Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00540
• Subject: NR_152751.1
• Aligned Length: 1829
• Identities: 1234
• Gaps: 391

Alignment

Query    1  -------------------------------------------------ATGGCGGATGGTCAGGTGGCGGAAC  25
                                                             |||||||||..||..||...|||.|
Sbjct    1  CCTAGTCAGGTCCGGCGGCCTGCACACGCCAAGCACGCTGGGAGTAGCCATGGCGGATAATCCCGTTTTGGAGC  74

Query   26  TGCTGCTCCGGCGGCTGGAGGCGTCTGATGGCGGCCTGGACAGCGCCGAGTTGGCGGCTGAGCTGGGCATGGAG  99
            ||.||||.|||||||||||||...||||||||||.|||||||||||.||||||||..|..|||||||..|||||
Sbjct   75  TGTTGCTGCGGCGGCTGGAGGTAGCTGATGGCGGTCTGGACAGCGCGGAGTTGGCTACGCAGCTGGGTGTGGAG  148

Query  100  CACCAGGCGGTGGTGGGCGCCGTGAAGAGCCTTCAGGCGCTGGGCGAGGTCATCGAGGCTGAACTTCGGTCCAC  173
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||
Sbjct  149  CACCAGGCGGTGGTGGGCGCAGTGAAGAGCCTTCAAGCTCTGGGTGAGGTCATTGAGGCTGAGCTTCGTTCTAC  222

Query  174  CAAGCACTGGGAGCTTACTGCGGAGGGCGAGGAGATTGCCCGGGAGGGCAGCCATGAGGCCCGTGTGTTTCGAA  247
            ||||..|||||||||.|||.|                                 ||||||.|            
Sbjct  223  CAAGTGCTGGGAGCTGACTAC---------------------------------TGAGGCAC------------  251

Query  248  GCATTCCCCCAGAGGGCCTGGCCCAGAGCGAGCTTATGCGACTGCCCAGTGGCAAAGTGGGCTTCAGCAAGGCC  321
                                                     ||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  252  -----------------------------------------CTGCCCAGCGGCAAGGTGGGCTTCAGCAAGGCC  284

Query  322  ATGTCCAACAAGTGGATTCGGGTGGACAAGAGTGCGGCTGACGGGCCCCGGGTGTTCCGAGTGGTGGACAGCAT  395
            |||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  285  ATGTCCAACAAGTGGATCCGAGTGGACAAGAGTGCCGCCGACGGGCCCCGGGTGTTCCGAGTGGTGGACAGTAT  358

Query  396  GGAGGATGAGGTGCAGCGGCGGCTCCAGCTGGTCCGGGGGGGACAGGCTGAGAAGCTGGGGGAGAAGGAGAGGA  469
            .||||||||.||||||..||||.|.||||||||||.||..||.||||||||||||||||..||.|||||..|||
Sbjct  359  AGAGGATGAAGTGCAGAAGCGGTTGCAGCTGGTCCAGGCAGGCCAGGCTGAGAAGCTGGCTGAAAAGGAACGGA  432

Query  470  GCGAGCTGAGGAAGAGGAAGCTGTTGGCTGAAGTGACTCTGAAGACCTACTGGGTGAGCAAAGGCAGTGCCTTT  543
            ..|||||.|||||||||||||||.||.|.|||||||..|||||.|||||||||||||||||.||||..|||||.
Sbjct  433  ATGAGCTCAGGAAGAGGAAGCTGCTGACGGAAGTGATCCTGAAAACCTACTGGGTGAGCAAGGGCAAGGCCTTC  506

Query  544  AGTACCAGCATCTCCAAGCAAGAGACAGAGCTGAGCCCAGAGATGATCTCCAGTGGCTCTTGGCGGGACCGGCC  617
            ||.||.|||.|.||.|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||
Sbjct  507  AGCACAAGCGTGTCTAAGCAGGAGGCAGAGCTGAGCCCAGAGATGATCTCCAGTGGCTCTTGGAGGGACCGACC  580

Query  618  CTTCAAGCCCTACAACTTCTTGGCCCACGGTGTCCTCCCCGACAGCGGCCACCTTCACCCGCTGCTCAAGGTCC  691
            .|||||.|||||||||||||..||||..|||||.|||||.||.||.||||||||.|||||..||||||||||||
Sbjct  581  TTTCAAACCCTACAACTTCTCTGCCCGTGGTGTGCTCCCAGATAGTGGCCACCTGCACCCCTTGCTCAAGGTCC  654

Query  692  GCTCCCAGTTCCGACAGATCTTCCTGGAGATGGGGTTCACCGAGATGCCGACTGATAACTTCATTGAGAGCTCC  765
            ||||.|||||||||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct  655  GCTCTCAGTTCCGACAAATCTTCTTGGAGATGGGGTTCACTGAGATGCCTACGGACAATTTCATTGAGAGCTCC  728

Query  766  TTCTGGAACTTTGACGCCCTCTTCCAGCCCCAGCAGCACCCAGCCCGTGACCAGCACGACACCTTCTTCCTTCG  839
            ||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||.||
Sbjct  729  TTCTGGAACTTTGATGCACTCTTTCAGCCTCAGCAGCACCCAGCACGTGACCAACATGATACTTTCTTCCTGCG  802

