Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491548
• Subject: NM_001290345.1
• Aligned Length: 2683
• Identities: 2386
• Gaps: 1

Alignment

Query    1  ATGAACCCCGGCTTCGATTTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATTCAGCGCATCGGCAGCGG  74
            ||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACCCGGGCTTCGATCTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATCCAGCGCATCGGCAGCGG  74

Query   75  CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTTAACACTGGTGAATTAGCAGCAATTAAAGTAATAAAATTGG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTCAACACTGGAGAATTAGCAGCAATTAAAGTGATAAAATTGG  148

Query  149  AACCAGGAGAAGACTTTGCAGTTGTGCAGCAAGAAATTATCATGATGAAAGACTGTAAACACCCAAATATTGTT  222
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  149  AACCAGGAGAAGACTTTGCGGTTGTACAGCAAGAAATCATTATGATGAAAGACTGCAAACACCCAAACATTGTT  222

Query  223  GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAGCTTTGGATTTGCATGGAGTTTTGTGGAGGTGGTTCTTTACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  223  GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAACTTTGGATTTGCATGGAATTCTGTGGAGGTGGCTCTTTACA  296

Query  297  GGATATTTATCACGTAACTGGACCTCTGTCAGAACTGCAAATTGCATATGTTAGCAGAGAAACACTGCAGGGAT  370
            |||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  297  GGACATATATCATGTAACTGGACCCCTTTCAGAACTGCAGATTGCATATGTTAGCAGAGAAACTCTACAGGGAT  370

Query  371  TATATTATCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACAGAGATATAAAGGGAGCTAACATTCTATTAACGGATAATGGT  444
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||
Sbjct  371  TGTATTACCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACCGAGATATAAAGGGCGCTAACATTCTCCTAACGGATAATGGT  444

Query  445  CATGTGAAATTGGCTGATTTTGGAGTATCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCTTTCATTGG  518
            ||.||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  CACGTGAAACTAGCTGATTTTGGAGTTTCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCCTTCATTGG  518

Query  519  CACACCATATTGGATGGCTCCAGAAGTTGCAGCTGTTGAGAGGAAGGGGGGTTACAATCAACTCTGTGATCTCT  592
            .||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  519  AACGCCATATTGGATGGCCCCAGAAGTCGCGGCTGTTGAGAGGAAAGGCGGGTACAATCAACTGTGTGACCTCT  592

Query  593  GGGCAGTGGGAATCACTGCCATAGAACTTGCAGAGCTTCAGCCTCCTATGTTTGACTTACACCCAATGAGAGCA  666
            ||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.|||||.|||||.|||
Sbjct  593  GGGCGGTGGGCATCACTGCCATCGAGCTGGCGGAGCTCCAGCCACCCATGTTTGACCTTCACCCGATGAGGGCA  666

Query  667  TTATTTCTAATGACAAAAAGCAATTTTCAGCCTCCTAAACTAAAGGATAAAATGAAATGGTCAAATAGTTTTCA  740
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..||||.||||||||||||||.||
Sbjct  667  TTGTTTCTAATGACAAAAAGCAATTTCCAGCCTCCTAAACTAAAAGATAAGTTGAAGTGGTCAAATAGTTTCCA  740

Query  741  TCACTTTGTGAAAATGGCACTTACCAAAAATCCGAAAAAAAGACCTACTGCTGAAAAATTATTACAGCATCCTT  814
            |||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|.|||.|||||..|.|||||||||||.|
Sbjct  741  TCATTTTGTGAAGATGGCTCTTACCAAAAATCCAAAGAAAAGACCCAATGCAGAAAAGCTGTTACAGCATCCCT  814

Query  815  TTGTAACACAACATTTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGCTGTTGGATAAAGTAAATAATCCAGATCATTCCACT  888
            ||||.|||||.|.|.|||||||||||||||||||||||.||.||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct  815  TTGTCACACAGCCTCTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGTTGCTGGACAAAGTGAATAATCCAGACCATTCCACA  888

Query  889  TACCATGATTTCGATGATGATGATCCTGAGCCTCTTGTTGCTGTACCACATAGAATTCACTCAACAAGTAGAAA  962
            |||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||.||||||||
Sbjct  889  TACCACGATTTTGATGATGATGACCCAGAGCCTCTTGTTGCCGTACCACATAGAATTCCTTCAACGAGTAGAAA  962

