Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00154
- Subject:
- NM_001305935.1
- Aligned Length:
- 1186
- Identities:
- 1008
- Gaps:
- 26
Alignment
Query 1 ATGGCGGTTGTAGCGGCGGCTGC-----CGGCT-GGCTACTCAGGCTCAGGGCGGCAGGGGCTGAGGGGCACTG 68
|||||| ||||.|||||| |||.| ||||.||..|||||.||||.||.||.||.|||.||| |
Sbjct 1 ATGGCG------GCGGTGGCTGCGCGCGCGGGTGGGCTGCTGTGGCTCCGGGCTGCGGGAGCAGAGCGGC---G 65
Query 69 GCG--TCGG-CTTC-CTGGCGCGGGGCTGGCGCGGGGCTTTTTGCACCCCGCCGCGACTGTCGAGGATGCGGCC 138
||| .||| ||.| || ||||.|.|||||.||..|||||..||||.|||| ..|.||||||..|||||
Sbjct 66 GCGGTGCGGACTGCGCT-GCGCTGCGCTGGTGCAAGGCTTCCTGCAACCCG------GGGGCGAGGACACGGCC 132
Query 139 CAGAGGCGGCAGGTGGCTCATTTTACTTTCCAGCCAGATCCGGAGCCCCGGGAGTACGGGCAAACTCAGAAAAT 212
||||.|||||.||||||.||.||.||||||||.||.||.||.|||.|||.|.||||.||||||||||||||.||
Sbjct 133 CAGAAGCGGCGGGTGGCCCACTTCACTTTCCATCCGGACCCAGAGTCCCTGCAGTATGGGCAAACTCAGAAGAT 206
Query 213 GAATCTTTTCCAGTCTGTAACAAGTGCCTTGGATAACTCATTGGCCAAAGATCCTACTGCAGTAATATTTGGTG 286
|||.||.||||||||..|||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 207 GAACCTCTTCCAGTCAATAACAAGTGCCCTGGATAACTCATTAGCCAAAGACCCCACTGCAGTAATATTTGGTG 280
Query 287 AAGATGTTGCCTTTGGTGGAGTCTTTAGATGCACTGTTGGCTTGCGAGACAAATATGGAAAAGATAGAGTTTTT 360
|||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 281 AAGATGTTGCCTTTGGTGGAGTCTTCCGATGCACTGTTGGTTTACGAGACAAATACGGAAAAGATAGAGTGTTT 354
Query 361 AATACCCCATTGTGTGAACAAGGAATTGTTGGATTTGGAATCGGAATTGCGGTCACTGGAGCTACTGCCATTGC 434
||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 355 AACACCCCGTTGTGTGAACAAGGAATAGTTGGATTTGGCATTGGAATCGCGGTCACCGGTGCTACAGCTATTGC 428
Query 435 GGAAATTCAGTTTGCAGATTATATTTTCCCTGCATTTGATCAGATTGTTAATGAAGCTGCCAAGTATCGCTATC 508
||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 429 GGAAATCCAGTTTGCCGACTATATTTTCCCTGCCTTTGATCAGATTGTCAACGAAGCTGCCAAGTATCGCTACC 502
Query 509 GCTCTGGGGATCTTTTTAACTGTGGAAGCCTCACTATCCGGTCCCCTTGGGGCTGTGTTGGTCATGGGGCTCTC 582
||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||.||||.|||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 503 GCTCAGGTGATCTTTTCAACTGTGGGAGCCTCACCATCCGGGCCCCGTGGGGTTGTGTGGGCCATGGGGCTCTC 576
Query 583 TATCATTCTCAGAGTCCTGAAGCATTTTTTGCCCATTGCCCAGGAATCAAGGTGGTTATACCCAGAAGCCCTTT 656
||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||
Sbjct 577 TACCATTCTCAGAGTCCTGAAGCCTTTTTTGCCCATTGCCCAGGGATCAAGGTGGTAATACCCCGAAGCCCTTT 650
Query 657 CCAGGCCAAAGGACTTCTTTTGTCATGCATAGAGGATAAAAATCCTTGTATATTTTTTGAACCTAAAATACTTT 730
|||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 CCAGGCCAAGGGACTTCTGTTGTCATGCATAGAAGATAAAAATCCATGTATATTTTTTGAACCTAAAATACTTT 724
Query 731 ACAGGGCAGCAGCGGAAGAAGTCCCTATAGAACCATACAACATCCCACTGTCCCAGGCCGAAGTCATACAGGAA 804
||.|||||||||.||||.|.|||||..|||||||.|||||.|||||..||||.|||||.||||||||.|||||.
Sbjct 725 ACCGGGCAGCAGTGGAACAGGTCCCAGTAGAACCCTACAAGATCCCCTTGTCTCAGGCTGAAGTCATCCAGGAG 798
Query 805 GGGAGTGATGTTACTCTAGTTGCCTGGGGCACTCAGGTTCATGTGATCCGAGAGGTAGCTTCCATGGCAAAAGA 878
||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||..||||
Sbjct 799 GGCAGCGATGTGACTCTGGTTGCCTGGGGCACTCAGGTTCATGTCATCCGGGAGGTGGCTTCCATGGCCCAAGA 872
Query 879 AAAGCTTGGAGTGTCTTGTGAAGTCATTGATCTGAGGACTATAATACCTTGGGATGTGGACACAATTTGTAAGT 952
||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||.||..|.||||||||||||||.|||.||||.||||
Sbjct 873 AAAGCTTGGAGTATCTTGTGAAGTCATCGATCTGCGGACAATTGTGCCTTGGGATGTGGATACAGTTTGCAAGT 946
Query 953 CTGTGATCAAAACAGGGCGACTGCTAATCAGTCACGAGGCTCCCTTGACAGGCGGCTTTGCATCGGAAATCAGC 1026
|||||||||||||.|||||||||.|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 947 CTGTGATCAAAACCGGGCGACTGTTGATCAGCCACGAGGCTCCCTTAACAGGCGGCTTTGCCTCTGAGATCAGC 1020
Query 1027 TCTACAGTTCAGGAGGAATGTTTCTTGAACCTAGAGGCTCCTATATCAAGAGTATGTGGTTATGACACACCATT 1100
||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||.||.||.||||||||.||.||
Sbjct 1021 TCCACGGTCCAGGAAGAATGTTTCTTGAACCTAGAGGCTCCAATATCTCGAGTTTGCGGATATGACACCCCGTT 1094
Query 1101 TCCTCACATTTTTGAACCATTCTACATCCCAGACAAATGGAAGTGTTATGATGCCCTTCGAAAAATGATCAACT 1174
|||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1095 TCCTCACATCTTTGAGCCCTTTTATATCCCAGACAAATGGAAGTGCTACGATGCCCTTCGCAAGATGATCAACT 1168
Query 1175 AT 1176
||
Sbjct 1169 AT 1170