Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491646
• Subject: XM_011513455.2
• Aligned Length: 1876
• Identities: 1290
• Gaps: 581

Alignment

Query    1  ATGGAGCTCGAGAACATCGTGGCCAACTCGCTGCTGCTGAAAGCGCGTCAAGGAGGATATGGCAAAAAAAGTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCTCGAGAACATCGTGGCCAACTCGCTGCTGCTGAAAGCGCGTCAAGGAGGATATGGCAAAAAAAGTGG  74

Query   75  TCGTAGTAAAAAATGGAAGGAGATACTGACACTGCCTCCTGTCAGCCAGTGCAGTGAGCTTAGACATTCCATTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCGTAGTAAAAAATGGAAGGAGATACTGACACTGCCTCCTGTCAGCCAGTGCAGTGAGCTTAGACATTCCATTG  148

Query  149  AAAAGGATTATAGCAGTCTTTGTGACAAGCAACCGATAGGAAGACGTCTCTTCAGGCAGTTCTGTGATACCAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAAAGGATTATAGCAGTCTTTGTGACAAGCAACCGATAGGAAGACGTCTCTTCAGGCAGTTCTGTGATACCAAA  222

Query  223  CCCACTCTAAAGAGGCACATTGAATTCTTGGATGCAGTGGCAGAATATGAAGTTGCCGATGATGAGGACCGAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCACTCTAAAGAGGCACATTGAATTCTTGGATGCAGTGGCAGAATATGAAGTTGCCGATGATGAGGACCGAAG  296

Query  297  TGATTGTGGACTGTCAATCTTAGATAGATTCTTCAATGATAAGTTGGCAGCCCCTTTACCAGAAATACCTCCAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGATTGTGGACTGTCAATCTTAGATAGATTCTTCAATGATAAGTTGGCAGCCCCTTTACCAGAAATACCTCCAG  370

Query  371  ATGTTGTGACAGAATGTAGATTGGGACTGAAGGAGGAGAACCCTTCCAAAAAAGCCTTTGAGGAATGTACTAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGTTGTGACAGAATGTAGATTGGGACTGAAGGAGGAGAACCCTTCCAAAAAAGCCTTTGAGGAATGTACTAGA  444

Query  445  GTTGCCCATAACTACCTAAGAGGGGAACCATTTGAAGAATACCAAGAAAGCTCATATTTTTCTCAGTTTTTACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTGCCCATAACTACCTAAGAGGGGAACCATTTGAAGAATACCAAGAAAGCTCATATTTTTCTCAGTTTTTACA  518

Query  519  ATGGAAATGGCTGGAAAGGCAACCCGTAACAAAGAACACATTTAGACATTACAGAGTTCTAGGAAAAGGCGGAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATGGAAATGGCTGGAAAGGCAACCCGTAACAAAGAACACATTTAGACATTACAGAGTTCTAGGAAAAGGCGGAT  592

Query  593  TTGGAGAG------------------------------------------------------------------  600
            ||||||||                                                                  
Sbjct  593  TTGGAGAGCAGTCCCCTGTGGGGTGTGCAGTGGATGGGAGTTGGAAGAAACAGCAGCCTAATGTTGATGACACA  666

Query  601  ---------------------------------------------------GTTTGCGCCTGTCAAGTGCGAGC  623
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGCACGGGGACCAGAACCTGAGGCTCATGATACTATTTTTTCCACTTTTGTTTGCGCCTGTCAAGTGCGAGC  740

Query  624  CACAGGAAAAATGTATGCCTGCAAAAAGCTACAAAAAAAAAGAATAAAGAAGAGGAAAGGTGAAGCTATGGCTC  697
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CACAGGAAAAATGTATGCCTGCAAAAAGCTACAAAAAAAAAGAATAAAGAAGAGGAAAGGTGAAGCTATGGCTC  814

Query  698  TAAATGAGAAAAGAATTCTGGAGAAAGTGCAAAGTAGATTCGTAGTTAGTTTAGCCTACGCTTATGAAACCAAA  771
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAAATGAGAAAAGAATTCTGGAGAAAGTGCAAAGTAGATTCGTAGTTAGTTTAGCCTACGCTTATGAAACCAAA  888

