Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00998
• Subject: NM_001136072.2
• Aligned Length: 1418
• Identities: 1106
• Gaps: 244

Alignment

Query    1  ATGGCGCAAAGGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGCAAAGGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG  74

Query   75  AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct   75  AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACGCAGC  148

Query  149  ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAG  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCTTGAAA  222

Query  223  CGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC  296
            .|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGAGACAAGGACGCAATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC  296

Query  297  GACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCG  370
            |||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACCTGCACTCCCCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCG  370

Query  371  CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATA  444

Query  445  CAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCA  518
            ||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  445  CAAGCAATTCAAGTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCA  518

Query  519  CCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGT  592
            |||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  519  CCGGTACATTAGCTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGT  592

Query  593  CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  593  CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGAT  666

Query  667  GATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAA  740
            ||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  667  GACGCAACCTCAACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAA  740

Query  741  CAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATA  814
            |||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct  741  CAGCAGTGAGCAAGGCGATGGGTTAGACAACAGCGTAGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACA  814

Query  815  AGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTC  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  AGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATATTCCCCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTC  888

Query  889  CAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCT  962
            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  889  CAGCATCTCACACACCCGTACCCTTCAGAAGAACAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCT  962

Query  963  CCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAG  1036
            .|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCAAGTGAACAACTGGTTTATCAATGCCAGAAGAAGAATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAG  1036

Query 1037  TGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATG  1110
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGAGCCAAGGAGCAGCGTATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTGTTGGATGGTCAGCAACACATG  1110

Query 1111  GGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGA-GCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGGGTGGTCCTATGGGAATGAGTA  1183
            ||||||||||||||||       || .||||  ||.|||                      |||||.||||.||
Sbjct 1111  GGGATCCGGCCTGCAG-------GACCCATG--AGTGGA----------------------ATGGGCATGAATA  1153

Query 1184  TGGCACA-------GCCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTACTCAATTAAGACATGGACCCCC  1250
            ||| .||       ||  |||..||||       |.|||                                   
Sbjct 1154  TGG-GCATGGATGGGC--AGTGGCACT-------ATATG-----------------------------------  1182

Query 1251  AATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGATGATGCACGGAGGACCCCCTACCCACCCTG  1324
                                                                                      
Sbjct 1183  --------------------------------------------------------------------------  1182

Query 1325  GAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAATGTTGGCGGACAGGTTATGGAC  1398
                                                                                      
Sbjct 1183  --------------------------------------------------------------------------  1182

Query 1399  ATTCATGCCCAA  1410
                        
Sbjct 1183  ------------  1182