Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_01317
- Subject:
- NM_001199163.1
- Aligned Length:
- 1218
- Identities:
- 1194
- Gaps:
- 24
Alignment
Query 1 ATGGCGCTTGACGGACCAGAGCAGATGGAGCTGGAGGAGGGGAAGGCAGGCAGCGGACTCCGCCAATATTATCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ------------------------ATGGAGCTGGAGGAGGGGAAGGCAGGCAGCGGACTCCGCCAATATTATCT 50
Query 75 GTCCAAGATTGAAGAACTCCAGCTGATTGTGAATGATAAGAGCCAAAACCTCCGGAGGCTGCAGGCACAGAGGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 51 GTCCAAGATTGAAGAACTCCAGCTGATTGTGAATGATAAGAGCCAAAACCTCCGGAGGCTGCAGGCACAGAGGA 124
Query 149 ACGAACTAAATGCTAAAGTTCGCCTATTGCGGGAGGAGCTACAGCTGCTGCAGGAGCAGGGCTCCTATGTGGGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 125 ACGAACTAAATGCTAAAGTTCGCCTATTGCGGGAGGAGCTACAGCTGCTGCAGGAGCAGGGCTCCTATGTGGGG 198
Query 223 GAAGTAGTCCGGGCCATGGATAAGAAGAAAGTGTTGGTCAAGGTACATCCTGAAGGTAAATTTGTTGTAGACGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 199 GAAGTAGTCCGGGCCATGGATAAGAAGAAAGTGTTGGTCAAGGTACATCCTGAAGGTAAATTTGTTGTAGACGT 272
Query 297 GGACAAAAACATTGACATCAATGATGTGACACCCAATTGCCGGGTGGCTCTAAGGAATGACAGCTACACTCTGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 273 GGACAAAAACATTGACATCAATGATGTGACACCCAATTGCCGGGTGGCTCTAAGGAATGACAGCTACACTCTGC 346
Query 371 ACAAGATCCTGCCCAACAAGGTAGACCCATTAGTGTCACTGATGATGGTGGAGAAAGTACCAGATTCAACTTAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 347 ACAAGATCCTGCCCAACAAGGTAGACCCATTAGTGTCACTGATGATGGTGGAGAAAGTACCAGATTCAACTTAT 420
Query 445 GAGATGATTGGTGGACTGGACAAACAGATCAAGGAGATCAAAGAAGTGATCGAGCTGCCTGTTAAGCATCCTGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 421 GAGATGATTGGTGGACTGGACAAACAGATCAAGGAGATCAAAGAAGTGATCGAGCTGCCTGTTAAGCATCCTGA 494
Query 519 GCTCTTCGAAGCACTGGGCATTGCTCAGCCCAAGGGAGTGCTGCTGTATGGACCTCCAGGCACTGGGAAGACAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 495 GCTCTTCGAAGCACTGGGCATTGCTCAGCCCAAGGGAGTGCTGCTGTATGGACCTCCAGGCACTGGGAAGACAC 568
Query 593 TGTTGGCCCGGGCTGTGGCTCATCATACGGACTGTACCTTTATTCGTGTCTCTGGCTCTGAACTGGTACAGAAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 569 TGTTGGCCCGGGCTGTGGCTCATCATACGGACTGTACCTTTATTCGTGTCTCTGGCTCTGAACTGGTACAGAAA 642
Query 667 TTCATAGGGGAAGGGGCAAGAATGGTGAGGGAGCTGTTTGTCATGGCACGGGAACATGCTCCATCTATCATCTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 643 TTCATAGGGGAAGGGGCAAGAATGGTGAGGGAGCTGTTTGTCATGGCACGGGAACATGCTCCATCTATCATCTT 716
Query 741 CATGGACGAAATCGACTCCATCGGCTCCTCGCGGCTGGAGGGGGGTTCTGGAGGGGACAGTGAAGTGCAGCGCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 717 CATGGACGAAATCGACTCCATCGGCTCCTCGCGGCTGGAGGGGGGTTCTGGAGGGGACAGTGAAGTGCAGCGCA 790
Query 815 CGATGCTGGAGTTGCTCAACCAGCTCGACGGCTTTGAGGCCACCAAGAACATCAAGGTTATCATGGCTACTAAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 791 CGATGCTGGAGTTGCTCAACCAGCTCGACGGCTTTGAGGCCACCAAGAACATCAAGGTTATCATGGCTACTAAT 864
Query 889 AGGATTGATATCCTGGACTCGGCACTGCTTCGCCCAGGGCGCATTGACAGAAAAATTGAATTCCCACCCCCCAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 865 AGGATTGATATCCTGGACTCGGCACTGCTTCGCCCAGGGCGCATTGACAGAAAAATTGAATTCCCACCCCCCAA 938
Query 963 TGAGGAGGCCCGGCTGGACATTTTGAAGATTCATTCTCGGAAGATGAACCTGACCCGGGGGATCAACCTGAGAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 939 TGAGGAGGCCCGGCTGGACATTTTGAAGATTCATTCTCGGAAGATGAACCTGACCCGGGGGATCAACCTGAGAA 1012
Query 1037 AAATTGCTGAGCTCATGCCAGGAGCATCAGGGGCTGAAGTGAAGGGCGTGTGCACAGAAGCTGGCATGTATGCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013 AAATTGCTGAGCTCATGCCAGGAGCATCAGGGGCTGAAGTGAAGGGCGTGTGCACAGAAGCTGGCATGTATGCC 1086
Query 1111 CTGCGAGAACGGCGAGTCCATGTCACTCAGGAGGACTTTGAGATGGCAGTAGCCAAGGTCATGCAGAAGGACAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1087 CTGCGAGAACGGCGAGTCCATGTCACTCAGGAGGACTTTGAGATGGCAGTAGCCAAGGTCATGCAGAAGGACAG 1160
Query 1185 TGAGAAAAACATGTCCATCAAGAAATTATGGAAG 1218
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1161 TGAGAAAAACATGTCCATCAAGAAATTATGGAAG 1194