Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01279
• Subject: XM_011538562.2
• Aligned Length: 993
• Identities: 897
• Gaps: 96

Alignment

Query   1  ATGGAGACGGTCATTTCTTCAGATAGCTCCCCAGCTGTGGAAAATGAGCATCCTCAAGAGACCCCAGAATCCAA  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  CAATAGCGTGTATACTTCCTTCATGAAGTCTCATCGCTGCTATGACCTGATTCCCACAAGCTCCAAATTGGTTG  148
                                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ----------------------ATGAAGTCTCATCGCTGCTATGACCTGATTCCCACAAGCTCCAAATTGGTTG  52

Query 149  TATTTGATACGTCCCTGCAGGTGAAGAAAGCTTTTTTTGCTTTGGTGACTAACGGTGTACGAGCTGCCCCTTTA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  53  TATTTGATACGTCCCTGCAGGTGAAGAAAGCTTTTTTTGCTTTGGTGACTAACGGTGTACGAGCTGCCCCTTTA  126

Query 223  TGGGATAGTAAGAAGCAAAGTTTTGTGGGCATGCTGACCATCACTGATTTCATCAATATCCTGCACCGCTACTA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127  TGGGATAGTAAGAAGCAAAGTTTTGTGGGCATGCTGACCATCACTGATTTCATCAATATCCTGCACCGCTACTA  200

Query 297  TAAATCAGCCTTGGTACAGATCTATGAGCTAGAAGAACACAAGATAGAAACTTGGAGAGAGGTGTATCTCCAGG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201  TAAATCAGCCTTGGTACAGATCTATGAGCTAGAAGAACACAAGATAGAAACTTGGAGAGAGGTGTATCTCCAGG  274

Query 371  ACTCCTTTAAACCGCTTGTCTGCATTTCTCCTAATGCCAGCTTGTTTGATGCTGTCTCTTCATTAATTCGGAAC  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 275  ACTCCTTTAAACCGCTTGTCTGCATTTCTCCTAATGCCAGCTTGTTTGATGCTGTCTCTTCATTAATTCGGAAC  348

Query 445  AAGATCCACAGGCTGCCAGTTATTGACCCAGAATCAGGCAATACTTTGTACATCCTCACCCACAAGCGCATTCT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349  AAGATCCACAGGCTGCCAGTTATTGACCCAGAATCAGGCAATACTTTGTACATCCTCACCCACAAGCGCATTCT  422

Query 519  GAAGTTCCTCAAATTGTTTATCACTGAGTTCCCCAAGCCAGAGTTCATGTCCAAGTCTCTGGAAGAGCTACAGA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423  GAAGTTCCTCAAATTGTTTATCACTGAGTTCCCCAAGCCAGAGTTCATGTCCAAGTCTCTGGAAGAGCTACAGA  496

Query 593  TTGGCACCTATGCCAATATTGCTATGGTTCGCACTACCACCCCCGTCTATGTGGCTCTGGGGATTTTTGTACAG  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497  TTGGCACCTATGCCAATATTGCTATGGTTCGCACTACCACCCCCGTCTATGTGGCTCTGGGGATTTTTGTACAG  570

Query 667  CATCGAGTCTCAGCCCTGCCAGTGGTGGATGAGAAGGGGCGTGTGGTGGACATCTACTCCAAGTTTGATGTTAT  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571  CATCGAGTCTCAGCCCTGCCAGTGGTGGATGAGAAGGGGCGTGTGGTGGACATCTACTCCAAGTTTGATGTTAT  644

Query 741  CAATCTGGCAGCAGAAAAGACCTACAACAACCTAGATGTATCTGTGACTAAAGCCTTGCAACATCGATCACATT  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645  CAATCTGGCAGCAGAAAAGACCTACAACAACCTAGATGTATCTGTGACTAAAGCCTTGCAACATCGATCACATT  718

Query 815  ACTTTGAGGGTGTTCTCAAGTGCTACCTGCATGAGACTCTGGAGACCATCATCAACAGGCTAGTGGAAGCAGAG  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719  ACTTTGAGGGTGTTCTCAAGTGCTACCTGCATGAGACTCTGGAGACCATCATCAACAGGCTAGTGGAAGCAGAG  792

Query 889  GTTCACCGACTTGTAGTGGTGGATGAAAATGATGTGGTCAAGGGAATTGTATCACTGTCTGACATCCTGCAGGC  962
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793  GTTCACCGACTTGTAGTGGTGGATGAAAATGATGTGGTCAAGGGAATTGTATCACTGTCTGACATCCTGCAGGC  866

Query 963  CCTGGTGCTCACAGGTGGAGAGAAGAAGCCC  993
           |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 867  CCTGGTGCTCACAGGTGGAGAGAAGAAGCCC  897