Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491644
• Subject: NM_001161576.2
• Aligned Length: 1890
• Identities: 1886
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ---ATGTTTCGCGACCAGGTCGGGGTGCTGGCGGGCTGGTTTAAGGGCTGGAACGAGTGCGAGCAGACTGTTGC  71
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGTTTCGCGACCAGGTCGGGGTGCTGGCGGGCTGGTTTAAGGGCTGGAACGAGTGCGAGCAGACTGTTGC  74

Query   72  GCTGCTGTCGCTGCTCAAGCGCGTGAGCCAGACCCAGGCCCGCTTCCTCCAGCTCTGCCTGGAGCACTCGCTGG  145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTGCTGTCGCTGCTCAAGCGCGTGAGCCAGACCCAGGCCCGCTTCCTCCAGCTCTGCCTGGAGCACTCGCTGG  148

Query  146  CCGACTGCGCCGAGCTGCACGTCCTCGAACGCGAGGCCAACAGCCCCGGAATCATTAACCAATGGCAACAGGAA  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGACTGCGCCGAGCTGCACGTCCTCGAACGCGAGGCCAACAGCCCCGGAATCATTAACCAATGGCAACAGGAA  222

Query  220  TCCAAGGATAAAGTGATTTCCCTCCTGTTAACTCATCTGCCTTTGTTGAAGCCAGGAAACCTCGACGCGAAAGT  293
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCAAGGATAAAGTGATTTCCCTCCTGTTAACTCATCTGCCTTTGCTGAAGCCAGGAAACCTCGACGCGAAAGT  296

Query  294  AGAATATATGAAACTGCTGCCCAAAATCCTGGCTCACTCTATTGAACACAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGC  367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAATATATGAAACTGCTGCCCAAAATCCTGGCTCACTCTATTGAACACAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGC  370

Query  368  AGCTGCTGTCCTATGCTTTGATACATCCAGCCACTTCGTTAGAAGACCGTAGTGCTTTAGCCATGTGGCTGAAT  441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCTGCTGTCCTATGCTTTGATACATCCAGCCACTTCGTTAGAAGACCGTAGTGCTTTAGCCATGTGGCTGAAT  444

Query  442  CACTTGGAGGACCGCACGTCGACCAGCTTTGGTGGCCAGAACCGAGGCCGCTCAGACTCTGTGGATTATGGACA  515
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACTTGGAGGACCGCACGTCGACCAGCTTTGGTGGCCAGAACCGAGGCCGCTCAGACTCTGTGGATTATGGACA  518

Query  516  GACACACTACTATCACCAAAGACAGAACTCTGATGACAAGCTCAATGGGTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGA  589
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACACACTACTATCACCAAAGACAGAACTCTGATGACAAGCTCAATGGGTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGA  592

Query  590  TTTGCATCAATGCCTCCAACTGGCAGGACAAAAGCATGGGGTGTGAGAATGGCCATGTGCCCCTCTACTCCTCC  663
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTGCATCAATGCCTCCAACTGGCAGGACAAAAGCATGGGGTGTGAGAATGGCCATGTGCCCCTCTACTCCTCC  666

Query  664  TCATCTGTCCCCACCACAATCAATACGATTGGAACCAGCACAAGTACAAATGTTCCAGCCTGGCTGAAAAGCCT  737
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCATCTGTCCCCACCACAATCAATACGATTGGAACCAGCACAAGTACAAATGTTCCAGCCTGGCTGAAAAGCCT  740

Query  738  CCGCCTGCACAAATATGCCGCGCTTTTCTCCCAGATGACCTATGAGGAGATGATGGCCCTCACCGAGTGCCAGC  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCGCCTGCACAAATATGCCGCGCTTTTCTCCCAGATGACCTATGAGGAGATGATGGCCCTCACCGAGTGCCAGC  814

Query  812  TGGAGGCGCAGAATGTTACCAAAGGTGCAAGACACAAAATTGTCATCAGTATTCAGAAGCTCAAAGAAAGACAA  885
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGAGGCGCAGAATGTTACCAAAGGTGCAAGACACAAAATTGTCATCAGTATTCAGAAGCTCAAAGAAAGACAA  888

Query  886  AATCTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGACATCATCGAGGGGGGCAGCCTGCGCATCCCGCTCCAGGAACTGCACCA  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AATCTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGACATCATCGAGGGGGGCAGCCTGCGCATCCCGCTCCAGGAACTGCACCA  962