Query  840  AGATCCAGCGGAGGCCCTGCAGCTCCCAATGGACTATGTCCAGCGGGTCAAGCGGACCCACTCTCAGGGCGGCT  913
            |||.|||||.||||||||||||||.|||||||.||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  803  AGACCCAGCTGAGGCCCTGCAGCTTCCAATGGGCTATGTCCAGCGCGTGAAACGGACCCACTCCCAGGGTGGCT  876

Query  914  ACGGCTCACAGGGGTACAAGTATAACTGGAAGCTGGACGAGGCCCGGAAAAACCTACTGCGAACCCACACCACA  987
            |||||||||||||.||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||
Sbjct  877  ACGGCTCACAGGGCTACAAGTATACCTGGAAGCTGGAAGAGGCCCGGAAAAACCTGCTTCGCACACACACCACA  950

Query  988  TCAGCCAGCGCCCGTGCGCTCTACCGCCTTGCCCAGAAGAAGCCCTTCACTCCGGTCAAGTACTTCTCCATCGA  1061
            .|||||||||||||.||.|||||||...|.||||||||||||||.||.||.||.|.||||||||||||.||.||
Sbjct  951  GCAGCCAGCGCCCGCGCCCTCTACCAGTTAGCCCAGAAGAAGCCGTTTACACCAGCCAAGTACTTCTCTATTGA  1024

Query 1062  CCGCGTATTCCGGAATGAGACCCTGGACGCCACGCACCTGGCTGAGTTCCACCAGATCGAGGGCGTGGTGGCGG  1135
            .||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||..|.||.|
Sbjct 1025  TCGTGTGTTTCGGAATGAGACGCTGGACGCCACGCACCTGGCGGAGTTCCACCAGATTGAGGGTGTAATAGCAG  1098

Query 1136  ATCATGGTCTCACCTTGGGCCACCTCATGGGCGTTCTGCGGGAGTTCTTCACCAAGCTGGGTATCACGCAACTC  1209
            |.||||||||||||.|.||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||..|.
Sbjct 1099  ACCATGGTCTCACCCTAGGCCACCTCATGGGTGTGCTGAGGGAGTTCTTCACCAAGCTGGGAATCACGCAGTTG  1172

Query 1210  CGCTTCAAGCCAGCCTACAACCCATACACAGAGCCCAGCATGGAGGTGTTCAGCTACCACCAAGGCCTGAAGAA  1283
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1173  CGCTTCAAACCAGCCTACAACCCCTACACAGAGCCCAGCATGGAAGTGTTCAGCTACCACCAAGGTCTAAAGAA  1246

Query 1284  GTGGGTGGAGGTCGGAAACTCGGGGGTCTTCCGTCCAGAGATGCTGCTGCCCATGGGGCTTCCCGAGAACGTGT  1357
            ||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1247  GTGGGTTGAAGTTGGCAACTCTGGGGTCTTCCGCCCTGAGATGCTCCTGCCTATGGGGCTCCCTGAGAATGTGT  1320

Query 1358  CGGTCATTGCCTGGGGCCTCTCCCTGGAGCGCCCAACGATGATCAAATATGGCATCAACAATATCCGGGAGCTG  1431
            |.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 1321  CTGTCATTGCTTGGGGTCTCTCCCTGGAACGCCCAACAATGATCAAATATGGCATCAATAACATCCGAGAACTG  1394

Query 1432  GTGGGCCACAAGGTGAACCTGCAGATGGTGTATGACAGTCCCCTGTGCCGCCTGGATGCCGAGCCGAGGCCCCC  1505
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||..|||||||.||||||...|||||.|||.||.|
Sbjct 1395  GTGGGCCACAAGGTGAACCTGCAGATGGTATACGACAGCCCTGTGTGCCGACTGGATATTGAGCCCAGGTCCTC  1468

Query 1506  TCCCACACAGGAGGCTGCG-------------------------------------------------------  1524
            ....||||||||||||||.                                                       
Sbjct 1469  AAAGACACAGGAGGCTGCATGATATAGGCTGTTCCAGAGATCCCTGTCTAGTCCCTGTGCATCTCTTGGCAGTG  1542

Query 1525  --------------------------------------------------------------------------  1524
                                                                                      
Sbjct 1543  ACCTACTATTTATGAGGCCTCTGTGAGGCCAGCTCACTCCCCCTGCCTCTCCCACCCTGGGGGCAGGGTTCTAA  1616

Query 1525  --------------------------------------------------------------------------  1524
                                                                                      
Sbjct 1617  GTATGGGGAGTTCTTATGCTGGCTTTTAGTGGTGTGTGTAGTTTGCTTGTAAGGGTGGGTTTGGCCCTGCAGGC  1690

Query 1525  -----------------------------------------------------  1524
                                                                 
Sbjct 1691  CAGCTGTTTTAATAAAGTGGGCACATTCCCTCATTTGGTGCCTTTTGTTAGGA  1743