Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491450
• Subject: XM_017027721.2
• Aligned Length: 1614
• Identities: 1451
• Gaps: 162

Alignment

Query    1  ATGGTAGAACTAGTGATCTCACCCAGCCTCACTGTAAACAGCGATTGTCTGGATAAACTGAAGTTTAACCGTGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTAGAACTAGTGATCTCACCCAGCCTCACTGTAAACAGCGATTGTCTGGATAAACTGAAGTTTAACCGTGC  74

Query   75  TGACGCTGCTGTGTGGACTCTGAGTGACAGACAAGGCATCACCAAATCGGCCCCCCTGAGAGTGTCCCAGCTCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGACGCTGCTGTGTGGACTCTGAGTGACAGACAAGGCATCACCAAATCGGCCCCCCTGAGAGTGTCCCAGCTCT  148

Query  149  TCTCCAGATCTTGCCCACGTGTCCTCCCCCGCCAGCCTTCCACAGCCATGGCAGCCTACGGCCAGACGCAGTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTCCAGATCTTGCCCACGTGTCCTCCCCCGCCAGCCTTCCACAGCCATGGCAGCCTACGGCCAGACGCAGTAC  222

Query  223  AGTGCGGGGATCCAGCAGGCTACCCCCTATACAGCTTACCCACCTCCAGCACAAGCCTATGGAATCCCTTC---  293
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct  223  AGTGCGGGGATCCAGCAGGCTACCCCCTATACAGCTTACCCACCTCCAGCACAAGCCTATGGAATCCCTTCCTA  296

Query  294  ---------------------------------------------------------------------CTTCA  298
                                                                                 |||||
Sbjct  297  CAGCATCAAGACAGAAGACAGCTTGAACCATTCCCCTGGCCAGAGTGGATTCCTCAGCTATGGCTCCAGCTTCA  370

Query  299  GCACCTCACCCACTGGACAGAGCCCATACACCTACCAGATGCACGGCACAACAGGGTTCTATCAAGGAGGAAAT  372
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCACCTCACCCACTGGACAGAGCCCATACACCTACCAGATGCACGGCACAACAGGGTTCTATCAAGGAGGAAAT  444

Query  373  GGACTGGGCAACGCAGCCGGTTTCGGGAGTGTGCACCAGGACTATCCTTCCTACCCCGGCTTCCCCCAGAGCCA  446
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGACTGGGCAACGCAGCCGGTTTCGGGAGTGTGCACCAGGACTATCCTTCCTACCCCGGCTTCCCCCAGAGCCA  518

Query  447  GTACCCCCAGTATTACGGCTCATCCTACAACCCTCCCTACGTCCCGGCCAGCAGCATCTGCCCTTCGCCCCTCT  520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTACCCCCAGTATTACGGCTCATCCTACAACCCTCCCTACGTCCCGGCCAGCAGCATCTGCCCTTCGCCCCTCT  592

Query  521  CCACGTCCACCTACGTCCTCCAGGAGGCATCTCACAACGTCCCCAACCAGAGTTCCGAGTCACTTGCTGGTGAA  594
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCACGTCCACCTACGTCCTCCAGGAGGCATCTCACAACGTCCCCAACCAGAGTTCCGAGTCACTTGCTGGTGAA  666

Query  595  TACAACACACACAATGGACCTTCCACACCAGCGAAAGAGGGAGACACAGACAGGCCGCACCGGGCCTCCGACGG  668
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACAACACACACAATGGACCTTCCACACCAGCGAAAGAGGGAGACACAGACAGGCCGCACCGGGCCTCCGACGG  740

Query  669  GAAGCTCCGAGGCCGGTCTAAGAGGAGCAGTGACCCGTCCCCGGCAGGGGACAATGAGATTGAGCGTGTGTTCG  742
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAAGCTCCGAGGCCGGTCTAAGAGGAGCAGTGACCCGTCCCCGGCAGGGGACAATGAGATTGAGCGTGTGTTCG  814

