Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00195
• Subject: XM_017025961.1
• Aligned Length: 957
• Identities: 764
• Gaps: 180

Alignment

Query   1  ATGCCGGAAGCTGGTTTTCAGGCCACAAATGCTTTCACA-GAGTGCAAATTCACCTGCA--------------C  59
                                       ||||||||||| |||          ||.|.|              |
Sbjct   1  ----------------------------ATGCTTTCACAGGAG----------CCGGGAGGAAGGGAGCGAGCC  36

Query  60  CAGTGGTAAATGCTTGTATCTTGGTTCGCTGGTCTGTAACCAACAG--AACGACTGTGGGGACAAC-AGTGACG  130
           .||.||                |||  ||||        ||.||.|  |||||   |||.|    | || |.||
Sbjct  37  AAGAGG----------------GGT--GCTG--------CCCACCGGAAACGA---TGGCG----CGAG-GCCG  76

Query 131  AAGAG--AACTG------TCTCCTGGTGACCGAG---------CACCCGCCTCCGGGCATC----TTCAACTCG  183
           .||||  ||.||      |||||.||     |||         ||  ||.|||    ||||    ||    .||
Sbjct  77  CAGAGCTAAATGGGGGCCTCTCCAGG-----GAGTGCTCTGTTCA--CGGCTC----CATCGCTGTT----ACG  135

Query 184  GAGCTGGAGTTCGCCCAAATCATCATCATCGTCGTGGTGGTCACGGTGATGGTGGTGGTCATCGTCTGCCTGCT  257
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 136  GAGCTGGAGTTCGCCCAAATCATCATCATCGTCGTGGTGGTCACGGTGATGGTGGTGGTCATCGTCTGCCTGCT  209

Query 258  GAACCACTACAAAGTCTCCACGCGGTCCTTCATCAACCGCCCGAACCAGAGCCGGAGGCGGGAGGACGGGCTGC  331
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 210  GAACCACTACAAAGTCTCCACGCGGTCCTTCATCAACCGCCCGAACCAGAGCCGGAGGCGGGAGGACGGGCTGC  283

Query 332  CGC------------------------------------------------------AGATCATGCATGCCCCG  351
           |||                                                      |||||||||||||||||
Sbjct 284  CGCAGGAAGGGTGCCTGTGGCCTTCAGACAGCGCCGCACCGCGGCTGGGCGCCTCGGAGATCATGCATGCCCCG  357

Query 352  CGGTCCAGGGACAGGTTCACAGCGCCGTCCTTCATCCAGAGGGATCGCTTCAGCCGCTTCCAGCCCACCTACCC  425
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 358  CGGTCCAGGGACAGGTTCACAGCGCCGTCCTTCATCCAGAGGGATCGCTTCAGCCGCTTCCAGCCCACCTACCC  431

Query 426  CTATGTGCAGCACGAGATTGATCTTCCTCCCACCATCTCCCTGTCCGACGGTGAAGAGCCACCTCCTTACCAGG  499
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 432  CTATGTGCAGCACGAGATTGATCTTCCTCCCACCATCTCCCTGTCCGACGGTGAAGAGCCACCTCCTTACCAGG  505

Query 500  GGCCCTGCACCCTGCAGCTCCGGGACCCTGAACAGCAGATGGAACTCAACCGAGAGTCCGTGAGGGCCCCACCC  573
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 506  GGCCCTGCACCCTGCAGCTCCGGGACCCTGAACAGCAGATGGAACTCAACCGAGAGTCCGTGAGGGCCCCACCC  579

Query 574  AACCGAACCATATTTGACAGTGATTTAATAGACATTGCTATGTATAGCGGGGGTCCATGCCCACCCAGCAGCAA  647
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Sbjct 580  AACCGAACCATATTTGACAGTGATTTAATAGACATTGCTATGTATAGCGGGGGTCCATGCCCACCCAGCAGCAA  653

Query 648  CTCGGGCATCAGTGCAAGCACCTGCAGCAGTAACGGGAGGATGGAGGGGCCACCCCCCACATACAGCGAGGTGA  721
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Sbjct 654  CTCGGGCATCAGTGCAAGCACCTGCAGCAGTAACGGGAGGATGGAGGGGCCACCCCCCACATACAGCGAGGTGA  727

Query 722  TGGGCCACCACCCAGGCGCCTCTTTCCTCCATCACCAGCGCAGCAACGCACACAGGGGCAGCAGACTGCAGTTT  795
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Sbjct 728  TGGGCCACCACCCAGGCGCCTCTTTCCTCCATCACCAGCGCAGCAACGCACACAGGGGCAGCAGACTGCAGTTT  801

Query 796  CAGCAGAACAATGCAGAGAGCACAATAGTACCCATCAAAGGCAAAGATAGGAAGCCTGGGAACCTGGTC  864
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Sbjct 802  CAGCAGAACAATGCAGAGAGCACAATAGTACCCATCAAAGGCAAAGATAGGAAGCCTGGGAACCTGGTC  870