Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491548
- Subject:
- XM_006524198.2
- Aligned Length:
- 2683
- Identities:
- 2279
- Gaps:
- 118
Alignment
Query 1 ATGAACCCCGGCTTCGATTTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATTCAGCGCATCGGCAGCGG 74
||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAACCCGGGCTTCGATCTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATCCAGCGCATCGGCAGCGG 74
Query 75 CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTTAACACTGGTGAATTAGCAGCAATTAAAGTAATAAAATTGG 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 75 CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTCAACACTGGAGAATTAGCAGCAATTAAAGTGATAAAATTGG 148
Query 149 AACCAGGAGAAGACTTTGCAGTTGTGCAGCAAGAAATTATCATGATGAAAGACTGTAAACACCCAAATATTGTT 222
|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 149 AACCAGGAGAAGACTTTGCGGTTGTACAGCAAGAAATCATTATGATGAAAGACTGCAAACACCCAAACATTGTT 222
Query 223 GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAGCTTTGGATTTGCATGGAGTTTTGTGGAGGTGGTTCTTTACA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 223 GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAACTTTGGATTTGCATGGAATTCTGTGGAGGTGGCTCTTTACA 296
Query 297 GGATATTTATCACGTAACTGGACCTCTGTCAGAACTGCAAATTGCATATGTTAGCAGAGAAACACTGCAGGGAT 370
|||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 297 GGACATATATCATGTAACTGGACCCCTTTCAGAACTGCAGATTGCATATGTTAGCAGAGAAACTCTACAGGGAT 370
Query 371 TATATTATCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACAGAGATATAAAGGGAGCTAACATTCTATTAACGGATAATGGT 444
|.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 371 TGTATTACCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACCGAGATATAAAGGGCGCTAACATTCTCCTAACGGATAATGGT 444
Query 445 CATGTGAAATTGGCTGATTTTGGAGTATCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCTTTCATTGG 518
||.||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 CACGTGAAACTAGCTGATTTTGGAGTTTCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCCTTCATTGG 518
Query 519 CACACCATATTGGATGGCTCCAGAAGTTGCAGCTGTTGAGAGGAAGGGGGGTTACAATCAACTCTGTGATCTCT 592
.||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 519 AACGCCATATTGGATGGCCCCAGAAGTCGCGGCTGTTGAGAGGAAAGGCGGGTACAATCAACTGTGTGACCTCT 592
Query 593 GGGCAGTGGGAATCACTGCCATAGAACTTGCAGAGCTTCAGCCTCCTATGTTTGACTTACACCCAATGAGAGCA 666
||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.|||||.|||||.|||
Sbjct 593 GGGCGGTGGGCATCACTGCCATCGAGCTGGCGGAGCTCCAGCCACCCATGTTTGACCTTCACCCGATGAGGGCA 666
Query 667 TTATTTCTAATGACAAAAAGCAATTTTCAGCCTCCTAAACTAAAGGATAAAATGAAATGGTCAAATAGTTTTCA 740
||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..||||.||||||||||||||.||
Sbjct 667 TTGTTTCTAATGACAAAAAGCAATTTCCAGCCTCCTAAACTAAAAGATAAGTTGAAGTGGTCAAATAGTTTCCA 740
Query 741 TCACTTTGTGAAAATGGCACTTACCAAAAATCCGAAAAAAAGACCTACTGCTGAAAAATTATTACAGCATCCTT 814
|||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|.|||.|||||..|.|||||||||||.|
Sbjct 741 TCATTTTGTGAAGATGGCTCTTACCAAAAATCCAAAGAAAAGACCCAATGCAGAAAAGCTGTTACAGCATCCCT 814
Query 815 TTGTAACACAACATTTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGCTGTTGGATAAAGTAAATAATCCAGATCATTCCACT 888
||||.|||||.|.|.|||||||||||||||||||||||.||.||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 815 TTGTCACACAGCCTCTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGTTGCTGGACAAAGTGAATAATCCAGACCATTCCACA 888
Query 889 TACCATGATTTCGATGATGATGATCCTGAGCCTCTTGTTGCTGTACCACATAGAATTCACTCAACAAGTAGAAA 962
