------------------------------------------------- 2614
Sbjct 2779 GCTCAAAGTGACGGGTTCTTGGTTGTCTCTGCTGAGCACGCTGTGTCAATGGAGATGGCCTCTGCTGACTCAGA 2852
Query 2615 -------------------------------------------------------------------------- 2614
Sbjct 2853 TGAAGACCCAAGGCATAAGGTTGGGAAAACACCTCATTTGACCTTGCCAGCTGACCTTCAAACCCTGCATTTGA 2926
Query 2615 -------------------------------------------------------------------------- 2614
Sbjct 2927 ACCGACCAACATTAAGTCCAGAGAGTAAACTTGAATGGAATAACGACATTCCAGAAGTTAATCATTTGAATTCT 3000
Query 2615 -------------------------------------------------------------------------- 2614
Sbjct 3001 GAACACTGGAGAAAAACCGAAAAATGGACGGGGCATGAAGAGACTAATCATCTGGAAACCGATTTCAGTGGCGA 3074
Query 2615 -------------------------------------------------------------------------- 2614
Sbjct 3075 TGGCATGACAGAGCTAGAGCTCGGGCCCAGCCCCAGGCTGCAGCCCATTCGCAGGCACCCGAAAGAACTTCCCC 3148
Query 2615 -------------------------------------------------------------------------- 2614
Sbjct 3149 AGTATGGTGGTCCTGGAAAGGACATTTTTGAAGATCAACTATATCTTCCTGTGCATTCCGATGGAATTTCAGTT 3222
Query 2615 -------------------------------------------------------------------------- 2614
Sbjct 3223 CATCAGATGTTCACCATGGCCACCGCAGAACACCGAAGTAATTCCAGCATAGCGGGGAAGATGTTGACCAAGGT 3296
Query 2615 ---------------------------------------------------------------------- 2614
Sbjct 3297 GGAGAAGAATCACGAAAAGGAGAAGTCACAGCACCTAGAAGGCAGCGCCTCCTCTTCACTCTCCTCTGAT 3366