Query  963  CGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAACCTTTGGCCAAGTGAAATTTGATCCACCCTTAAGAAAGGAGA  1036
            .|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  963  TGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAAACTTTGGCCAGGTAAAATTTGATCCGCCCTTAAGGAAGGAGA  1036

Query 1037  CAGAACCACATCATGAACTTCCCGACAGTGATGGTTTTTTGGACAGTTCAGAAGAAATATACTACACTGCAAGA  1110
            ||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGAGCCACATCACGAACTTCCCGACAGTGATGGTTTTTTCGACAGTTCAGAAGAAATATACTACACTGCAAGA  1110

Query 1111  TCTAATCTGGATCTGCAACTGGAATATGGACAAGGACACCAAGGTGGTTACTTTTTAGGTGCAAACAAGAGTCT  1184
            ||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|...||.|||.|||||||..|||||||||||
Sbjct 1111  TCTAATCTGGATCTGCAACTAGAGTACGGACAAGGACACCAAAGCCATTGCTTCTTAGGTGGCAACAAGAGTCT  1184

Query 1185  TCTCAAGTCTGTTGAAGAAGAATTGCATCAGCGAGGACACGTCGCACATTTAGAAGATGATGAAGGAGATGATG  1258
            |||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1185  TCTGAAGTCTGTTGAAGAGGAATTACATCAGCGAGGACATGTGGCACACTTAGAAGATGACGAAGGCGACGATG  1258

Query 1259  ATGAATCTAAACACTCAACTCTGAAAGCAAAAATTCCACCTCCTTTGCCACCAAAGCCTAAGTCTATCTTCATA  1332
            |.||.|||||.||.|||||..|||||||||||.|.||.||||||.||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1259  ACGACTCTAAGCATTCAACCATGAAAGCAAAAGTCCCGCCTCCTCTGCCACCAAAGCCTAAATCCATCTTCATA  1332

Query 1333  CCACAGGAAATGCATTCTACTGAGGATGAAAATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCATGTCAGGGAGCCCAGC  1406
            ||||||||.|..||||||.|||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||...|||||||||||.||
Sbjct 1333  CCACAGGATACACATTCTGCTGAGGACGGTAATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCTCATCAGGGAGCCCGGC  1406

Query 1407  AAAGCCATCCCAAGTTCCACCTAGACCACCACCTCCCAGATTACCCCCACACAAACCTGTTGCCTTAGGAAATG  1480
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||.||..||||||||||
Sbjct 1407  AAAGCCATCCCACGTTCCACCTAGACCACCTCCGCCCAGGTTACCGCCACAGAAGCCTGCTGTTTTAGGAAATG  1480

Query 1481  GAATGAGCTCCTTCCAGTTAAATGGTGAACGAGATGGCTCATTATGTCAACAACAGAATGAACATAGAGGCACA  1554
            ||.|||.||||||||||.||||||||||.|||||.||.|||||||.|||.||.||||.|||.||.|||||||||
Sbjct 1481  GAGTGAACTCCTTCCAGCTAAATGGTGAGCGAGACGGATCATTATATCAGCAGCAGAGTGAGCAAAGAGGCACA  1554

Query 1555  AACCTTTCAAGAAAAGAAAAGAAAGATGTACCAAAGCCTATTAGTAATGGTCTTCCTCCAACACCTAAAGTGCA  1628
            ||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1555  AACCTTTCAAGAAAGGAGAAGAAGGACGTCCCGAAACCAATTAGTAATGGTCTTCCCCCAACACCTAAAGTGCA  1628

Query 1629  TATGGGTGCATGTTTTTCAAAAGTTTTTAATGGGTGTCCCTTGAAAATTCACTGTGCATCATCATGGATAAACC  1702
            ||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||..||||.||||||||||
Sbjct 1629  TATGGGAGCGTGTTTTTCAAAGGTTTTTAATGGATGTCCCTTGAAAATCCACTGTGCCACATCCTGGATAAACC  1702

Query 1703  CAGATACAAGAGATCAGTACTTGATATTTGGTGCCGAAGAAGGGATTTATACCCTCAATCTTAATGAACTTCAT  1776
            ||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1703  CAGACACGAGAGACCAGTACTTGATATTTGGCGCTGAAGAGGGCATTTATACCCTTAATCTCAATGAACTTCAT  1776

