Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000489584
- Subject:
- NM_011584.4
- Aligned Length:
- 1738
- Identities:
- 1536
- Gaps:
- 10
Alignment
Query 1 ATGGAGGTGAATGCAGGAGGTGTGATTGCCTATATCAGTTCTTCCAGCTCAGCCTCAAGCCATGCCTCTTGTCA 74
||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||.||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGCTGAACGCAGGAGGTGTGATTGCCTACATCAGTTCCTCTAGCTCTGCCTCCAGCCCTGCCTCTTGTCA 74
Query 75 CAGTGAGGGTTCTGAGAATAGTTTCCAGTCCTCCTCCTCTTCTGTTCCATCTTCTCCAAATAGCTCTAATTCTG 148
|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 75 CAGTGAGGGTTCTGAGAATAGCTTCCAGTCCTCGTCCTCGTCTGTTCCATCTTCTCCAAATAGCTCTAACTGTG 148
Query 149 ATACCAATGGTAATCCCAAGAATGGTGATCTCGCCAATATTGAAGGCATCTTGAAGAATGATCGAATAGATTGT 222
||.||||.||.|||||||||||.|.||||.||.|.|..||.||.||..|..||||||.|||.||.|.|||||||
Sbjct 149 ATGCCAACGGCAATCCCAAGAACGCTGATATCTCTAGCATCGATGGTGTTCTGAAGAGTGACCGCACAGATTGT 222
Query 223 TCTATGAAAACAAGCAAATCGAGTGCACCTGGGATGACAAAAAGTCATAGTGGTGTGACAAAATTTAGTGGCAT 296
.||.||||||||.|||||.|.|||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||..|||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCTGTGAAAACAGGCAAAACCAGTGCTCCTGGCATGACTAAGAGTCACAGTGGAATGACAAAATTTAGTGGCAT 296
Query 297 GGTTCTACTGTGTAAAGTCTGTGGGGATGTGGCGTCAGGATTCCACTATGGAGTTCATGCTTGCGAAGGCTGTA 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 297 GGTTCTACTGTGTAAAGTCTGTGGGGATGTGGCATCAGGATTCCACTATGGAGTTCATGCTTGTGAAGGCTGTA 370
Query 371 AGGGTTTCTTTCGGAGAAGTATTCAACAAAACATCCAGTACAAGAAGTGCCTGAAGAATGAAAACTGTTCTATA 444
||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct 371 AGGGTTTCTTTCGGAGGAGCATTCAGCAAAACATCCAGTATAAGAAGTGCCTGAAGAATGAGAACTGTTCCATC 444
Query 445 ATGAGAATGAATAGGAACAGATGTCAGCAATGTCGCTTCAAAAAGTGTCTGTCTGTTGGAATGTCAAGAGATGC 518
|||||.|||||.||||||.|.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||.|||||||
Sbjct 445 ATGAGGATGAACAGGAACCGGTGCCAGCAGTGCCGCTTTAAGAAGTGTCTGTCTGTGGGGATGTCACGAGATGC 518
Query 519 TGTTCGGTTTGGTCGTATTCCTAAGCGTGAAAAACAGAGGATGCTAATTGAAATGCAAAGTGCAATGAAGACCA 592
||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGTTCGATTTGGCCGAATTCCTAAGCGTGAAAAACAGAGAATGCTAATTGAAATGCAAAGTGCAATGAAGACCA 592
Query 593 TGATGAACAGCCAGTTCAGTGGTCACTTGCAAAATGACACATTAGTAGAACATCATGAACAGACAGCCTTGCCA 666
|||||||||.||||||||||||.|||.||||.||||||||.||||.||||||.|||||.|||.||||..|.|||
Sbjct 593 TGATGAACACCCAGTTCAGTGGCCACCTGCAGAATGACACCTTAGCAGAACAGCATGATCAGTCAGCACTACCA 666
Query 667 GCCCAGGAACAGCTGCGACCCAAGCCCCAACTGGAGCAAGAAAACATCAAAAGCTCTTCTCCTCCATCTTCTGA 740
||.||||||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||.|.|| .|||||||
Sbjct 667 GCTCAGGAACAGCTGCGGCCCAAGTCCCAGCTGGAGCAAGAAAACATCAAAAACACT---------CCTTCTGA 731
Query 741 TTTTGCAAAGGAAGAAGTGATTGGCATGGTGACCAGAGCTCACAAGGATACCTTTATGTATAATCAAGAGCAGC 814
||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||.||.||.|
Sbjct 732 TTTTGCAAAGGAGGAAGTGATTGGTATGGTGACCAGAGCCCACAAGGATACCTTTCTGTATAATCAGGAACATC 805
Query 815 AAGAAAACTCAGCTGAGAGCATGCAGCCCAAGAGAGGAGAACGGATTCGCAAGAACATGGAGCAATATAATTTA 888
