Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01521
• Subject: NM_001078166.2
• Aligned Length: 761
• Identities: 579
• Gaps: 175

Alignment

Query   1  ATGTCGGGAGGTGGTGTGATTCGTGGCCCCGCAGGGAACAACGATTGCCGCATCTACGTGGGTAACTTACCTCC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGTCGGGAGGTGGTGTGATTCGTGGCCCCGCAGGGAACAACGATTGCCGCATCTACGTGGGTAACTTACCTCC  74

Query  75  AGACATCCGAACCAAGGACATTGAGGACGTGTTCTACAAATACGGCGCTATCCGCGACATCGACCTCAAGAATC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  AGACATCCGAACCAAGGACATTGAGGACGTGTTCTACAAATACGGCGCTATCCGCGACATCGACCTCAAGAATC  148

Query 149  GCCGCGGGGGACCGCCCTTCGCCTTCGTTGAGTTCGAGGACCCGCGAGACGCGGAAGACGCGGTGTATGGTCGC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GCCGCGGGGGACCGCCCTTCGCCTTCGTTGAGTTCGAGGACCCGCGAGACGCGGAAGACGCGGTGTATGGTCGC  222

Query 223  GACGGCTATGATTACGATGGGTACCGTCTGCGGGTGGAGTTTCCTCGAAGCGGCCGTGGAACAGGCCGAGGCGG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GACGGCTATGATTACGATGGGTACCGTCTGCGGGTGGAGTTTCCTCGAAGCGGCCGTGGAACAGGCCGAGGCGG  296

Query 297  CGGCGGGGGTGGAGGTGGCGGAGCTCCCCGAGGTCGCTATGGCCCCCCATCCAGGCGGTCTGAAAACAGAGTGG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CGGCGGGGGTGGAGGTGGCGGAGCTCCCCGAGGTCGCTATGGCCCCCCATCCAGGCGGTCTGAAAACAGAGTGG  370

Query 371  TTGTCTCTGGACTGCCTCCAAGTGGAAGTTGGCAGGATTTAAAGGATCACATGCGTGAAGCAGGTGATGTATGT  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TTGTCTCTGGACTGCCTCCAAGTGGAAGTTGGCAGGATTTAAAGGATCACATGCGTGAAGCAGGTGATGTATGT  444

Query 445  TATGCTGATGTTTACCGAGATGGCACTGGTGTCGTGGAGTTTGTACGGAAAGAAGATATGACCTATGCAGTTCG  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  TATGCTGATGTTTACCGAGATGGCACTGGTGTCGTGGAGTTTGTACGGAAAGAAGATATGACCTATGCAGTTCG  518

Query 519  AAAACTGGATAACACTAAGTTTAGATCTCATGAGGGAGAAACTGCCTACATCCGGGTTAAA-------------  579
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|                 |||||.|             
Sbjct 519  AAAACTGGATAACACTAAGTTTAGATCTCATGAGGTA-----------------GGTTATACACGTATTCTTTT  575

Query 580  -GTTGATGGGCCCAGAAGTCCA---AGTTATGGAAGATCTCGATCTCGAAGCCGTAGTCGTAGCAGAAGCCGTA  649
            .||||     ||||||.|..|   |||       |.|||                                  
Sbjct 576  CTTTGA-----CCAGAATTGGATACAGT-------GGTCT----------------------------------  603

Query 650  GCAGAAGCAACAGCAGGAGTCGCAGTTACTCCCCAAGGAGAAGCAGAGGATCACCACGCTATTCTCCCCGTCAT  723
                                                                                     
Sbjct 604  --------------------------------------------------------------------------  603

Query 724  AGCAGATCTCGCTCTCGTACA  744
                                
Sbjct 604  ---------------------  603