Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489584
• Subject: NM_001145425.1
• Aligned Length: 1738
• Identities: 1510
• Gaps: 226

Alignment

Query    1  ATGGAGGTGAATGCAGGAGGTGTGATTGCCTATATCAGTTCTTCCAGCTCAGCCTCAAGCCATGCCTCTTGTCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAGTGAGGGTTCTGAGAATAGTTTCCAGTCCTCCTCCTCTTCTGTTCCATCTTCTCCAAATAGCTCTAATTCTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATACCAATGGTAATCCCAAGAATGGTGATCTCGCCAATATTGAAGGCATCTTGAAGAATGATCGAATAGATTGT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TCTATGAAAACAAGCAAATCGAGTGCACCTGGGATGACAAAAAGTCATAGTGGTGTGACAAAATTTAGTGGCAT  296
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---ATGAAAACAAGCAAATCGAGTGCACCTGGGATGACAAAAAGTCATAGTGGTGTGACAAAATTTAGTGGCAT  71

Query  297  GGTTCTACTGTGTAAAGTCTGTGGGGATGTGGCGTCAGGATTCCACTATGGAGTTCATGCTTGCGAAGGCTGTA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   72  GGTTCTACTGTGTAAAGTCTGTGGGGATGTGGCGTCAGGATTCCACTATGGAGTTCATGCTTGCGAAGGCTGTA  145

Query  371  AGGGTTTCTTTCGGAGAAGTATTCAACAAAACATCCAGTACAAGAAGTGCCTGAAGAATGAAAACTGTTCTATA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  146  AGGGTTTCTTTCGGAGAAGTATTCAACAAAACATCCAGTACAAGAAGTGCCTGAAGAATGAAAACTGTTCTATA  219

Query  445  ATGAGAATGAATAGGAACAGATGTCAGCAATGTCGCTTCAAAAAGTGTCTGTCTGTTGGAATGTCAAGAGATGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  ATGAGAATGAATAGGAACAGATGTCAGCAATGTCGCTTCAAAAAGTGTCTGTCTGTTGGAATGTCAAGAGATGC  293

Query  519  TGTTCGGTTTGGTCGTATTCCTAAGCGTGAAAAACAGAGGATGCTAATTGAAATGCAAAGTGCAATGAAGACCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  TGTTCGGTTTGGTCGTATTCCTAAGCGTGAAAAACAGAGGATGCTAATTGAAATGCAAAGTGCAATGAAGACCA  367

Query  593  TGATGAACAGCCAGTTCAGTGGTCACTTGCAAAATGACACATTAGTAGAACATCATGAACAGACAGCCTTGCCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  TGATGAACAGCCAGTTCAGTGGTCACTTGCAAAATGACACATTAGTAGAACATCATGAACAGACAGCCTTGCCA  441

Query  667  GCCCAGGAACAGCTGCGACCCAAGCCCCAACTGGAGCAAGAAAACATCAAAAGCTCTTCTCCTCCATCTTCTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  GCCCAGGAACAGCTGCGACCCAAGCCCCAACTGGAGCAAGAAAACATCAAAAGCTCTTCTCCTCCATCTTCTGA  515

Query  741  TTTTGCAAAGGAAGAAGTGATTGGCATGGTGACCAGAGCTCACAAGGATACCTTTATGTATAATCAAGAGCAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  TTTTGCAAAGGAAGAAGTGATTGGCATGGTGACCAGAGCTCACAAGGATACCTTTATGTATAATCAAGAGCAGC  589

Query  815  AAGAAAACTCAGCTGAGAGCATGCAGCCCAAGAGAGGAGAACGGATTCGCAAGAACATGGAGCAATATAATTTA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  AAGAAAACTCAGCTGAGAGCATGCAGCCCCAGAGAGGAGAACGGATTCCCAAGAACATGGAGCAATATAATTTA  663

