Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_01731
• Subject: NM_001163769.1
• Aligned Length: 726
• Identities: 628
• Gaps: 15

Alignment

Query   1  ATGGCGGAGTATCTGGCCTCCATCTTCGGCACCGAGAAAGACAAAGTCAACTGTTCATTTTATTTCAAAATTGG  74
           ||||||||.||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct   1  ATGGCGGAATACTTGGCCTCCATCTTCGGCACCGAAAAAGACAAAGTCAACTGTTCATTTTATTTCAAAATCGG  74

Query  75  AGCATGTCGTCATGGAGACAGGTGCTCTCGGTTGCACAATAAACCGACGTTTAGCCAGACCATTGCCCTCTTG-  147
           |||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||      ||||| 
Sbjct  75  AGCATGTCGTCATGGAGACAGATGTTCTCGGTTGCACAATAAACCAACCTTTAGCCAGACCA------TCTTGA  142

Query 148  -----AACATTTACCGTAACCCTCAAAACTCTTCCCAGTCTGCTGACGGTTTGCGCTGTGCCGTGAGCGATGTG  216
                |||||.||.|||||.||.||||||..|.|.|||.|.||||||||.|..|.||||||.||||||||.|||
Sbjct 143  TTCAAAACATCTATCGTAATCCCCAAAACAGTGCACAGACGGCTGACGGCTCACACTGTGCTGTGAGCGACGTG  216

Query 217  GAGATGCAGGAACACTATGATGAGTTTTTTGAGGAGGTTTTTACAGAAATGGAGGAGAAGTATGGGGAAGTAGA  290
           |||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 217  GAGATGCAGGAGCACTATGATGAGTTCTTTGAGGAAGTCTTCACTGAGATGGAAGAGAAGTACGGGGAAGTCGA  290

Query 291  GGAGATGAACGTCTGTGACAACCTGGGAGACCACCTGGTGGGGAACGTGTACGTCAAGTTTCGCCGTGAGGAAG  364
           |||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 291  GGAGATGAACGTCTGCGACAACCTAGGGGACCACCTGGTGGGGAACGTGTATGTCAAGTTTCGACGTGAGGAGG  364

Query 365  ATGCGGAAAAGGCTGTGATTGACTTGAATAACCGTTGGTTTAATGGACAGCCGATCCACGCCGAGCTGTCACCC  438
           ||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.
Sbjct 365  ATGCAGAGAAAGCCGTGATCGACTTGAATAACCGTTGGTTTAATGGACAGCCGATCCATGCAGAGCTGTCCCCA  438

Query 439  GTGACGGACTTCAGAGAAGCCTGCTGCCGTCAGTATGAGATGGGAGAATGCACACGAGGCGGCTTCTGCAACTT  512
           ||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct 439  GTAACTGACTTCAGGGAAGCCTGCTGCCGCCAGTATGAAATGGGAGAGTGCACAAGAGGGGGCTTCTGCAACTT  512

Query 513  CATGCATTTGAAGCCCATTTCCAGAGAGCTGCGGCGGGAGCTGTATGGCCGCCGTCGCAAGAAGCATAGATCAA  586
           ||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 513  CATGCATTTGAAGCCCATCTCAAGAGAGCTACGACGGGAGCTGTATGGGCGCCGGCGCAAGAAGCATAGATCCA  586

Query 587  GATCCCGATCCCGGGAGCGTCGTTCTCGGTCTAGAGACCGTGGTCGTGGCGGTGGCGGTGGCGGTGGTGGAGGT  660
           |.|||||||||.||||.||.|||||.||.||.|||||||||||.|   |||||||.||.||.||.|||||||||
Sbjct 587  GGTCCCGATCCAGGGAACGGCGTTCCCGATCCAGAGACCGTGGAC---GCGGTGGTGGAGGTGGAGGTGGAGGT  657

Query 661  GGCGGCGGACGGGAGCGTGACAGGAGGCGGTCGAGAGATCGTGAAAGATCTGGGCGATTC  720
           |||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct 658  GGCGGAGGACGGGAGCGTGACAGGAGGCGGTCAAGAGACCGGGAGAGATCTGGACGATTC  717