Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01279
• Subject: NM_016781.2
• Aligned Length: 993
• Identities: 869
• Gaps: 3

Alignment

Query   1  ATGGAGACGGTCATTTCTTCAGATAGCTCCCCAGCTGTGGAAAATGAGCATCCTCAAGAGACCCCAGAATCCAA  74
           ||||||.|||   ||.||.||||.|||||.||||||.|.||.|||||.||...||||||||||||.|||||.||
Sbjct   1  ATGGAGTCGG---TTGCTGCAGAGAGCTCGCCAGCTCTAGAGAATGAACACTTTCAAGAGACCCCGGAATCAAA  71

Query  75  CAATAGCGTGTATACTTCCTTCATGAAGTCTCATCGCTGCTATGACCTGATTCCCACAAGCTCCAAATTGGTTG  148
           ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct  72  CAATAGTGTGTATACTTCCTTCATGAAGTCTCATCGCTGCTATGACCTAATTCCCACAAGTTCCAAGTTGGTGG  145

Query 149  TATTTGATACGTCCCTGCAGGTGAAGAAAGCTTTTTTTGCTTTGGTGACTAACGGTGTACGAGCTGCCCCTTTA  222
           |||||||.||.||.||.|||||.||||||||.||||||||..|||||||.||.|||||.||.||.||||||||.
Sbjct 146  TATTTGACACTTCGCTACAGGTAAAGAAAGCCTTTTTTGCCCTGGTGACCAATGGTGTTCGTGCCGCCCCTTTG  219

Query 223  TGGGATAGTAAGAAGCAAAGTTTTGTGGGCATGCTGACCATCACTGATTTCATCAATATCCTGCACCGCTACTA  296
           |||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||..|||||||.|||||
Sbjct 220  TGGGACAGTAAGAAGCAGAGTTTTGTGGGCATGCTGACCATCACCGACTTCATCAACATTTTGCACCGATACTA  293

Query 297  TAAATCAGCCTTGGTACAGATCTATGAGCTAGAAGAACACAAGATAGAAACTTGGAGAGAGGTGTATCTCCAGG  370
           |||.||||||.||||.||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 294  TAAGTCAGCCCTGGTGCAGATCTACGAACTGGAGGAGCACAAGATAGAGACGTGGAGAGAGGTGTACCTGCAGG  367

Query 371  ACTCCTTTAAACCGCTTGTCTGCATTTCTCCTAATGCCAGCTTGTTTGATGCTGTCTCTTCATTAATTCGGAAC  444
           ||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 368  ACTCCTTTAAGCCACTTGTCTGCATCTCTCCAAATGCCAGCTTGTTTGATGCTGTCTCTTCATTAATTCGAAAT  441

Query 445  AAGATCCACAGGCTGCCAGTTATTGACCCAGAATCAGGCAATACTTTGTACATCCTCACCCACAAGCGCATTCT  518
           ||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.||
Sbjct 442  AAGATCCACAGGCTCCCAGTTATCGACCCAGAGTCAGGCAACACCTTGTACATCCTTACTCACAAGCGGATCCT  515

Query 519  GAAGTTCCTCAAATTGTTTATCACTGAGTTCCCCAAGCCAGAGTTCATGTCCAAGTCTCTGGAAGAGCTACAGA  592
           .|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||..|||||||.||||
Sbjct 516  CAAGTTCCTCAAGTTGTTTATCACCGAGTTCCCCAAGCCGGAATTCATGTCTAAGTCTCTCCAAGAGCTGCAGA  589

Query 593  TTGGCACCTATGCCAATATTGCTATGGTTCGCACTACCACCCCCGTCTATGTGGCTCTGGGGATTTTTGTACAG  666
           ||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 590  TTGGCACCTATGCCAATATTGCCATGGTCCGTACTACCACGCCTGTCTACGTGGCTCTGGGCATCTTTGTACAG  663

Query 667  CATCGAGTCTCAGCCCTGCCAGTGGTGGATGAGAAGGGGCGTGTGGTGGACATCTACTCCAAGTTTGATGTTAT  740
           ||.||||||||.|||.|.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 664  CACCGAGTCTCCGCCTTACCTGTAGTGGATGAGAAAGGGCGTGTGGTGGACATCTACTCCAAGTTTGATGTGAT  737

Query 741  CAATCTGGCAGCAGAAAAGACCTACAACAACCTAGATGTATCTGTGACTAAAGCCTTGCAACATCGATCACATT  814
           ||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||.|||||.||.||.|
Sbjct 738  CAATTTGGCAGCCGAAAAGACCTACAACAACCTAGATGTGTCTGTGACAAAAGCCCTGCAGCATCGGTCCCACT  811

Query 815  ACTTTGAGGGTGTTCTCAAGTGCTACCTGCATGAGACTCTGGAGACCATCATCAACAGGCTAGTGGAAGCAGAG  888
           |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 812  ACTTTGAGGGTGTTCTCAAATGCTACCTGCATGAGACTCTGGAAACCATCATCAATAGGCTGGTGGAGGCAGAG  885

Query 889  GTTCACCGACTTGTAGTGGTGGATGAAAATGATGTGGTCAAGGGAATTGTATCACTGTCTGACATCCTGCAGGC  962
           ||||||||.||.||.||||||||||||.|.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||.|.|||||
Sbjct 886  GTTCACCGTCTGGTGGTGGTGGATGAACACGACGTGGTCAAGGGCATCGTTTCGCTGTCTGACATCTTACAGGC  959

Query 963  CCTGGTGCTCACAGGTGGAGAGAAGAAGCCC  993
           .|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 960  TCTGGTGCTCACGGGTGGAGAGAAGAAGCCC  990