Query 1777  GAAACATCAATGGAACAGCTATTCCCTCGAAGGTGTACATGGTTGTATGTAATGAACAATTGCTTGCTATCAAT  1850
            ||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||.|||||||.||||||||||||.||||.|||.|
Sbjct 1777  GAAACATCAATGGAACAGCTGTTCCCCCGCAGGTGTACGTGGCTGTATGTGATGAACAATTGCCTGCTGTCAGT  1850

Query 1851  ATCTGGTAAAGCTTCTCAGCTTTATTCCCATAATTTACCAGGGCTTTTTGATTATGCAAGACAAATGCAAAAGT  1924
            .||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.
Sbjct 1851  CTCGGGCAAAGCCTCTCAGCTTTACTCCCACAACTTACCGGGGCTTTTCGATTATGCAAGACAGATGCAGAAGC  1924

Query 1925  TACCTGTTGCTATTCCAGCACACAAACTCCCTGACAGAATACTGCCAAGGAAATTTTCTGTATCAGCAAAAATC  1998
            |.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||.
Sbjct 1925  TTCCAGTAGCCATCCCAGCACACAAGCTCCCCGACCGAATACTGCCCAGGAAATTTGCTGTATCAGCAAAGATT  1998

Query 1999  CCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGTTGTGTTGTAAGAAATCCTTACACGGGCCATAAATACCTATGTGGAGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 1999  CCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGCTGCGTGGTGAGAAATCCTTACACGGGCCATAAGTACCTGTGCGGGGC  2072

Query 2073  ACTTCAGACTAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAACCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGATT  2146
            .||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2073  GCTTCAGACCAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAGCCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGAGT  2146

Query 2147  TTCCTATACCATGTCCACTTAGAATGTTTGAAATGCTGGTAGTTCCTGAACAGGAGTACCCTTTAGTTTGTGTT  2220
            |||||||.||.||||||||..|.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||.|.||.||||||
Sbjct 2147  TTCCTATGCCGTGTCCACTCCGGATGTTTGAGATGCTGGTGGTCCCTGAGCAGGAGTACCCTCTGGTCTGTGTT  2220

Query 2221  GGTGTCAGTAGAGGTAGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGATTTGAGACGGTCAATCCAAATTCTACCTCTTCATG  2294
            ||.|||||.|||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 2221  GGCGTCAGCAGAGGGCGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGGTTTGAGACGGTCAATCCCAATTCTACCTCGTCGTG  2294

Query 2295  GTTTACAGAATCAGATACCCCACAGACAAATGTTACTCATGTAACCCAACTGGAGAGAGATACCATCCTTGTAT  2368
            |||||||||.||||||.||||.|||||||..||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 2295  GTTTACAGAGTCAGATGCCCCGCAGACAAGCGTCACTCATGTGACCCAGCTGGAGAGAGACACCATCCTTGTGT  2368

Query 2369  GCTTGGACTGTTGTATAAAAATAGTAAATCTCCAAGGAAGATTAAAATCTAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTC  2442
            |||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GCTTGGATTGTTGTATAAAAATAGTCAATCTCCAAGGAAGGTTGAAATCCAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTC  2442

Query 2443  ACCTTTGATTTCCAGATTGAATCAATAGTGTGCCTACAAGACAGTGTGCTAGCTTTCTGGAAACATGGAATGCA  2516
            |||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 2443  ACCTTCGATTTCCAGATAGAGTCCATAGTTTGTCTACAAGACAGTGTGCTAGCGTTCTGGAAACACGGGATGCA  2516

Query 2517  AGGTAGAAGTTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTTCAGATAGCACAAGAATTTTCAGGCTGCTTGGAT  2590
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 2517  AGGTAGAAGCTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTTCAGATAACACAAGAATCTTCAGACTCCTTGGAT  2590

Query 2591  CTGACAGGGTCGTGGTTTTGGAAAGTAGGCCAACTGATAACCCCACAGCAAATAGCAATTTGTACATCCTGGCG  2664
            ||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||
Sbjct 2591  CTGACAGGGTTGTGGTTTTGGAAAGTCGGCCAACTGATAACCCAACAGCAAATAGCAATTTATACATCTTGGCG  2664

Query 2665  GGTCATGAAAACAGTTACG  2683
            |||||.||||||||.||| 
Sbjct 2665  GGTCACGAAAACAGCTAC-  2682