Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491423
• Subject: XM_011527904.2
• Aligned Length: 1652
• Identities: 1211
• Gaps: 433

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGAGACCGGCTTCCATTCTATGCGGAGTCCACGGTCTGCTCTGATCTTGCTGTGTGGAGTTGTTGTGTGCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGAAATGCTTGTGACCCTGCGAAGCGCCCTCCTGGCAAGTCCCCTGCAGGTGCGGTGGGTGCCATGCAGGAGGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGCTGAGCTTGGATGGAAGCAGGCCCTCTCTGCGGCAGATGGCGGCTCTCAGGACGCCATGGGTCTGCGGTGTC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CCTTACCCACTGGGGGGGCTCGGCAGCCTGAGGAGCTCCCTCTTCCTGATGCAGAGCCCTCACTGCTCACTGCC  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  ATGGAGGAGGCAGGAGATCCCGCCGGACCCCGCTTGGAGGGCTGGGCCTGGAGCATGCATGGGTGCGGGGTCAA  370

Query    1  -------------------------------------ATGAACAACTCGGGCGCCGACGAG-------------  24
                                                 ..|.|| |||.|.| ||||.|.||             
Sbjct  371  CGCCTCAGGAGACTTGGAGCTTGGGAGCCCCCTGTTCTGGGAC-ACTTGTG-GCCGTCCAGCTGCTGCCCTGGG  442

Query   25  -ATC----------GGGAAGCTCTTCGTGGGCGGTCTTGACTGGAGCACGACCCAAGAGACTCTGCGCAGCTAC  87
             |||          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  AATCCACACCTGGAAGGAAGCTCTTCGTGGGCGGTCTTGACTGGAGCACGACCCAAGAGACTCTGCGCAGCTAC  516

Query   88  TTTTCCCAATATGGAGAAGTCGTAGATTGTGTTATCATGAAAGATAAAACCACCAACCAGTCTCGAGGCTTTGG  161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  TTTTCCCAATATGGAGAAGTCGTAGATTGTGTTATCATGAAAGATAAAACCACCAACCAGTCTCGAGGCTTTGG  590

Query  162  GTTTGTCAAATTTAAAGACCCAAACTGTGTGGGGACGGTGCTGGCCAGCAGACCGCACACGCTAGATGGCCGAA  235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  GTTTGTCAAATTTAAAGACCCAAACTGTGTGGGGACGGTGCTGGCCAGCAGACCGCACACGCTAGATGGCCGAA  664

Query  236  ACATCGACCCCAAGCCATGCACACCCCGGGGGATGCAGCCGGAGAGAACACGGCCGAAGGAAGGATGGCAGAAA  309
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  ACATCGACCCCAAGCCATGCACACCCCGGGGGATGCAGCCGGAGAGAACACGGCCGAAGGAAGGATGGCAGAAA  738

Query  310  GGACCCAGGAGCGATAACAGTAAATCAAATAAGATATTTGTCGGTGGAATTCCTCACAATTGTGGTGAGACAGA  383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  GGACCCAGGAGCGATAACAGTAAATCAAATAAGATATTTGTCGGTGGAATTCCTCACAATTGTGGTGAGACAGA  812

Query  384  GCTCAGGGAATACTTCAAGAAGTTCGGAGTGGTCACGGAGGTAGTCATGATCTATGACGCCGAGAAGCAGAGGC  457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  GCTCAGGGAATACTTCAAGAAGTTCGGAGTGGTCACGGAGGTAGTCATGATCTATGACGCCGAGAAGCAGAGGC  886

Query  458  CCCGAGGTTTTGGATTTATTACTTTCGAGGACGAACAATCAGTGGACCAGGCTGTCAACATGCATTTTCACGAC  531
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  CCCGAGGTTTTGGATTTATTACTTTCGAGGACGAACAATCAGTGGACCAGGCTGTCAACATGCATTTTCACGAC  960

Query  532  ATCATGGGCAAAAAAGTGGAAGTTAAACGAGCTGAGCCTCGGGACAGCAAGAGCCAAGCGCCGGGACAGCCAGG  605
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  ATCATGGGCAAAAAAGTGGAAGTTAAACGAGCTGAGCCTCGGGACAGCAAGAGCCAAGCGCCGGGACAGCCAGG  1034

Query  606  TGCCAGCCAGTGGGGGAGCCGGGTTGTGCCCAACGCTGCCAATGGCTGGGCAGGCCAGCCCCCGCCCACGTGGC  679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  TGCCAGCCAGTGGGGGAGCCGGGTTGTGCCCAACGCTGCCAATGGCTGGGCAGGCCAGCCCCCGCCCACGTGGC  1108

Query  680  AGCAAGGATATGGCCCGCAAGGAATGTGGGTGCCGGCAGGACAGGCGATTGGTGGCTATGGACCGCCCCCTGCA  753
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  AGCAAGGATATGGCCCGCAAGGAATGTGGGTGCCGGCAGGACAGGCGATTGGTGGCTATGGACCGCCCCCTGCA  1182

Query  754  GGAAGAGGAGCCCCCCCGCCACCCCCACCGTTCACCTCCTACATCGTGTCCACCCCTCCTGGAGGCTTTCCCCC  827
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  GGAAGAGGAGCCCCCCCGCCACCCCCACCGTTCACCTCCTACATCGTGTCCACCCCTCCTGGAGGCTTTCCCCC  1256

Query  828  TCCCCAGGGCTTCCCTCAGGGCTACGGTGCCCCGCCACAGTTCAGTTTTGGCTACGGGCCTCCACCTCCACCGC  901
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  TCCCCAGGGCTTCCCTCAGGGCTACGGTGCCCCGCCACAGTTCAGTTTTGGCTACGGGCCTCCACCTCCACCGC  1330

Query  902  CAGATCAGTTTGCCCCTCCGGGGGTTCCTCCTCCACCAGCCACTCCCGGGGCAGCACCTCTGGCTTTCCCACCG  975
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331  CAGATCAGTTTGCCCCTCCGGGGGTTCCTCCTCCACCAGCCACTCCCGGGGCAGCACCTCTGGCTTTCCCACCG  1404

Query  976  CCTCCGTCTCAGGCTGCCCCGGACATGAGCAAGCCCCCGACAGCTCAGCCAGACTTCCCCTATGGTCAGTATGC  1049
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405  CCTCCGTCTCAGGCTGCCCCGGACATGAGCAAGCCCCCGACAGCTCAGCCAGACTTCCCCTATGGTCAGTATGC  1478

Query 1050  AGGTTACGGGCAGGACTTGAGTGGCTTCGGACAGGGCTTCTCAGACCCCAGCCAGCAGCCTCCTTCCTACGGGG  1123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1479  AGGTTACGGGCAGGACTTGAGTGGCTTCGGACAGGGCTTCTCAGACCCCAGCCAGCAGCCTCCTTCCTACGGGG  1552

Query 1124  GTCCCTCCGTGCCAGGGTCGGGGGGCCCCCCCGCCGGCGGCAGCGGCTTTGGACGAGGGCAGAACCACAACGTG  1197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553  GTCCCTCCGTGCCAGGGTCGGGGGGCCCCCCCGCCGGCGGCAGCGGCTTTGGACGAGGGCAGAACCACAACGTG  1626

Query 1198  CAAGGGTTCCACCCCTACCGACGC  1221
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1627  CAAGGGTTCCACCCCTACCGACGC  1650