Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492319
• Subject: NM_001320522.1
• Aligned Length: 1357
• Identities: 1050
• Gaps: 263

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCACCGACTCGTGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAAGCGGCTGTCAAGTCGATGACCAATTTGCAGAT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CAAGGAAGAGAAAGTCAAAGCAGATACCAATGGTATTATCAAAACCAGTACCACTGCCGAGAAAACAGATGAAG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AGGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACAAAC  222

Query    1  ---ATGGGTTTCAATCGTCCATCCAA---GATACAAGAGAACGCATTGCCACTGATGCTTGCTGA---------  59
               .|||     ||  |||| |.|||   |||.||    |||   |..||.||| |.||.|.|||         
Sbjct  223  CAAGTGG-----AA--GTCC-TGCAACGGGATCCA----AAC---TCCCCTCTG-TACTCGGTGAAGTCGTTTG  280

Query   60  ----------GCCCCCACAGAACTTAATTGCCCAATCTCAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCCTTCGTGCTG  123
                      ||.|||||||||..|.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||..|.
Sbjct  281  AAGAGCTTCGGCTCCCACAGAATCTGATTGCCCAGTCTCAGTCTGGCACTGGTAAAACAGCTGCCTTTGTCTTA  354

Query  124  GCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTATGAGCTCGC  197
            ||||||||.||||.|||.||.||..||.|||.|||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||
Sbjct  355  GCCATGCTCAGCCGAGTGGAGCCATCAGACAGATACCCCCAGTGTCTGTGCCTCTCCCCAACATATGAGCTGGC  428

Query  198  CCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAATTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTGTTCGAG  271
            .||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct  429  GCTTCAAACAGGAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAATTTTACCCAGAACTGAAGCTTGCCTATGCCGTTCGAG  502

Query  272  GCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTGCTGGACTGG  345
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  503  GCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACCGTGCTGGACTGG  576

Query  346  TGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCATGATAGC  419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  577  TGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCATGATAGC  650

Query  420  CACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGCTTTTCT  493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  651  CACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTGCTTTTCT  724

Query  494  CCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATCAAACTGAAG  567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  725  CCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAATGTTATCAAACTGAAG  798

Query  568  CGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCAGGC  641
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  CGTGAGGAAGAGACCCTGGATACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCAGGC  872

Query  642  CTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAGCTAGTT  715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  873  CTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACAGCTAGTT  946

Query  716  GGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAACAGAGG  789
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  947  GGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGAGCAGAGG  1020

Query  790  GCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCGCGGCAT  863
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021  GCTGCGGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCCGCGGCAT  1094

Query  864  TGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACAATGAGA  937
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095  TGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGACAATGAGA  1168

Query  938  CCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGACAGCAAG  1011
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169  CCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGACAGCAAG  1242

Query 1012  CACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGATGATTT  1085
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243  CACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAGATGATTT  1316

Query 1086  GGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1110
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317  GGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1341