Query  743  TGTGGGACTTGGATGAGACAATAATTATTTTTCACTCCTTACTCACGGGGACATTTGCATCCAGATACGGGAAG  816
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct  815  TGTGGGACTTGGATGAGACAATAATTATTTTTCACTCCTTACTCACGGGGACATTTGCATCCAGATACGGGA--  886

Query  817  GACACCACGACGTCCGTGCGCATTGGCCTTATGATGGAAGAGATGATCTTCAACCTTGCAGATACACATCTGTT  890
                                                                                      
Sbjct  887  --------------------------------------------------------------------------  886

Query  891  CTTCAATGACCTGGAGGATTGTGACCAGATCCACGTTGATGACGTCTCATCAGATGACAATGGCCAAGATTTAA  964
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  --------------AGGATTGTGACCAGATCCACGTTGATGACGTCTCATCAGATGACAATGGCCAAGATTTAA  946

Query  965  GCACATACAACTTCTCCGCTGACGGCTTCCACAGTTCGGCCCCAGCAGCCAACCTGTGCCTGGGCTCTGGCGTG  1038
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  947  GCACATACAACTTCTCCGCTGACGGCTTCCACAGTTCGGCCCCAGGAGCCAACCTGTGCCTGGGCTCTGGCGTG  1020

Query 1039  CACGGCGGCGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCCTTCCGCTACCGGCGGGTGAAGGAGATGTACAATACCTACAA  1112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021  CACGGCGGCGTGGACTGGATGAGGAAGCTGGCCTTCCGCTACCGGCGGGTGAAGGAGATGTACAATACCTACAA  1094

Query 1113  GAACAACGTTGGTGGGTTGATAGGCACTCCCAAAAGGGAGACCTGGCTACAGCTCCGAGCTGAGCTGGAAGCTC  1186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095  GAACAACGTTGGTGGGTTGATAGGCACTCCCAAAAGGGAGACCTGGCTACAGCTCCGAGCTGAGCTGGAAGCTC  1168

Query 1187  TCACAGACCTCTGGCTGACCCACTCCCTGAAGGCACTAAACCTCATCAACTCCCGGCCCAACTGTGTCAATGTG  1260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169  TCACAGACCTCTGGCTGACCCACTCCCTGAAGGCACTAAACCTCATCAACTCCCGGCCCAACTGTGTCAATGTG  1242

Query 1261  CTGGTCACCACCACTCAACTAATTCCTGCCCTGGCCAAAGTCCTGCTATATGGCCTGGGGTCTGTGTTTCCTAT  1334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243  CTGGTCACCACCACTCAACTAATTCCTGCCCTGGCCAAAGTCCTGCTATATGGCCTGGGGTCTGTGTTTCCTAT  1316

Query 1335  TGAGAACATCTACAGTGCAACCAAGACAGGGAAGGAGAGCTGCTTCGAGAGGATAATGCAGAGATTCGGCAGAA  1408
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317  TGAGAACATCTACAGTGCAACCAAGACAGGGAAGGAGAGCTGCTTCGAGAGGATAATGCAGAGATTCGGCAGAA  1390

Query 1409  AAGCTGTCTACGTGGTGATCGGTGATGGTGTGGAAGAGGAGCAAGGAGCGAAAAAGCACAACATGCCTTTCTGG  1482
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391  AAGCTGTCTACGTGGTGATCGGTGATGGTGTGGAAGAGGAGCAAGGAGCGAAAAAGCACAACATGCCTTTCTGG  1464

Query 1483  CGGATATCCTGCCACGCAGACCTGGAGGCACTGAGGCACGCCCTGGAGCTGGAGTATTTA  1542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465  CGGATATCCTGCCACGCAGACCTGGAGGCACTGAGGCACGCCCTGGAGCTGGAGTATTTA  1524