Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489543
• Subject: XM_005253601.2
• Aligned Length: 1401
• Identities: 1301
• Gaps: 99

Alignment

Query    1  ATGATTTTATTTTGACTGATAGTGACCTGTTCGTTGCAACAAATTGATGAGCAATGCTTTTTTATAATGCCAAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TTTGTACAAAAAAGCAGGCACCATGGCGGCTAGTGATACAGAGCGAGATGGACTAGCCCCAGAAAAGACATCAC  148
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------ATGGCGGCTAGTGATACAGAGCGAGATGGACTAGCCCCAGAAAAGACATCAC  52

Query  149  CAGATAGAGATAAGAAAAAAGAGCAGTCAGAAGTATCTGTTTCTCCTAGAGCTTCAAAACATCATTATTCAAGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   53  CAGATAGAGATAAGAAAAAAGAGCAGTCAGAAGTATCTGTTTCTCCTAGAGCTTCAAAACATCATTATTCAAGA  126

Query  223  TCACGATCAAGGTCAAGAGAAAGAAAACGAAAGTCAGATAATGAAGGAAGAAAACACAGGAGCCGGAGCAGAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  127  TCACGATCAAGGTCAAGAGAAAGAAAACGAAAGTCAGATAATGAAGGAAGAAAACACAGGAGCCGGAGCAGAAG  200

Query  297  CAAAGAGGGAAGAAGACATGAATCCAAAGATAAATCCTCTAAGAAACATAAGTCTGAGGAACATAATGACAAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  201  CAAAGAGGGAAGAAGACATGAATCCAAAGATAAATCCTCTAAGAAACATAAGTCTGAGGAACATAATGACAAAG  274

Query  371  AACATTCTTCTGATAAAGGAAGAGAGCGACTAAATTCATCTGAAAATGGTGAGGACAGGCACAAACGCAAAGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  275  AACATTCTTCTGATAAAGGAAGAGAGCGACTAAATTCATCTGAAAATGGTGAGGACAGGCACAAACGCAAAGAA  348

Query  445  AGAAAGTCATCAAGAGGCAGAAGTCACTCAAGATCTAGGTCTCGTGAAAGACGCCATCGTAGTAGAAGCAGGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  349  AGAAAGTCATCAAGAGGCAGAAGTCACTCAAGATCTAGGTCTCGTGAAAGACGCCATCGTAGTAGAAGCAGGGA  422

Query  519  GCGGAAGAAGTCTCGATCCAGGAGTAGGGAGCGGAAGAAATCGAGATCCAGAAGCAGAGAGAGGAAGAAATCGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  423  GCGGAAGAAGTCTCGATCCAGGAGTAGGGAGCGGAAGAAATCGAGATCCAGAAGCAGAGAGAGGAAGAAATCGA  496

Query  593  GATCCAGAAGCAGGGAAAGAAAACGGCGGATCAGGTCTCGTTCCCGCTCAAGATCAAGACACAGGCATAGGACT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  497  GATCCAGAAGCAGGGAAAGAAAACGGCGGATCAGGTCTCGTTCCCGCTCAAGATCAAGACACAGGCATAGGACT  570

Query  667  AGAAGCAGGAGTAGGACAAGGAGTAGGAGTCGAGATAGAAAGAAGAGAATTGAAAAGCCGAGAAGATTTAGCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  571  AGAAGCAGGAGTAGGACAAGGAGTAGGAGTCGAGATAGAAAGAAGAGAATTGAAAAGCCGAGAAGATTTAGCAG  644

Query  741  AAGTTTAAGCCGGACTCCAAGTCCACGTCCCTTCAGAGGCAGAAACACAGCAATGGATGCACAGGAAGCTTTAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  AAGTTTAAGCCGGACTCCAAGTCCACCTCCCTTCAGAGGCAGAAACACAGCAATGGATGCACAGGAAGCTTTAG  718

Query  815  CTAGAAGGTTGGAAAGGGCAAAGAAATTACAAGAACAGCGAGAAAAGGAAATGGTTGAAAAACAAAAACAACAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  CTAGAAGGTTGGAAAGGGCAAAGAAATTACAAGAACAGCGAGAAAAGGAAATGGTTGAAAAACAAAAACAACAA  792

Query  889  GAAATAGCT---GCAGCTGCAGCTACTGGAGGTTCTGTTCTCAATGTTGCTGCCCTGTTGGCATCAGGAACACA  959
            |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  GAAATAGCTGCAGCAGCTGCAGCTACTGGAGGTTCTGTTCTCAATGTTGCTGCCCTGTTGGCATCAGGAACACA  866

Query  960  AGTAACACCTCAGATAGCCATGGCAGCTCAGATGGCAGCCCTGCAAGCTAAAGCTTTGGCAGAGACAGGAATAG  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  AGTAACACCTCAGATAGCCATGGCAGCTCAGATGGCAGCCCTGCAAGCTAAAGCTTTGGCAGAGACAGGAATAG  940

Query 1034  CTGTTCCTAGCTACTATAACCCAGCCGCTGTTAATCCAATGAAATTTGCTGAACAAGAGAAAAAAAGGAAAATG  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  941  CTGTTCCTAGCTACTATAACCCAGCCGCTGTTAATCCAATGAAATTTGCTGAACAAGAGAAAAAAAGGAAAATG  1014

Query 1108  CTTTGGCAGGGCAAGAAAGAAGGGGACAAATCCCAATCTGCTGAAATATGGGAAAAATTGAATTTTGGAAACAA  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  CTTTGGCAGGGCAAGAAAGAAGGGGACAAATCCCAATCTGCTGAAATATGGGAAAAATTGAATTTTGGAAACAA  1088

Query 1182  GGACCAAAATGTCAAATTTAGGAAATTGATGGGTATTAAGAGTGAAGATGAAGCTGGATGTAGCTCAGTTGATG  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  GGACCAAAATGTCAAATTTAGGAAATTGATGGGTATTAAGAGTGAAGATGAAGCTGGATGTAGCTCAGTTGATG  1162

Query 1256  AAGAAAGTTACAAGACTCTGAAGCAGCAGGAAGAAGTATTTCGAAATTTAGATGCTCAGTATGAAATGGCAAGA  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  AAGAAAGTTACAAGACTCTGAAGCAGCAGGAAGAAGTATTTCGAAATTTAGATGCTCAGTATGAAATGGCAAGA  1236

Query 1330  TCACAAACCCACACACAAAGAGGAATGGGTTTGGGTTTCACATCTTCAATGCGAGGAATGGATGCAGTT  1398
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  TCACAAACCCACACACAAAGAGGAATGGGTTTGGGTTTCACATCTTCAATGCGAGGAATGGATGCAGTT  1305