Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491494
• Subject: NM_001287390.2
• Aligned Length: 1548
• Identities: 1266
• Gaps: 282

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTTCAGGACTGCAGCAGCCATCTCTGTGCACCTGGTGGGGCCCCTTCAGGGAAGGAAGGCTGGAGCCCCACT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CACTTGGTTCTTGCACCAGACTCAGGTGGCTGAGAAGAATGTTGGATCCCCAGCTCCACGGCCCACCAGCCATC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TGGGACTGGCAAACCCACAGGAACGGAAGGTTCCTCAGGGACCACAAAGCCCATGTGAGGTCCCTGCTGCTGAA  222

Query    1  ------------------------------------------------------------ATGGCCAAACAGCT  14
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct  223  GGGATTCTGAGGACAGGAGGAGCCAAATTACCTATCCAGGGTCACCCAGCCAAGCTCGCCATGGCCAAACAGCT  296

Query   15  GCAGGCCCGAAGGCTAGACGGGATCGACTACAACCCCTGGGTGGAGTTTGTGAAACTGGCCAGTGAGCATGACG  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCAGGCCCGAAGGCTAGACGGGATCGACTACAACCCCTGGGTGGAGTTTGTGAAACTGGCCAGTGAGCATGACG  370

Query   89  TCGTGAACTTGGGCCAGGGCTTCCCGGATTTCCCACCACCAGACTTTGCCGTGGAAGCCTTTCAGCACGCTGTC  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCGTGAACTTGGGCCAGGGCTTCCCGGATTTCCCACCACCAGACTTTGCCGTGGAAGCCTTTCAGCACGCTGTC  444

Query  163  AGTGGAGACTTCATGCTTAACCAGTACACCAAGACATTTGGTTACCCACCACTGACGAAGATCCTGGCAAGTTT  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTGGAGACTTCATGCTTAACCAGTACACCAAGACATTTGGTTACCCACCACTGACGAAGATCCTGGCAAGTTT  518

Query  237  CTTTGGGGAGCTGCTGGGTCAGGAGATAGACCCGCTCAGGAATGTGCTGGTGACTGTTGGTGGCTATGGGGCCC  310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTTGGGGAGCTGCTGGGTCAGGAGATAGACCCGCTCAGGAATGTGCTGGTGACTGTTGGTGGCTATGGGGCCC  592

Query  311  TGTTCACAGCCTTCCAGGCCCTGGTGGACGAAGGAGACGAGGTCATCATCATCGAACCCTTTTTTGACTGCTAC  384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGTTCACAGCCTTCCAGGCCCTGGTGGACGAAGGAGACGAGGTCATCATCATCGAACCCTTTTTTGACTGCTAC  666

Query  385  GAGCCCATGACAATGATGGCAGGGGGTCGTCCTGTGTTTGTGTCCCTGAAGCCGGGTCCCATCCAGAATGGAGA  458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCCCATGACAATGATGGCAGGGGGTCGTCCTGTGTTTGTGTCCCTGAAGCCGGGTCCCATCCAGAATGGAGA  740

Query  459  ACTGGGTTCCAGCAGCAACTGGCAGCTGGACCCCATGGAGCTGGCCGGCAAATTCACATCACGCACCAAAGCCC  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACTGGGTTCCAGCAGCAACTGGCAGCTGGACCCCATGGAGCTGGCCGGCAAATTCACATCACGCACCAAAGCCC  814

Query  533  TGGTCCTCAACACCCCCAACAACCCCCTGGGCAAGGTGTTCTCCAGGGAAGAGCTGGAGCTGGTGGCCAGCCTT  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGTCCTCAACACCCCCAACAACCCCCTGGGCAAGGTGTTCTCCAGGGAAGAGCTGGAGCTGGTGGCCAGCCTT  888

Query  607  TGCCAGCAGCATGACGTGGTGTGTATCACTGATGAAGTCTACCAGTGGATGGTCTACGACGGGCACCAGCACAT  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCCAGCAGCATGACGTGGTGTGTATCACTGATGAAGTCTACCAGTGGATGGTCTACGACGGGCACCAGCACAT  962

Query  681  CAGCATTGCCAGCCTCCCTGGCATGTGGGAACGGACCCTGACCATCGGCAGCGCCGGCAAGACCTTCAGCGCCA  754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGCATTGCCAGCCTCCCTGGCATGTGGGAACGGACCCTGACCATCGGCAGCGCCGGCAAGACCTTCAGCGCCA  1036

Query  755  CTGGCTGGAAGGTGGGCTGGGTCCTGGGTCCAGATCACATCATGAAGCACCTGCGGACCGTGCACCAGAACTCC  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGGCTGGAAGGTGGGCTGGGTCCTGGGTCCAGATCACATCATGAAGCACCTGCGGACCGTGCACCAGAACTCC  1110

Query  829  GTCTTCCACTGCCCCACGCAGAGCCAGGCTGCAGTAGCCGAGAGCTTTGAACGGGAGCAGCTGCTCTTCCGCCA  902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTCTTCCACTGCCCCACGCAGAGCCAGGCTGCAGTAGCCGAGAGCTTTGAACGGGAGCAGCTGCTCTTCCGCCA  1184

Query  903  ACCCAGCAGCTACTTTGTGCAGTTCCCGCAGGCCATGCAGCGCTGCCGTGACCACATGATACGTAGCCTACAGT  976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACCCAGCAGCTACTTTGTGCAGTTCCCGCAGGCCATGCAGCGCTGCCGTGACCACATGATACGTAGCCTACAGT  1258

Query  977  CAGTGGGCCTGAAGCCCATCATCCCTCAGGGCAGCTACTTCCTCATCACAGACATCTCAGACTTCAAGAGGAAG  1050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGTGGGCCTGAAGCCCATCATCCCTCAGGGCAGCTACTTCCTCATCACAGACATCTCAGACTTCAAGAGGAAG  1332

Query 1051  ATGCCTGACTTGCCTGGAGCTGTGGATGAGCCCTATGACAGACGCTTCGTCAAGTGGATGATCAAGAACAAGGG  1124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATGCCTGACTTGCCTGGAGCTGTGGATGAGCCCTATGACAGACGCTTCGTCAAGTGGATGATCAAGAACAAGGG  1406

Query 1125  CTTGGTGGCCATCCCTGTCTCCATCTTCTATAGTGTGCCACATCAGAAGCACTTTGACCACTATATCCGCTTCT  1198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTTGGTGGCCATCCCTGTCTCCATCTTCTATAGTGTGCCACATCAGAAGCACTTTGACCACTATATCCGCTTCT  1480

Query 1199  GTTTTGTGAAGGATGAAGCCACGCTCCAGGCCATGGACGAGAAGCTGCGGAAGTGGAAGGTGGAACTC  1266
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTTTTGTGAAGGATGAAGCCACGCTCCAGGCCATGGACGAGAAGCTGCGGAAGTGGAAGGTGGAACTC  1548