Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000492319
- Subject:
- NM_001190786.1
- Aligned Length:
- 1482
- Identities:
- 1005
- Gaps:
- 372
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTTGCGCCGCGATGGCCGGAGCTGCTGGCCGGGTCGAGGTCGAGCCCGAGCCCGAGCCCAAGCCCAAGCTCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GAATCCACTTTCCCTGCCCCTGACTGGTTTGAGCAACTTGCATCTTAAGGAGGAGAAAATCAAACCAGATGCCA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ATGGTGCTGTTGTTAAGACCAATGCAAACACAGAGAAGACAGAGGAAGATGAGAAAGAGGACAGAGCTGCTCAG 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 TCTTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAATCTTGTGGATAACACCAACCAAGTGGAAGTCCTGCAGAGGGACCC 296
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 297 AAGCTCCCCGCTCTACTCAGTGAAGTCCTTCGAAGAGCTTCGCCTGAAACCACAGCTTCTCCAGGGAGTCTATG 370
Query 1 --ATGGGTTTCAATCGTCCATCCAAGATACAAGAGAACGCATTGCCACTGATGCTTGCTGAGCCCCCACAGAAC 72
|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||||||||..|||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 371 CTATGGGTTTCAACCGCCCTTCCAAAATACAGGAAAATGCATTGCCTTTGATGCTTGCTGAACCCCCACAGAAC 444
Query 73 TTAATTGCCCAATCTCAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCCTTCGTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACC 146
|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||..||||..||||.|||||||||||.||
Sbjct 445 TTAATTGCCCAGTCTCAGTCTGGTACGGGTAAAACAGCTGCCTTTGTTTTGGCTGTGCTCAGCCAAGTAGAGCC 518
Query 147 TGCAAACAAATACCCCCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTATGAGCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTG 220
|||||||||.|...||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGCAAACAAGTTTGCCCAGTGTCTCTGCCTCTCTCCAACCTATGAGCTTGCTCTTCAAACAGGAAAAGTGATTG 592
Query 221 AACAAATGGGCAAATTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAG 294
|.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||
Sbjct 593 AGCAGATGGGCAAGTTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTGTTCGAGGCAACAAATTGGAGAGGGGTCAG 666
Query 295 AAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTGCTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGA 368
|||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 AAGGTGAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCCGGGACCGTCTTGGACTGGTGCTCCAAGCTGAAGTTCATTGA 740
Query 369 TCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGA 442
.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 741 CCCCAAGAAGATCAAGGTGTTTGTTCTGGACGAGGCTGATGTGATGATAGCGACTCAGGGCCACCAAGACCAGA 814
Query 443 GCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTG 516
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 815 GCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGAAACTGCCAGATGCTGCTTTTCTCGGCCACCTTTGAAGACTCGGTG 888
Query 517 TGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATCAAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACAC 590
|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 889 TGGAAGTTTGCCCAGAAGGTGGTCCCAGACCCCAACATCATCAAGCTGAAGCGTGAGGAGGAGACTCTGGACAC 962
Query 591 CATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCA 664
||||||.||||||||.|||||.||||..|.||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||||
Sbjct 963 CATCAAACAGTACTACGTCCTCTGCAATAACAGAGAGGAGAAGTTCCAGGCCCTGTGCAATCTGTATGGGGCCA 1036
Query 665 TCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAA 738
|||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCACCATCGCCCAAGCCATGATCTTCTGCCATACCCGCAAAACAGCTAGCTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAA 1110
Query 739 GAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAACAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCG 812
||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1111 GAGGGCCACCAGGTGGCCCTGCTGAGTGGAGAGATGATGGTGGAGCAGAGGGCTGCGGTGATCGAGCGCTTCCG 1184
Query 813 AGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCG 886
|||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1185 AGAAGGCAAAGAGAAGGTTCTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCGTGGTATCGATGTTGAACAGGTGTCTGTCG 1258
Query 887 TCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGC 960
|||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1259 TCATCAATTTTGACCTCCCTGTGGACAAGGACGGGAACCCAGACAATGAGACCTACCTGCACCGCATTGGGCGC 1332
Query 961 ACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAG 1034
||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1333 ACTGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGTCTGGCGGTCAACATGGTGGACAGCAAGCACAGCATGAATATCCTCAACAG 1406
Query 1035 AATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCA 1108
.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1407 GATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGACTGGACACAGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATCGCCA 1480
Query 1109 AC 1110
||
Sbjct 1481 AC 1482