Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00052
- Subject:
- NM_001369146.1
- Aligned Length:
- 1529
- Identities:
- 1256
- Gaps:
- 262
Alignment
Query 1 ATGGAGCTCGAAGTCCGGCGGGTCCGACAGGCGTTCCTGTCCGGCCGGTCGCGACCTCTGCGGTTTCGGCTGCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGCTCGAAGTCCGGCGGGTCCGACAGGCGTTCCTGTCCGGCCGGTCGCGACCTCTGCGGTTTCGGCTGCA 74
Query 75 GCAGCTGGAGGCCCTGCGGAGGATGGTGCAGGAGCGCGAGAAGGATATCCTGACGGCCATCGCCGCCGACCTGT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCAGCTGGAGGCCCTGCGGAGGATGGTGCAGGAGCGCGAGAAGGATATCCTGACGGCCATCGCCGCCGACCTGT 148
Query 149 GCAAGAGTGAATTCAATGTGTACAGTCAGGAAGTCATTACTGTCCTTGGGGAAATTGATTTTATGCTTGAGAAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCAAGAGTGAATTCAATGTGTACAGTCAGGAAGTCATTACTGTCCTTGGGGAAATTGATTTTATGCTTGAGAAT 222
Query 223 CTTCCTGAATGGGTTACTGCTAAACCAGTTAAGAAGAACGTGCTCACCATGCTGGATGAGGCCTATATTCAGCC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTTCCTGAATGGGTTACTGCTAAACCAGTTAAGAAGAACGTGCTCACCATGCTGGATGAGGCCTATATTCAGCC 296
Query 297 ACAGCCTCTGGGAGTGGTGCTGATAATCGGAGCTTGGAATTACCCCTTCGTTCTCACCATTCAGCCACTGATAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ACAGCCTCTGGGAGTGGTGCTGATAATCGGAGCTTGGAATTACCCCTTCGTTCTCACCATTCAGCCACTGATAG 370
Query 371 GAGCCATCGCTGCAGGAAATGCTGTGATTATAAAGCCTTCTGAACTGAGTGAAAATACAGCCAAGATCTTGGCA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GAGCCATCGCTGCAGGAAATGCTGTGATTATAAAGCCTTCTGAACTGAGTGAAAATACAGCCAAGATCTTGGCA 444
Query 445 AAGCTTCTCCCTCAGTATTTAGACCAGGATCTCTATATTGTTATTAATGGTGGTGTTGAGGAAACCACGGAGCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAGCTTCTCCCTCAGTATTTAGACCAGGATCTCTATATTGTTATTAATGGTGGTGTTGAGGAAACCACGGAGCT 518
Query 519 CCTGAAGCAGCGATTTGACCACATTTTCTATACGGGAAACACTGCGGTTGGCAAAATTGTCATGGAAGCTGCTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCTGAAGCAGCGATTTGACCACATTTTCTATACGGGAAACACTGCGGTTGGCAAAATTGTCATGGAAGCTGCTG 592
Query 593 CCAAGCATCTGACCCCTGTGACTCTTGAACTGGGAGGGAAAAGTCCATGTTATATTGATAAAGATTGTGACCTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCAAGCATCTGACCCCTGTGACTCTTGAACTGGGAGGGAAAAGTCCATGTTATATTGATAAAGATTGTGACCTG 666
Query 667 GACATTGTTTGCAGACGCATAACCTGGGGAAAATACATGAATTGTGGCCAAACCTGCATTGCACCCGACTATAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GACATTGTTTGCAGACGCATAACCTGGGGAAAATACATGAATTGTGGCCAAACCTGCATTGCACCCGACTATAT 740
Query 741 TCTCTGTGAAGCATCCCTCCAAAATCAAATTGTATGGAAGATTAAGGAAACAGTGAAGGAATTTTATGGAGAAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCTCTGTGAAGCATCCCTCCAAAATCAAATTGTATGGAAGATTAAGGAAACAGTGAAGGAATTTTATGGAGAAA 814
Query 815 ATATAAAAGAGTCTCCTGATTATGAAAGGATCATCAATCTTCGTCATTTTAAGAGGATACTAAGTTTGCTTGAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATATAAAAGAGTCTCCTGATTATGAAAGGATCATCAATCTTCGTCATTTTAAGAGGATACTAAGTTTGCTTGAA 888
Query 889 GGACAAAAGATAGCTTTTGGTGGGGAGACTGATGAGGCCACACGCTACATAGCCCCAACAGTACTTACCGATGT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGACAAAAGATAGCTTTTGGTGGGGAGACTGATGAGGCCACACGCTACATAGCCCCAACAGTACTTACCGATGT 962
Query 963 TGATCCTAAAACCAAGGTGATGCAAGAAGAAATTTTTGGACCAATTCTTCCAATAGTGCCTGTGAAAAATGTAG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGATCCTAAAACCAAGGTGATGCAAGAAGAAATTTTTGGACCAATTCTTCCAATAGTGCCTGTGAAAAATGTAG 1036
Query 1037 ATGAGGCCATAAATTTCATAAATGAACGTGAAAAGCCTCTGGCTCTTTATGTATTTTCGCATAACCATAAGCTC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATGAGGCCATAAATTTCATAAATGAACGTGAAAAGCCTCTGGCTCTTTATGTATTTTCGCATAACCATAAGCTC 1110
Query 1111 ATCAAACGGATGATTGATGAGACATCCAGTGGAGGTGTCACAGGCAATGACGTCATTATGCACTTCACGCTCAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATCAAACGGATGATTGATGAGACATCCAGTGGAGGTGTCACAGGCAATGACGTCATTATGCACTTCACGCTCAA 1184
Query 1185 CTCTTTCCCATTTGGAGGAGTGGGTTCCAGTGGGATGGGAGCTTATCACGGAA-AACATAGTTTTGATACTTTT 1257
|||||||||||||||||||||| ||.||..|||.||.||| || ||||
Sbjct 1185 CTCTTTCCCATTTGGAGGAGTG--------------GGCAGAATATTACTGAAGAA--------TGAT------ 1230
Query 1258 TCTCATCAGCGTCCCTGTTTATTAAAAAGTTTAAAGAGAGAAGGTGCTAACAAACTCAGATATCCTCCCAACAG 1331
|||||| ||| |||||.|
Sbjct 1231 -------------CCTGTT-------------------------------CAA----------CCTCCTA---- 1246
Query 1332 CCAGTCAAAGGTG----GATTGGGGAAAATTTTTTCTCTTGAAACGGTTCAACAAAGAAAAACTCGGTCTCCTG 1401
||| .|.|| ||||.||.|||||.
Sbjct 1247 ----------GTGCCTCTACTG-----AATTATTCCTCTTT--------------------------------- 1272
Query 1402 TTGCTCACTTTCCTGGGTATTGTAGCCGCTGTGCTTGTCAAGAAATACCAAGCTGTGCTGAGGAGAAAGGCCCT 1475
Sbjct 1273 -------------------------------------------------------------------------- 1272
Query 1476 GTTGATTTTTCTGGTAGTTCACAGACTGCGTTGGTCCAGTAAGCAGAGA 1524
Sbjct 1273 ------------------------------------------------- 1272