Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00310
• Subject: XM_006510757.3
• Aligned Length: 1514
• Identities: 1196
• Gaps: 136

Alignment

Query    1  ATGAGGCGCGCGCCTTCCCTGGTCCTTTTCTTCCTGGTCGCCCTTTGCGGGCGCGGGAACTGCCGCGTGGCCAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGCGGAGGAAAAGCTGATGGACGACCTTCTGAACAAAACCCGTTACAATAACCTGATCCGCCCAGCCACCAGCT  148
                            |||||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------ATGGATGATCTCCTGAACAAAACCCGCTACAACAACCTGATCCGCCCAGCCACCAGCT  58

Query  149  CCTCACAGCTCATCTCCATCAAGCTGCAGCTCTCCCTGGCCCAGCTTATCAGCGTGAATGAGCGAGAGCAGATC  222
            ||||.|||||||||||||||...|||.||||.||.|||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct   59  CCTCCCAGCTCATCTCCATCCGCCTGGAGCTATCACTGTCCCAGCTCATCAGTGTGAATGAGCGAGAACAGATC  132

Query  223  ATGACCACCAATGTCTGGCTGAAACAGGAATGGACTGATTACCGCCTGACCTGGAACAGCTCCCGCTACGAGGG  296
            ||||||||||...|||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||.||.||
Sbjct  133  ATGACCACCAGCATCTGGCTGAAACAGGAATGGACTGACTACCGCCTGGCCTGGAACAGCTCCTGCTATGAAGG  206

Query  297  TGTGAACATCCTGAGGATCCCTGCAAAGCGCATCTGGTTGCCTGACATCGTGCTTTACAACAACGCCGACGGGA  370
            .||||||||.||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||.||||
Sbjct  207  GGTGAACATTCTGAGGATTCCTGCAAAGCGAGTCTGGTTGCCTGACATCGTGTTGTACAACAATGCCGATGGGA  280

Query  371  CCTATGAGGTGTCTGTCTACACCAACTTGATAGTCCGGTCCAACGGCAGCGTCCTGTGGCTGCCCCCTGCCATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||.||||.||.||.||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||
Sbjct  281  CCTATGAGGTGTCTGTCTACACCAACGTGATCGTGCGTTCCAACGGCAGCATCCAGTGGCTGCCCCCTGCCATC  354

Query  445  TACAAGAGCGCCTGCAAGATTGAGGTGAAGTACTTTCCCTTCGACCAGCAGAACTGCACCCTCAAGTTCCGCTC  518
            ||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  355  TACAAGAGTGCCTGCAAGATAGAGGTGAAGCACTTTCCCTTCGACCAGCAGAACTGCACCCTCAAATTTCGCTC  428

Query  519  CTGGACCTATGACCACACGGAGATAGACATGGTCCTCATGACGCCCACAGCCAGCATGGATGACTTTACTCCCA  592
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|...|.||||||||||.|||||||||||||||.||||
Sbjct  429  CTGGACCTATGACCACACAGAGATTGACATGGTTCTTAAATCACCCACAGCCATCATGGATGACTTTACCCCCA  502

Query  593  GTGGTGAGTGGGACATAGTGGCCCTCCCAGGGAGAAGGACAGTGAACCCACAAGACCCCAGCTACGTGGACGTG  666
            |.|||||.||||||||.|||||||||||.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  503  GCGGTGAATGGGACATTGTGGCCCTCCCGGGTCGAAGGACAGTGAACCCACAGGACCCCAGCTATGTGGACGTG  576

Query  667  ACTTACGACTTCATCATCAAGCGCAAGCCTCTGTTCTACACCATCAACCTCATCATCCCCTGCGTGCTCACCAC  740
            ||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||.|||
Sbjct  577  ACCTATGACTTCATCATCAAGCGCAAGCCACTCTTCTACACCATCAATCTGATCATCCCTTGTGTGCTCATCAC  650

Query  741  CTTGCTGGCCATCCTCGTCTTCTACCTGCCATCCGACTGCGGCGAGAAGATGACACTGTGCATCTCAGTGCTGC  814
            .|.||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct  651  GTCGCTGGCTATCCTGGTCTTCTACCTGCCCTCCGACTGTGGGGAGAAGATGACGCTCTGCATCTCAGTGCTGC  724