|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||.||||||||
Sbjct 889 TACCACGATTTTGATGATGATGACCCAGAGCCTCTTGTTGCCGTACCACATAGAATTCCTTCAACGAGTAGAAA 962
Query 963 CGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAACCTTTGGCCAAGTGAAATTTGATCCACCCTTAAGAAAGGAGA 1036
.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 963 TGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAAACTTTGGCCAGGTAAAATTTGATCCGCCCTTAAGGAAGGAGA 1036
Query 1037 CAGAACCACATCATGAACTTCCCGACAGTGATGGTTTTTTGGACAGTTCAGAAGAAATATACTACACTGCAAGA 1110
||||.||||||||.||||||
Sbjct 1037 CAGAGCCACATCACGAACTT------------------------------------------------------ 1056
Query 1111 TCTAATCTGGATCTGCAACTGGAATATGGACAAGGACACCAAGGTGGTTACTTTTTAGGTGCAAACAAGAGTCT 1184
|||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|...||.|||.|||||||..|||||||||||
Sbjct 1057 ---------GATCTGCAACTAGAGTACGGACAAGGACACCAAAGCCATTGCTTCTTAGGTGGCAACAAGAGTCT 1121
Query 1185 TCTCAAGTCTGTTGAAGAAGAATTGCATCAGCGAGGACACGTCGCACATTTAGAAGATGATGAAGGAGATGATG 1258
|||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1122 TCTGAAGTCTGTTGAAGAGGAATTACATCAGCG----------------------------------------- 1154
Query 1259 ATGAATCTAAACACTCAACTCTGAAAGCAAAAATTCCACCTCCTTTGCCACCAAAGCCTAAGTCTATCTTCATA 1332
.|||||..|||||||||||.|.||.||||||.||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1155 -------------TTCAACCATGAAAGCAAAAGTCCCGCCTCCTCTGCCACCAAAGCCTAAATCCATCTTCATA 1215
Query 1333 CCACAGGAAATGCATTCTACTGAGGATGAAAATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCATGTCAGGGAGCCCAGC 1406
||||||||.|..||||||.|||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||...|||||||||||.||
Sbjct 1216 CCACAGGATACACATTCTGCTGAGGACGGTAATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCTCATCAGGGAGCCCGGC 1289
Query 1407 AAAGCCATCCCAAGTTCCACCTAGACCACCACCTCCCAGATTACCCCCACACAAACCTGTTGCCTTAGGAAATG 1480
||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||.||..||||||||||
Sbjct 1290 AAAGCCATCCCACGTTCCACCTAGACCACCTCCGCCCAGGTTACCGCCACAGAAGCCTGCTGTTTTAGGAAATG 1363
Query 1481 GAATGAGCTCCTTCCAGTTAAATGGTGAACGAGATGGCTCATTATGTCAACAACAGAATGAACATAGAGGCACA 1554
||.|||.||||||||||.||||||||||.|||||.||.|||||||.|||.||.||||.|||.||.|||||||||
Sbjct 1364 GAGTGAACTCCTTCCAGCTAAATGGTGAGCGAGACGGATCATTATATCAGCAGCAGAGTGAGCAAAGAGGCACA 1437
Query 1555 AACCTTTCAAGAAAAGAAAAGAAAGATGTACCAAAGCCTATTAGTAATGGTCTTCCTCCAACACCTAAAGTGCA 1628
||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1438 AACCTTTCAAGAAAGGAGAAGAAGGACGTCCCGAAACCAATTAGTAATGGTCTTCCCCCAACACCTAAAGTGCA 1511
Query 1629 TATGGGTGCATGTTTTTCAAAAGTTTTTAATGGGTGTCCCTTGAAAATTCACTGTGCATCATCATGGATAAACC 1702
||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||..||||.||||||||||
Sbjct 1512 TATGGGAGCGTGTTTTTCAAAGGTTTTTAATGGATGTCCCTTGAAAATCCACTGTGCCACATCCTGGATAAACC 1585
Query 1703 CAGATACAAGAGATCAGTACTTGATATTTGGTGCCGAAGAAGGGATTTATACCCTCAATCTTAATGAACTTCAT 1776
||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1586 CAGACACGAGAGACCAGTACTTGATATTTGGCGCTGAAGAGGGCATTTATACCCTTAATCTCAATGAACTTCAT 1659
Query 1777 GAAACATCAATGGAACAGCTATTCCCTCGAAGGTGTACATGGTTGTATGTAATGAACAATTGCTTGCTATCAAT 1850
||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||.|||||||.||||||||||||.||||.|||.|
Sbjct 1660 GAAACATCAATGGAACAGCTGTTCCCCCGCAGGTGTACGTGGCTGTATGTGATGAACAATTGCCTGCTGTCAGT 1733
Query 1851 ATCTGGTAAAGCTTCTCAGCTTTATTCCCATAATTTACCAGGGCTTTTTGATTATGCAAGACAAATGCAAAAGT 1924
.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.