Query  772  GATGCCTTGTGCTTGGTGCTCACCATTATGAATGGAGGGGATTTGAAGTTTCACATTTACAACCTGGGCAATCC  845
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATGCCTTGTGCTTGGTGCTCACCATTATGAATGGAGGGGATTTGAAGTTTCACATTTACAACCTGGGCAATCC  962

Query  846  CGGCTTTGATGAGCAGAGAGCCGTTTTCTATGCTGCAGAGCTGTGTTGCGGCTTGGAAGATTTACAGAGGGAAA  919
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGGCTTTGATGAGCAGAGAGCCGTTTTCTATGCTGCAGAGCTGTGTTGCGGCTTGGAAGATTTACAGAGGGAAA  1036

Query  920  GAATTGTATACAGAGACTTGAAGCCTGAGAATATTCTCCTTGATGATCGTGGACACATCCGGATTTCAGACCTC  993
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAATTGTATACAGAGACTTGAAGCCTGAGAATATTCTCCTTGATGATCGTGGACACATCCGGATTTCAGACCTC  1110

Query  994  GGTTTGGCCACAGAGATCCCAGAAGGACAGAGGGTTCGAGGAAGAGTTGGAACAGTCGGCTACATGGCACCTGA  1067
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGTTTGGCCACAGAGATCCCAGAAGGACAGAGGGTTCGAGGAAGAGTTGGAACAGTCGGCTACATGGCACCTGA  1184

Query 1068  AGTTGTCAATAATGAAAAGTATACGTTTAGTCCCGATTGGTGGGGACTTGGCTGTCTGATCTATGAAATGATTC  1141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGTTGTCAATAATGAAAAGTATACGTTTAGTCCCGATTGGTGGGGACTTGGCTGTCTGATCTATGAAATGATTC  1258

Query 1142  AGGGACATTCTCCATTCAAAAAATACAAAGAGAAAGTCAAATGGGAGGAGGTCGATCAAAGAATCAAGAATGAT  1215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGGACATTCTCCATTCAAAAAATACAAAGAGAAAGTCAAATGGGAGGAGGTCGATCAAAGAATCAAGAATGAT  1332

Query 1216  ACCGAGGAGTATTCTGAGAAGTTTTCAGAGGATGCCAAATCTATCTGCAGGATG---TTACTCACCA-------  1279
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |..||.||||       
Sbjct 1333  ACCGAGGAGTATTCTGAGAAGTTTTCAGAGGATGCCAAATCTATCTGCAGGATGGGCTGCCTGACCATGGTCCC  1406

Query 1280  ---------------AGAATCCAAGCAAGCGGCTGGGCTGCAGGGGCGAGGGAGCGGCTGGGGTGAAGCAGCAC  1338
                           .|||.||||||||          |||                                 
Sbjct 1407  CAGTGAGAAGGAAGTGGAACCCAAGCAA----------TGC---------------------------------  1437

Query 1339  CCCGTGTTCAAGGACATCAACTTCAGGAGGCTGGAGGCAAACATGCTGGAGCCCCCTTTCTGTCCTGATCCTCA  1412
                                                                                      
Sbjct 1438  --------------------------------------------------------------------------  1437

Query 1413  TGCCGTTTACTGTAAGGACGTCCTGGATATCGAGCAGTTCTCGGCGGTGAAAGGGATCTACCTGGACACCGCAG  1486
                                                                                      
Sbjct 1438  --------------------------------------------------------------------------  1437

Query 1487  ATGAAGACTTCTATGCTCGGTTTGCTACCGGGTGTGTCTCCATCCCCTGGCAGAATGAGATGATCGAATCTGGG  1560
                                                                                      
Sbjct 1438  --------------------------------------------------------------------------  1437

Query 1561  TGTTTCAAAGACATCAACAAAAGTGAAAGTGAGGAAGCTTTGCCATTAGATCTAGACAAGAACATACATACCCC  1634
                                                                                      
Sbjct 1438  --------------------------------------------------------------------------  1437

Query 1635  GGTTTCCAGACCAAACAGAGGCTTCTTCTATAGACTCTTCAGAAGAGGGGGCTGCCTGACCATGGTCCCCAGTG  1708
                                                                                      
Sbjct 1438  --------------------------------------------------------------------------  1437

Query 1709  AGAAGGAAGTGGAACCCAAGCAATGC  1734
                                      
Sbjct 1438  --------------------------  1437