.||||||||||.||||||||||||..||..||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 806 GAGAAAACTCATCTGAGAGCATGCCACCTCAGAGAGGAGAACGGATTCCCAGGAACATGGAGCAATATAATTTA 879
Query 889 AATCATGATCATTGCGGCAATGGGCTTAGCAGCCATTTTCCCTGTAGTGAGAGCCAGCAGCATCTCAATGGACA 962
|||||.||.|||.|.||||.||||.||..||.|||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||
Sbjct 880 AATCAAGACCATCGTGGCAGTGGGATTCACAACCACTTCCCCTGTAGTGAGAGGCAGCAACATCTCAGTGGACA 953
Query 963 GTTCAAAGGGAGGAATATAATGCATTACCCAAATGGTCATGCCATTTGTATTGCAAATGGACATTGTATGAACT 1036
||.||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 954 GTACAAAGGGAGGAACATAATGCATTACCCAAACGGCCATGCCGTTTGTATTGCAAATGGACACTGTATGAACT 1027
Query 1037 TCTCCAATGCTTATACTCAAAGAGTATGTGATAGAGTTCCGATAGATGGATTTTCTCAGAATGAGAACAAGAAT 1110
||||||.||||||||||||||||||.|||||||||.||||..|||.|||||.||||||||.||||||||..|||
Sbjct 1028 TCTCCAGTGCTTATACTCAAAGAGTCTGTGATAGAATTCCAGTAGGTGGATGTTCTCAGACTGAGAACAGAAAT 1101
Query 1111 AGTTACCTGTGCAACACTGGAGGAAGAATGCATCTGGTTTGTCCAATGAGTAAGTCTCCATATGTGGATCCTCA 1184
|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1102 AGTTACCTGTGCAACACTGGAGGGAGGATGCATCTGGTGTGTCCTATGAGCAAGTCTCCATATGTGGACCCTCA 1175
Query 1185 TAAATCAGGACATGAAATCTGGGAAGAATTTTCGATGAGCTTCACTCCAGCAGTGAAAGAAGTGGTGGAATTTG 1258
.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1176 GAAGTCTGGACATGAAATCTGGGAAGAATTTTCAATGAGTTTTACCCCAGCAGTAAAAGAGGTGGTGGAATTTG 1249
Query 1259 CAAAGCGTATTCCTGGGTTCAGAGATCTCTCTCAGCATGACCAGGTCAACCTTTTAAAGGCTGGGACTTTTGAG 1332
|||||.|.||||||||.|||.|||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1250 CAAAGAGGATTCCTGGCTTCCGAGATCTGTCTCAGCATGATCAGGTCAATCTGTTAAAAGCTGGGACTTTTGAG 1323
Query 1333 GTTTTAATGGTACGGTTCGCATCATTATTTGATGCAAAGGAACGTACTGTCACCTTTTTAAGTGGAAAGAAATA 1406
||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||.||
Sbjct 1324 GTTTTAATGGTACGATTTGCTTCATTATTTGATGCAAAGGAACGGACTGTCACCTTTCTAAGTGGTAAGAAGTA 1397
Query 1407 TAGTGTGGATGATTTACACTCAATGGGAGCAGGGGATCTGCTAAACTCTATGTTTGAATTTAGTGAGAAGCTAA 1480
.|||||||||||..|.||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 1398 CAGTGTGGATGACCTGCACTCAATGGGAGCAGGGGATCTGCTCAGCTCTATGTTTGAGTTCAGTGAGAAGCTGA 1471
Query 1481 ATGCCCTCCAACTTAGTGATGAAGAGATGAGTTTGTTTACAGCTGTTGTCCTGGTATCTGCAGATCGATCTGGA 1554
||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472 ATGCCCTCCAGCTCAGTGATGAGGAAATGAGCTTGTTCACAGCAGTTGTTCTGGTATCTGCAGATCGATCTGGA 1545
Query 1555 ATAGAAAACGTCAACTCTGTGGAGGCTTTGCAGGAAACTCTCATTCGTGCACTAAGGACCTTAATAATGAAAAA 1628
||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1546 ATTGAAAATGTCAACTCAGTGGAGGCTTTGCAGGAAACACTCATCCGTGCACTAAGGACCTTAATAATGAAAAA 1619
Query 1629 CCATCCAAATGAGGCCTCTATTTTTACAAAACTGCTTCTAAAGTTGCCAGATCTTCGATCTTTAAACAACATGC 1702
||||||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1620 CCATCCAAATGAGGCCTCCATTTTTACAAAATTACTTCTAAAGTTGCCAGATCTTCGATCTTTAAACAACATGC 1693
Query 1703 ACTCTGAGGAGCTCTTGGCCTTTAAAGTTCACCCTG 1738
||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1694 ACTCTGAGGAACTCTTGGCCTTTAAAGTTCATCCT- 1728