Sbjct 1734 CTCGGGCAAAGCCTCTCAGCTTTACTCCCACAACTTACCGGGGCTTTTCGATTATGCAAGACAGATGCAGAAGC 1807
Query 1925 TACCTGTTGCTATTCCAGCACACAAACTCCCTGACAGAATACTGCCAAGGAAATTTTCTGTATCAGCAAAAATC 1998
|.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||.
Sbjct 1808 TTCCAGTAGCCATCCCAGCACACAAGCTCCCCGACCGAATACTGCCCAGGAAATTTGCTGTATCAGCAAAGATT 1881
Query 1999 CCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGTTGTGTTGTAAGAAATCCTTACACGGGCCATAAATACCTATGTGGAGC 2072
||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 1882 CCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGCTGCGTGGTGAGAAATCCTTACACGGGCCATAAGTACCTGTGCGGGGC 1955
Query 2073 ACTTCAGACTAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAACCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGATT 2146
.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1956 GCTTCAGACCAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAGCCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGAGT 2029
Query 2147 TTCCTATACCATGTCCACTTAGAATGTTTGAAATGCTGGTAGTTCCTGAACAGGAGTACCCTTTAGTTTGTGTT 2220
|||||||.||.||||||||..|.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||.|.||.||||||
Sbjct 2030 TTCCTATGCCGTGTCCACTCCGGATGTTTGAGATGCTGGTGGTCCCTGAGCAGGAGTACCCTCTGGTCTGTGTT 2103
Query 2221 GGTGTCAGTAGAGGTAGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGATTTGAGACGGTCAATCCAAATTCTACCTCTTCATG 2294
||.|||||.|||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 2104 GGCGTCAGCAGAGGGCGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGGTTTGAGACGGTCAATCCCAATTCTACCTCGTCGTG 2177
Query 2295 GTTTACAGAATCAGATACCCCACAGACAAATGTTACTCATGTAACCCAACTGGAGAGAGATACCATCCTTGTAT 2368
|||||||||.||||||.||||.|||||||..||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 2178 GTTTACAGAGTCAGATGCCCCGCAGACAAGCGTCACTCATGTGACCCAGCTGGAGAGAGACACCATCCTTGTGT 2251
Query 2369 GCTTGGACTGTTGTATAAAAATAGTAAATCTCCAAGGAAGATTAAAATCTAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTC 2442
|||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2252 GCTTGGATTGTTGTATAAAAATAGTCAATCTCCAAGGAAGGTTGAAATCCAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTC 2325
Query 2443 ACCTTTGATTTCCAGATTGAATCAATAGTGTGCCTACAAGACAGTGTGCTAGCTTTCTGGAAACATGGAATGCA 2516
|||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 2326 ACCTTCGATTTCCAGATAGAGTCCATAGTTTGTCTACAAGACAGTGTGCTAGCGTTCTGGAAACACGGGATGCA 2399
Query 2517 AGGTAGAAGTTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTTCAGATAGCACAAGAATTTTCAGGCTGCTTGGAT 2590
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 2400 AGGTAGAAGCTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTTCAGATAACACAAGAATCTTCAGACTCCTTGGAT 2473
Query 2591 CTGACAGGGTCGTGGTTTTGGAAAGTAGGCCAACTGATAACCCCACAGCAAATAGCAATTTGTACATCCTGGCG 2664
||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||
Sbjct 2474 CTGACAGGGTTGTGGTTTTGGAAAGTCGGCCAACTGATAACCCAACAGCAAATAGCAATTTATACATCTTGGCG 2547
Query 2665 GGTCATGAAAACAGTTACG 2683
|||||.||||||||.|||
Sbjct 2548 GGTCACGAAAACAGCTAC- 2565