Query  889  AATCATGATCATTGCGGCAATGGGCTTAGCAGCCATTTTCCCTGTAGTGAGAGCCAGCAGCATCTCAATGGACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  AATCATGATCATTGCGGCAATGGGCTTAGCAGCCATTTTCCCTGTAGTGAGAGCCAGCAGCATCTCAATGGACA  737

Query  963  GTTCAAAGGGAGGAATATAATGCATTACCCAAATGGTCATGCCATTTGTATTGCAAATGGACATTGTATGAACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  GTTCAAAGGGAGGAATATAATGCATTACCCAAATGGTCATGCCATTTGTATTGCAAATGGACATTGTATGAACT  811

Query 1037  TCTCCAATGCTTATACTCAAAGAGTATGTGATAGAGTTCCGATAGATGGATTTTCTCAGAATGAGAACAAGAAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  TCTCCAATGCTTATACTCAAAGAGTATGTGATAGAGTTCCGATAGATGGATTTTCTCAGAATGAGAACAAGAAT  885

Query 1111  AGTTACCTGTGCAACACTGGAGGAAGAATGCATCTGGTTTGTCCAATGAGTAAGTCTCCATATGTGGATCCTCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  AGTTACCTGTGCAACACTGGAGGAAGAATGCATCTGGTTTGTCCAATGAGTAAGTCTCCATATGTGGATCCTCA  959

Query 1185  TAAATCAGGACATGAAATCTGGGAAGAATTTTCGATGAGCTTCACTCCAGCAGTGAAAGAAGTGGTGGAATTTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  TAAATCAGGACATGAAATCTGGGAAGAATTTTCGATGAGCTTCACTCCAGCAGTGAAAGAAGTGGTGGAATTTG  1033

Query 1259  CAAAGCGTATTCCTGGGTTCAGAGATCTCTCTCAGCATGACCAGGTCAACCTTTTAAAGGCTGGGACTTTTGAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  CAAAGCGTATTCCTGGGTTCAGAGATCTCTCTCAGCATGACCAGGTCAACCTTTTAAAGGCTGGGACTTTTGAG  1107

Query 1333  GTTTTAATGGTACGGTTCGCATCATTATTTGATGCAAAGGAACGTACTGTCACCTTTTTAAGTGGAAAGAAATA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  GTTTTAATGGTACGGTTCGCATCATTATTTGATGCAAAGGAACGTACTGTCACCTTTTTAAGTGGAAAGAAATA  1181

Query 1407  TAGTGTGGATGATTTACACTCAATGGGAGCAGGGGATCTGCTAAACTCTATGTTTGAATTTAGTGAGAAGCTAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  TAGTGTGGATGATTTACACTCAATGGGAGCAGGGGATCTGCTAAACTCTATGTTTGAATTTAGTGAGAAGCTAA  1255

Query 1481  ATGCCCTCCAACTTAGTGATGAAGAGATGAGTTTGTTTACAGCTGTTGTCCTGGTATCTGCAGATCGATCTGGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  ATGCCCTCCAACTTAGTGATGAAGAGATGAGTTTGTTTACAGCTGTTGTCCTGGTATCTGCAGATCGATCTGGA  1329

Query 1555  ATAGAAAACGTCAACTCTGTGGAGGCTTTGCAGGAAACTCTCATTCGTGCACTAAGGACCTTAATAATGAAAAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  ATAGAAAACGTCAACTCTGTGGAGGCTTTGCAGGAAACTCTCATTCGTGCACTAAGGACCTTAATAATGAAAAA  1403

Query 1629  CCATCCAAATGAGGCCTCTATTTTTACAAAACTGCTTCTAAAGTTGCCAGATCTTCGATCTTTAAACAACATGC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  CCATCCAAATGAGGCCTCTATTTTTACAAAACTGCTTCTAAAGTTGCCAGATCTTCGATCTTTAAACAACATGC  1477

Query 1703  ACTCTGAGGAGCTCTTGGCCTTTAAAGTTCACCCTG  1738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1478  ACTCTGAGGAGCTCTTGGCCTTTAAAGTTCACCCT-  1512