Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000492319
- Subject:
- NM_001190800.1
- Aligned Length:
- 1437
- Identities:
- 970
- Gaps:
- 363
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCTACGGATTCTTGGGCCCTAGCAGTAGACGAACAGGAAGCCGCAGCTGAGTCTTTGAGCAACTTGCATCT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TAAGGAGGAGAAAATCAAACCAGATGCCAATGGTGCTGTTGTTAAGACCAATGCAAACACAGAGAAGACAGAGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 AAGATGAGAAAGAGGACAGAGCTGCTCAGTCTTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAATCTTGTGGATAACACC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 AACCAAGTGGAAGTCCTGCAGAGGGACCCAAGCTCCCCGCTCTACTCAGTGAAGTCCTTCGAAGAGCTTCGCCT 296
Query 1 -------------------------------ATGGGTTTCAATCGTCCATCCAAGATACAAGAGAACGCATTGC 43
|||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 297 GAAACCACAGCTTCTCCAGGGAGTCTATGCTATGGGTTTCAACCGCCCTTCCAAAATACAGGAAAATGCATTGC 370
Query 44 CACTGATGCTTGCTGAGCCCCCACAGAACTTAATTGCCCAATCTCAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCCTTC 117
|..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 371 CTTTGATGCTTGCTGAACCCCCACAGAACTTAATTGCCCAGTCTCAGTCTGGTACGGGTAAAACAGCTGCCTTT 444
Query 118 GTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTATGA 191
||..||||..||||.|||||||||||.|||||||||||.|...||||||||||.||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 445 GTTTTGGCTGTGCTCAGCCAAGTAGAGCCTGCAAACAAGTTTGCCCAGTGTCTCTGCCTCTCTCCAACCTATGA 518
Query 192 GCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAATTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTG 265
|||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTTGCTCTTCAAACAGGAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAGTTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTG 592
Query 266 TTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTGCTG 339
||||||||||.||||||||.||.||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||..||
Sbjct 593 TTCGAGGCAACAAATTGGAGAGGGGTCAGAAGGTGAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCCGGGACCGTCTTG 666
Query 340 GACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCAT 413
|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 667 GACTGGTGCTCCAAGCTGAAGTTCATTGACCCCAAGAAGATCAAGGTGTTTGTTCTGGACGAGGCTGATGTGAT 740
Query 414 GATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGC 487
||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 741 GATAGCGACTCAGGGCCACCAAGACCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGAAACTGCCAGATGCTGC 814
Query 488 TTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATCAAA 561
|||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|.|||||.
Sbjct 815 TTTTCTCGGCCACCTTTGAAGACTCGGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAGGTGGTCCCAGACCCCAACATCATCAAG 888
Query 562 CTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTT 635
||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||..|.||||||.||||||||
Sbjct 889 CTGAAGCGTGAGGAGGAGACTCTGGACACCATCAAACAGTACTACGTCCTCTGCAATAACAGAGAGGAGAAGTT 962
Query 636 CCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAG 709
|||||||.||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 963 CCAGGCCCTGTGCAATCTGTATGGGGCCATCACCATCGCCCAAGCCATGATCTTCTGCCATACCCGCAAAACAG 1036
Query 710 CTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAA 783
||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1037 CTAGCTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAGGGCCACCAGGTGGCCCTGCTGAGTGGAGAGATGATGGTGGAG 1110
Query 784 CAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCG 857
|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CAGAGGGCTGCGGTGATCGAGCGCTTCCGAGAAGGCAAAGAGAAGGTTCTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCG 1184
Query 858 CGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACA 931
.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1185 TGGTATCGATGTTGAACAGGTGTCTGTCGTCATCAATTTTGACCTCCCTGTGGACAAGGACGGGAACCCAGACA 1258
Query 932 ATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGAC 1005
|||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 1259 ATGAGACCTACCTGCACCGCATTGGGCGCACTGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGTCTGGCGGTCAACATGGTGGAC 1332
Query 1006 AGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGA 1079
|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||| ||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1333 AGCAAGCACAGCATGAATATCCTCAACAGGATCCAGGAGCATTTTA-----AAGATAGAAAGACTGGACACAGA 1401
Query 1080 TGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC 1110
Sbjct 1402 ------------------------------- 1401