Query  960  GATGATCCTGACTCCGATCAAGGCCTACAGCTCCCCGAGCACCACCCCCGAGGCTCGCCGCCGGGAGCCCCAGG  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GATGATCCTGACTCCGATCAAGGCCTACAGCTCCCCGAGCACCACCCCCGAGGCTCGCCGCCGGGAGCCCCAGG  1036

Query 1034  CCCCGCGTCAGCCCTCACTGATGGGCCCCGAGAGCCAGAGCCCCGACTGCAAAGATGGGGCCGCAGCCACTGGC  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCCCGCGTCAGCCCTCACTGATGGGCCCCGAGAGCCAGAGCCCCGACTGCAAAGATGGGGCCGCAGCCACTGGC  1110

Query 1108  GCCACGGCCACCCCCTCGGCCGGGGCCAGCGGGGGGCTCCAGCCGCACCAGCTGAGCAGCTGCGATGGGGAGCT  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCACGGCCACCCCCTCGGCCGGGGCCAGCGGGGGGCTCCAGCCGCACCAGCTGAGCAGCTGCGATGGGGAGCT  1184

Query 1182  GGCCGTCGCCCCCCTGCCAGAGGGGGACCTCCCCGGGCAGTTCACACGCGTCATGGGGAAAGTGTGCACACAGC  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCCGTCGCCCCCCTGCCAGAGGGGGACCTCCCCGGGCAGTTCACACGCGTCATGGGGAAAGTGTGCACACAGC  1258

Query 1256  TCTTGGTCTCCAGACCTGATGAGGAAAATATAAGTTCCTATTTACAGCTCATAGACAAGTGTCTAATTCATGAG  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTTGGTCTCCAGACCTGATGAGGAAAATATAAGTTCCTATTTACAGCTCATAGACAAGTGTCTAATTCATGAG  1332

Query 1330  GCATTTACAGAGACACAGAAAAAAAGATTGTTGTCATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGTCTTTCCC  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCATTTACAGAGACACAGAAAAAAAGATTGTTGTCATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGTCTTTCCC  1406

Query 1404  TCGGAAAACCCTTCTAGACATATCAGGATATCGACAGCAAAGAAATCGAGGCTTTGGGCAATCCAACTCCCTCC  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCGGAAAACCCTTCTAGACATATCAGGATATCGACAGCAAAGAAATCGAGGCTTTGGGCAATCCAACTCCCTCC  1480

Query 1478  CGACGGCTGGCTCTGTGGGCGGTGGCATGGGCAGACGGAACCCGCGCCAGTACCAGATCCCCTCTCGGAACGTC  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CGACGGCTGGCTCTGTGGGCGGTGGCATGGGCAGACGGAACCCGCGCCAGTACCAGATCCCCTCTCGGAACGTC  1554

Query 1552  CCTTCCGCCCGCCTGGGCCTCTTGGGCACCAGTGGATTCGTCAGCTCCAACCAGCGCAACACCACAGCTACCCC  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCTTCCGCCCGCCTGGGCCTCTTGGGCACCAGTGGATTCGTCAGCTCCAACCAGCGCAACACCACAGCTACCCC  1628

Query 1626  CACCATCATGAAACAAGGAAGACAGAACCTGTGGTTTGCCAACCCCGGGGGCAGCAATAGCATGCCAAGCCGCA  1699
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CACCATCATGAAACAAGGAAGACAGAACCTGTGGTTTGCCAACCCCGGGGGCAGCAATAGCATGCCAAGCCGCA  1702

Query 1700  CCCACAGCTCAGTCCAGAGGACCCGCTCGCTGCCCGTGCACACTTCCCCACAGAACATGCTGATGTTCCAGCAG  1773
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCCACAGCTCAGTCCAGAGGACCCGCTCGCTGCCCGTGCACACTTCCCCACAGAACATGCTGATGTTCCAGCAG  1776

Query 1774  CCAGAATTCCAGCTTCCCGTGACCGAACCTGACATCAACAACAGGCTGGAGTCGTTGTGCCTCAGTATGACCGA  1847
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCAGAATTCCAGCTTCCCGTGACCGAACCTGACATCAACAACAGGCTGGAGTCGTTGTGCCTCAGTATGACCGA  1850

Query 1848  ACACGCCCTGGGAGACGGGGTTGACCGGACCTCCACCATC  1887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACACGCCCTGGGAGACGGGGTTGACCGGACCTCCACCATC  1890