Query  815  TGGCACTGACATTCTTCCTGCTGCTCATCTCCAAGATCGTGCCACCCACCTCCCTCGATGTGCCTCTCATCGGC  888
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||..|.||.|||||.|||
Sbjct  725  TGGCACTCACATTCTTCCTGCTGCTCATCTCCAAGATCGTGCCTCCCACCTCCCTTGACATTCCCCTCATTGGC  798

Query  889  AAGTACCTCATGTTCACCATGGTGCTGGTCACCTTCTCCATCGTCACCAGCGTCTGTGTGCTCAATGTGCACCA  962
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||..||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  799  AAGTACCTCTTGTTCACCATGGTGCTGGTCACCTTTTCCATCGTCACCACTGTGTGTGTCCTCAATGTGCACCA  872

Query  963  CCGCTCGCCCAGCACCCACACCATGGCACCCTGGGTCAAGCGCTGCTTCCTGCACAAGCTGCCTACCTTCCTCT  1036
            |||.||.||||||||.||||||||||||.|||||||||||...||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  873  CCGTTCACCCAGCACTCACACCATGGCATCCTGGGTCAAGGAGTGCTTCCTGCACAAGCTGCCCACCTTCCTCT  946

Query 1037  TCATGAAGCGCCCTGGCCCCGACAG-CAGCCCGGCCAGAGCCTTCCCGC---CCAGCAAGTCATG--CGTGACC  1104
            ||||||||||||||||.|..|| || ||||||.|||||.|   ||||.|   |||||.||  .||  |.|||||
Sbjct  947  TCATGAAGCGCCCTGGTCTGGA-AGTCAGCCCCGCCAGGG---TCCCTCATTCCAGCCAG--CTGCACTTGACC  1014

Query 1105  A-AGCCCGAGGCCACCGCCACCT------------CCACCAGCCCCTCCAACTTCTATGGGAACTCCATGTACT  1165
            | || |.||.||.||..||||||            |||.||||||.||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 1015  ACAG-CTGAAGCTACGTCCACCTCTGCCTTAGGCCCCAGCAGCCCATCCAACCTCTATGGGAATTCCATGTACT  1087

Query 1166  TTGTGAACCCCGCCTCTGCAGCTTCCAAGTCTCCAGCCGGCT-CTACCCCGGTGGCTATCCCCAGGGATTTCTG  1238
            ||||||||||.|.|.||||..||.|.||||||.|||.|.||| |.||.|.|..||| .|||||||||||..|.|
Sbjct 1088  TTGTGAACCCTGTCCCTGCCACTCCTAAGTCTGCAGTCAGCTCCCACACGGCAGGC-CTCCCCAGGGATGCCCG  1160

Query 1239  GCTGCGGTCCTCTGGGAGGTTCCGACAGGATGTGCAGGAGGCATTAGAAGGTGTCAGCTTCATCGCCCAGCACA  1312
            ||||.|||||||||||||||||||.||.|||.|.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||..
Sbjct 1161  GCTGAGGTCCTCTGGGAGGTTCCGGCAAGATCTACAGGAAGCATTAGAGGGCGTCAGCTTCATCGCACAGCATT  1234

Query 1313  TGAAGAATGACGATGAAGACCAGAGTGTCGTTGAGGACTGGAAGTACGTGGCTATGGTGGTGGACCGGCTGTTC  1386
            ||.|||.|||.|||..|||.|||||||||.|.|||||||||||.|.|||.||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1235  TGGAGAGTGATGATCGAGATCAGAGTGTCATCGAGGACTGGAAATTCGTCGCAATGGTCGTCGACCGCCTGTTC  1308

Query 1387  CTGTGGGTGTTCATGTTTGTGTGCGTCCTGGGCACTGTGGGGCTCTTCCTACCGCCCCTCTTCCAGACCCATGC  1460
            ||||||||||||.||.|||||||..|.||||||||..|||||||||||||.||.|||||||||||||.|||.||
Sbjct 1309  CTGTGGGTGTTCGTGATTGTGTGTATTCTGGGCACCATGGGGCTCTTCCTGCCACCCCTCTTCCAGATCCACGC  1382

Query 1461  AGCTTCTGAGGGGCCCTACGCTGCCCAGCGTGAC  1494
            |.|.||..||||.|.|                  
Sbjct 1383  ACCCTCCAAGGGCCTC------------------  1398