Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00052
• Subject: NM_000382.3
• Aligned Length: 1530
• Identities: 1447
• Gaps: 81

Alignment

Query    1  ATGGAGCTCGAAGTCCGGCGGGTCCGACAGGCGTTCCTGTCCGGCCGGTCGCGACCTCTGCGGTTTCGGCTGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCTCGAAGTCCGGCGGGTCCGACAGGCGTTCCTGTCCGGCCGGTCGCGACCTCTGCGGTTTCGGCTGCA  74

Query   75  GCAGCTGGAGGCCCTGCGGAGGATGGTGCAGGAGCGCGAGAAGGATATCCTGACGGCCATCGCCGCCGACCTGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCAGCTGGAGGCCCTGCGGAGGATGGTGCAGGAGCGCGAGAAGGATATCCTGACGGCCATCGCCGCCGACCTGT  148

Query  149  GCAAGAGTGAATTCAATGTGTACAGTCAGGAAGTCATTACTGTCCTTGGGGAAATTGATTTTATGCTTGAGAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAAGAGTGAATTCAATGTGTACAGTCAGGAAGTCATTACTGTCCTTGGGGAAATTGATTTTATGCTTGAGAAT  222

Query  223  CTTCCTGAATGGGTTACTGCTAAACCAGTTAAGAAGAACGTGCTCACCATGCTGGATGAGGCCTATATTCAGCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTCCTGAATGGGTTACTGCTAAACCAGTTAAGAAGAACGTGCTCACCATGCTGGATGAGGCCTATATTCAGCC  296

Query  297  ACAGCCTCTGGGAGTGGTGCTGATAATCGGAGCTTGGAATTACCCCTTCGTTCTCACCATTCAGCCACTGATAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACAGCCTCTGGGAGTGGTGCTGATAATCGGAGCTTGGAATTACCCCTTCGTTCTCACCATTCAGCCACTGATAG  370

Query  371  GAGCCATCGCTGCAGGAAATGCTGTGATTATAAAGCCTTCTGAACTGAGTGAAAATACAGCCAAGATCTTGGCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGCCATCGCTGCAGGAAATGCTGTGATTATAAAGCCTTCTGAACTGAGTGAAAATACAGCCAAGATCTTGGCA  444

Query  445  AAGCTTCTCCCTCAGTATTTAGACCAGGATCTCTATATTGTTATTAATGGTGGTGTTGAGGAAACCACGGAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGCTTCTCCCTCAGTATTTAGACCAGGATCTCTATATTGTTATTAATGGTGGTGTTGAGGAAACCACGGAGCT  518

Query  519  CCTGAAGCAGCGATTTGACCACATTTTCTATACGGGAAACACTGCGGTTGGCAAAATTGTCATGGAAGCTGCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTGAAGCAGCGATTTGACCACATTTTCTATACGGGAAACACTGCGGTTGGCAAAATTGTCATGGAAGCTGCTG  592

Query  593  CCAAGCATCTGACCCCTGTGACTCTTGAACTGGGAGGGAAAAGTCCATGTTATATTGATAAAGATTGTGACCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAAGCATCTGACCCCTGTGACTCTTGAACTGGGAGGGAAAAGTCCATGTTATATTGATAAAGATTGTGACCTG  666

Query  667  GACATTGTTTGCAGACGCATAACCTGGGGAAAATACATGAATTGTGGCCAAACCTGCATTGCACCCGACTATAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACATTGTTTGCAGACGCATAACCTGGGGAAAATACATGAATTGTGGCCAAACCTGCATTGCACCCGACTATAT  740

Query  741  TCTCTGTGAAGCATCCCTCCAAAATCAAATTGTATGGAAGATTAAGGAAACAGTGAAGGAATTTTATGGAGAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCTCTGTGAAGCATCCCTCCAAAATCAAATTGTATGGAAGATTAAGGAAACAGTGAAGGAATTTTATGGAGAAA  814

Query  815  ATATAAAAGAGTCTCCTGATTATGAAAGGATCATCAATCTTCGTCATTTTAAGAGGATACTAAGTTTGCTTGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATATAAAAGAGTCTCCTGATTATGAAAGGATCATCAATCTTCGTCATTTTAAGAGGATACTAAGTTTGCTTGAA  888

Query  889  GGACAAAAGATAGCTTTTGGTGGGGAGACTGATGAGGCCACACGCTACATAGCCCCAACAGTACTTACCGATGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGACAAAAGATAGCTTTTGGTGGGGAGACTGATGAGGCCACACGCTACATAGCCCCAACAGTACTTACCGATGT  962

Query  963  TGATCCTAAAACCAAGGTGATGCAAGAAGAAATTTTTGGACCAATTCTTCCAATAGTGCCTGTGAAAAATGTAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGATCCTAAAACCAAGGTGATGCAAGAAGAAATTTTTGGACCAATTCTTCCAATAGTGCCTGTGAAAAATGTAG  1036

Query 1037  ATGAGGCCATAAATTTCATAAATGAACGTGAAAAGCCTCTGGCTCTTTATGTATTTTCGCATAACCATAAGCTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGAGGCCATAAATTTCATAAATGAACGTGAAAAGCCTCTGGCTCTTTATGTATTTTCGCATAACCATAAGCTC  1110

Query 1111  ATCAAACGGATGATTGATGAGACATCCAGTGGAGGTGTCACAGGCAATGACGTCATTATGCACTTCACGCTCAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATCAAACGGATGATTGATGAGACATCCAGTGGAGGTGTCACAGGCAATGACGTCATTATGCACTTCACGCTCAA  1184

Query 1185  CTCTTTCCCATTTGGAGGAGTGGGTTCCAGTGGGATGGGAGCTTATCACGGAAAACATAGTTTTGATACTTTTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCTTTCCCATTTGGAGGAGTGGGTTCCAGTGGGATGGGAGCTTATCACGGAAAACATAGTTTTGATACTTTTT  1258

Query 1259  CTCATCAGCGTCCCTGTTTATTAAAAAGTTTAAAGAGAGAAGGTGCTAACAAACTCAGATATCCTCCCAACAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTCATCAGCGTCCCTGTTTATTAAAAAGTTTAAAGAGAGAAGGTGCTAACAAACTCAGATATCCTCCCAACAGC  1332

Query 1333  CAGTCAAAGGTGGATTGGGGAAAATTTTTTCTCTTGAAACGGTTCAACAAAGAAAAACTCGGTCTCCTGTTGCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGTCAAAGGTGGATTGGGGAAAATTTTTTCTCTTGAAACGGTTCAACAAAGAAAAACTCGGTCTCCTGTTGCT  1406

Query 1407  CACTTTCCTGGGTATTGTAGCCGCTGTGCTTGTCAAG------AAATACCAAGCTGTGCTGAGGAGAAAGGCCC  1474
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      .|.|||                         
Sbjct 1407  CACTTTCCTGGGTATTGTAGCCGCTGTGCTTGTCAAGGCAGAATATTAC-------------------------  1455

Query 1475  TGTTGATTTTTCTGGTAGTTCACAGACTGCGTTGGTCCAGTAAGCAGAGA  1524
                                                              
Sbjct 1456  --------------------------------------------------  1455