Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491423
• Subject: XM_011527907.2
• Aligned Length: 1652
• Identities: 1205
• Gaps: 439

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGAGACCGGCTTCCATTCTATGCGGAGTCCACGGTCTGCTCTGATCTTGCTGTGTGGAGTTGTTGTGTGCG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGAAATGCTTGTGACCCTGCGAAGCGCCCTCCTGGCAAGTCCCCTGCAGGTGCGGTGGGTGCCATGCAGGAGGG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGCTGAGCTTGGATGGAAGCAGGCCCTCTCTGCGGCAGATGGCGGCTCTCAGGACGCCATGGGTCTGCGGTGTC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CCTTACCCACTGGGGGGGCTCGGCAGCCTGAGGAGCTCCCTCTTCCTGATGCAGAGCCCTCACTGCTCACTGCC  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  ATGGAGGAGGCAGGAGATCCCGCCGGACCCCGCTTGGAGGGCTGGGCCTGGAGCATGCATGGGTGCGGGGTCAA  370

Query    1  -------------------------------------ATGAACAACTCGGGCGCCGACGAG-------------  24
                                                 ..|.|| |||.|.| ||||.|.||             
Sbjct  371  CGCCTCAGGAGACTTGGAGCTTGGGAGCCCCCTGTTCTGGGAC-ACTTGTG-GCCGTCCAGCTGCTGCCCTGGG  442

Query   25  -ATC----------GGGAAGCTCTTCGTGGGCGGTCTTGACTGGAGCACGACCCAAGAGACTCTGCGCAGCTAC  87
             |||          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  AATCCACACCTGGAAGGAAGCTCTTCGTGGGCGGTCTTGACTGGAGCACGACCCAAGAGACTCTGCGCAGCTAC  516

Query   88  TTTTCCCAATATGGAGAAGTCGTAGATTGTGTTATCATGAAAGATAAAACCACCAACCAGTCTCGAGGCTTTGG  161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  TTTTCCCAATATGGAGAAGTCGTAGATTGTGTTATCATGAAAGATAAAACCACCAACCAGTCTCGAGGCTTTGG  590

Query  162  GTTTGTCAAATTTAAAGACCCAAACTGTGTGGGGACGGTGCTGGCCAGCAGACCGCACACGCTAGATGGCCGAA  235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  GTTTGTCAAATTTAAAGACCCAAACTGTGTGGGGACGGTGCTGGCCAGCAGACCGCACACGCTAGATGGCCGAA  664

Query  236  ACATCGACCCCAAGCCATGCACACCCCGGGGGATGCAGCCGGAGAGAACACGGCCGAAGGAAGGATGGCAGAAA  309
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||
Sbjct  665  ACATCGACCCCAAGCCATGCACACCCCGGGGGATGCAGCCGGAGAGAACACGGCCGAAGGAAGGATG---GAAA  735

Query  310  GGACCCAGGAGCGATAACAGTAAATCAAATAAGATATTTGTCGGTGGAATTCCTCACAATTGTGGTGAGACAGA  383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  736  GGACCCAGGAGCGATAACAGTAAATCAAATAAGATATTTGTCGGTGGAATTCCTCACAATTGTGGTGAGACAGA  809

Query  384  GCTCAGGGAATACTTCAAGAAGTTCGGAGTGGTCACGGAGGTAGTCATGATCTATGACGCCGAGAAGCAGAGGC  457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  810  GCTCAGGGAATACTTCAAGAAGTTCGGAGTGGTCACGGAGGTAGTCATGATCTATGACGCCGAGAAGCAGAGGC  883

Query  458  CCCGAGGTTTTGGATTTATTACTTTCGAGGACGAACAATCAGTGGACCAGGCTGTCAACATGCATTTTCACGAC  531
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884  CCCGAGGTTTTGGATTTATTACTTTCGAGGACGAACAATCAGTGGACCAGGCTGTCAACATGCATTTTCACGAC  957

Query  532  ATCATGGGCAAAAAAGTGGAAGTTAAACGAGCTGAGCCTCGGGACAGCAAGAGCCAAGCGCCGGGACAGCCAGG  605
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  958  ATCATGGGCAAAAAAGTGGAAGTTAAACGAGCTGAGCCTCGGGACAGCAAGAGCCAAGCGCCGGGACAGCCAGG  1031

Query  606  TGCCAGCCAGTGGGGGAGCCGGGTTGTGCCCAACGCTGCCAATGGCTGGGCAGGCCAGCCCCCGCCCACGTGGC  679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032  TGCCAGCCAGTGGGGGAGCCGGGTTGTGCCCAACGCTGCCAATGGCTGGGCAGGCCAGCCCCCGCCCACGTGGC  1105

Query  680  AGCAAGGATATGGCCCGCAAGGAATGTGGGTGCCGGCAGGACAGGCGATTGGTGGCTATGGACCGCCCCCTGCA  753
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  AGCAAGGATATGGCCCGCAAGGAATGTGGGTGCCGGCAGGACAGGCGATTGGTGGCTATGGACCGCCCCCTGCA  1179

Query  754  GGAAGAGGAGCCCCCCCGCCACCCCCACCGTTCACCTCCTACATCGTGTCCACCCCTCCTGGAGGCTTTCCCCC  827
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180  GGAAGAGGAGCCCCCCCGCCACCCCCACCGTTCACCTCCTACATCGTGTCCACCCCTCCTGGAGGCTTTCCCCC  1253

Query  828  TCCCCAGGGCTTCCCTCAGGGCTACGGTGCCCCGCCACAGTTCAGTTTTGGCTACGGGCCTCCACCTCCACCGC  901
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254  TCCCCAGGGCTTCCCTCAGGGCTACGGTGCCCCGCCACAGTTCAGTTTTGGCTACGGGCCTCCACCTCCACCGC  1327

Query  902  CAGATCAGTTTGCCCCTCCGGGGGTTCCTCCTCCACCAGCCACTCCCGGGGCAGCACCTCTGGCTTTCCCACCG  975
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328  CAGATCAGTTTGCCCCTCCGGGGGTTCCTCCTCCACCAGCCACTCCCGGGGCAGCACCTCTGGCTTTCCCACCG  1401

Query  976  CCTCCGTCTCAGGCTGCCCCGGACATGAGCAAGCCCCCGACAGCTCAGCCAGACTTCCCCTATGGTCAGTATGC  1049
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 1402  CCTCCGTCTCAGGCTGCCCCGGACATGAGCAAGCCCCCGACAGCTCAGCCAGACTTCCCCTATGGTCAGTAT--  1473

Query 1050  AGGTTACGGGCAGGACTTGAGTGGCTTCGGACAGGGCTTCTCAGACCCCAGCCAGCAGCCTCCTTCCTACGGGG  1123
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474  -GGTTACGGGCAGGACTTGAGTGGCTTCGGACAGGGCTTCTCAGACCCCAGCCAGCAGCCTCCTTCCTACGGGG  1546

Query 1124  GTCCCTCCGTGCCAGGGTCGGGGGGCCCCCCCGCCGGCGGCAGCGGCTTTGGACGAGGGCAGAACCACAACGTG  1197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1547  GTCCCTCCGTGCCAGGGTCGGGGGGCCCCCCCGCCGGCGGCAGCGGCTTTGGACGAGGGCAGAACCACAACGTG  1620

Query 1198  CAAGGGTTCCACCCCTACCGACGC  1221
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1621  CAAGGGTTCCACCCCTACCGACGC  1644