Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489919
• Subject: XM_011249276.2
• Aligned Length: 1581
• Identities: 1219
• Gaps: 288

Alignment

Query    1  ATGAGGCGACGAAGGAGGCGGGACGGCTTTTACCCAGCCCCGGACTTCCGAGACAGGGAAGCTGAGGACATGGC  74
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGCGACGACGGAGGCGGGACGGCTTTTACCTAGCGCCTGACTTCCGACACAGGGAAGCTGAGGACATGGC  74

Query   75  AGGAGTGTTTGACATAGACCTGGACCAGCCAGAGGACGCGGGCTCTGAGGATGAGCTGGAGGAGGGGGGTCAGT  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGGAGTGTTTGACATAGACCTGGACCAGCCAGAAGATGCAGGCTCTGAGGATGAGCTGGAGGAGGGGGGTCAGT  148

Query  149  TAAATGAAAGCATGGACCATGGGGGAGTTGGACCATATGAACTTGGCATGGAACATTGTGAGAAATTTGAAATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAAATGAAAGCATGGACCATGGGGGAGTTGGACCATATGAACTTGGCATGGAACATTGTGAGAAATTTGAAATC  222

Query  223  TCAGAAACTAGTGTGAACAGAGGGCCAGAAAAAATCAGACCAGAATGTTTTGAGCTACTTCGGGTACTTGGTAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCAGAAACTAGTGTGAACAGAGGGCCAGAAAAAATCAGACCAGAATGTTTTGAGCTACTTCGGGTACTTGGTAA  296

Query  297  AGGGGGCTATGGAAAGGTTTTTCAAGTACGAAAAGTAACAGGAGCAAATACTGGGAAAATATTTGCCATGAAGG  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  AGGGGGCTATGGAAAGGTTTTTCAAGTACGAAAAGTAACAGGAGCAAATACTGGGAAGATATTTGCCATGAAGG  370

Query  371  TGCTTAAAAAGGCAATGATAGTAAGAAATGCTAAAGATACAGCTCATACAAAAGCAGAACGGAATATTCTGGAG  444
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  371  TGCTTAAAAAGGCAATGATAGTGAGGAATGCTAAGGACACGGCCCACACGAAAGCAGAGCGGAACATTCTGGAG  444

Query  445  GAAGTAAAGCATCCCTTCATCGTGGATTTAATTTATGCCTTTCAGACTGGTGGAAAACTCTACCTCATCCTTGA  518
            |||||.||.||.||.|||||.|||||..|.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  445  GAAGTGAAACACCCTTTCATTGTGGACCTGATTTATGCCTTTCAGACCGGAGGAAAGCTCTACCTCATCCTCGA  518

Query  519  GTATCTCAGTGGAGGAGAACTATTTATGCAGTTAGAAAGAGAGGGAATATTTATGGAAGACACTGCCTGCTTTT  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct  519  GTATCTCAGTGGAGGAGAACTATTTATGCAGTTAGAAAGAGAGGGAATATTCATGGAAGACACAGCGTGCTTTT  592

Query  593  ACTTGGCAGAAATCTCCATGGCTTTGGGGCATTTACATCAAAAGGGGATCATCTACAGAGACCTGAAGCCGGAG  666
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTTGGCTGAAATCTCCATGGCTTTGGGGCATTTACATCAAAAAGGGATCATCTACAGAGACCTGAAGCCGGAG  666

Query  667  AATATCATGCTTAATCACCAAGGTCATGTGAAACTAACAGACTTTGGACTATGCAAAGAATCTATTCATGATGG  740
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACATCATGCTTAATCACCAAGGTCACGTGAAACTAACAGACTTTGGACTATGCAAAGAATCTATTCATGATGG  740

Query  741  AACAGTCACACACACATTTTGTGGAACAATAGAATACATGGCCCCTGAAATCTTGATGAGAAGTGGCCACAATC  814
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  741  AACAGTCACGCACACATTTTGTGGAACAATAGAATACATGGCCCCTGAAATCTTAATGAGAAGCGGCCACAACC  814

Query  815  GTGCTGTGGATTGGTGGAGTTTGGGAGCATTAATGTATGACATGCTGACTGGAGCACCCCCATTCACTGGGGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  815  GTGCTGTGGATTGGTGGAGTTTGGGAGCATTAATGTATGACATGCTGACTGGAGCACCTCCATTCACTGGGGAG  888

Query  889  AATAGAAAGAAAACAATTGACAAAATCCTCAAATGTAAACTCAATTTGCCTCCCTACCTCACACAAGAAGCCAG  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct  889  AATAGAAAGAAAACAATTGACAAAATCCTCAAATGTAAACTTAATTTGCCTCCCTACCTCACACAAGAAGCTCG  962

Query  963  AGATCTGCTTAAAAAGCTGCTGAAAAGAAATGCTGCTTCTCGTCTGGGAGCTGGTCCTGGGGACGCTGGAGAAG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  963  AGATCTGCTTAAAAAGCTGCTGAAAAGAAATGCTGCTTCTCGTCTTGGAGCTGGCCCTGGGGATGCTGGAGAAG  1036

Query 1037  TTCAAGCTCATCCATTCTTTAGACACATTAACTGGGAAGAACTTCTGGCTCGAAAGGTGGAGCCCCCCTTTAAA  1110
            |.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1037  TCCAAGCTCATCCTTTTTTCAGACACATTAACTGGGAAGAACTTCTGGCTCGGAAGGTGGAACCTCCCTTTAAG  1110

Query 1111  CCTCTGTTGCAATCTGAAGAGGATGTAAGTCAGTTTGATTCCAAGTTTACACGTCAGACACCTGTCGACAGCCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111  CCTCTGTTGCAATCTGAAGAGGATGTGAGTCAGTTTGATTCAAAGTTTACACGTCAGACACCTGTTGACAGCCC  1184

Query 1185  AGATGACTCAACTCTCAGTGAAAGTGCCAATCAGGTCTTTCTGGGTTTTACATATGTGGCTCCATCTGTACTTG  1258
            .||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||                            ||
Sbjct 1185  TGATGACTCCACTCTCAGTGAAAGTGCCAACCAGGTCTTTCTGG----------------------------TG  1230

Query 1259  AAAGTGTGAAAGAAAAGTTTTCCTTTGAACCAAAAATCCGATCACCTCGAAGATTTATTGGCAGCCCACGAACA  1332
            .||||                                                                     
Sbjct 1231  CAAGT---------------------------------------------------------------------  1235

Query 1333  CCTGTCAGCCCAGTCAAATTTTCTCCTGGGGATTTCTGGGGAAGAGGTGCTTCGGCCAGCA---CAGCAAATCC  1403
                     ||||||      |||||               ||            .|||||   |||||||   
Sbjct 1236  ---------CCAGTC------TCTCC---------------AA------------ACAGCAATCCAGCAAA---  1264

Query 1404  TCAGACACCTGTGGAATACCCAATGGAAACAAGTGGCATAGAGCAGATGGATGTGACAATGAGTGGGGAAGCAT  1477
                |||.|.|..|.|.|||       ||||      ||..||||.|||                         
Sbjct 1265  ----ACAGCAGCAGCAGACC-------AACA------ATTCAGCAAATG-------------------------  1296

Query 1478  CGGCACCACTTCCAATACGACAGCCGAACTCTGGGCCATACAAAAAACAAGCTTTTCCCATGATCTCCAAACGG  1551
                                                                                      
Sbjct 1297  --------------------------------------------------------------------------  1296

Query 1552  CCAGAGCACCTGCGTATGAATCTATTG  1578
                                       
Sbjct 1297  ---------------------------  1296