Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02030
• Subject: NM_001202518.2
• Aligned Length: 1449
• Identities: 1070
• Gaps: 360

Alignment

Query    1  ATGTCTGCTGAAGTCATCCATCAGGTTGAAGAAGCACTTGATACAGATGAGAAGGAGATGCTGCTCTTTTTGTG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCGGGATGTTGCTATAGATGTGGTTCCACCTAATGTCAGGGACCTTCTGGATATTTTACGGGAAAGAGGTAAGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGTCTGTCGGGGACTTGGCTGAACTGCTCTACAGAGTGAGGCGATTTGACCTGCTCAAACGTATCTTGAAGATG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GACAGAAAAGCTGTGGAGACCCACCTGCTCAGGAACCCTCACCTTGTTTCGGACTATAGAGTGCTGATGGCAGA  296
                                                                              ||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------------------------ATGGCAGA  8

Query  297  GATTGGTGAGGATTTGGATAAATCTGATGTGTCCTCATTAATTTTCCTCATGAAGGATTACATGGGCCGAGGCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    9  GATTGGTGAGGATTTGGATAAATCTGATGTGTCCTCATTAATTTTCCTCATGAAGGATTACATGGGCCGAGGCA  82

Query  371  AGATAAGCAAGGAGAAGAGTTTCTTGGACCTTGTGGTTGAGTTGGAGAAACTAAATCTGGTTGCCCCAGATCAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   83  AGATAAGCAAGGAGAAGAGTTTCTTGGACCTTGTGGTTGAGTTGGAGAAACTAAATCTGGTTGCCCCAGATCAA  156

Query  445  CTGGATTTATTAGAAAAATGCCTAAAGAACATCCACAGAATAGACCTGAAGACAAAAATCCAGAAGTACAAGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  157  CTGGATTTATTAGAAAAATGCCTAAAGAACATCCACAGAATAGACCTGAAGACAAAAATCCAGAAGTACAAGCA  230

Query  519  GTCTGTTCAAGGAGCAGGGACAAGTTACAGGAATGTTCTCCAAGCAGCAATCCAAAAGAGTCTCAAGGATCCTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  231  GTCTGTTCAAGGAGCAGGGACAAGTTACAGGAATGTTCTCCAAGCAGCAATCCAAAAGAGTCTCAAGGATCCTT  304

Query  593  CAAATAACTTCAGGCTCCATAATGGGAGAAGTAAAGAACAAAGACTTAAGGAACAGCTTGGCGCTCAACAAGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  305  CAAATAACTTCAGGCTCCATAATGGGAGAAGTAAAGAACAAAGACTTAAGGAACAGCTTGGCGCTCAACAAGAA  378

Query  667  CCAGTGAAGAAATCCATTCAGGAATCAGAAGCTTTTTTGCCTCAGAGCATACCTGAAGAGAGATACAAGATGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  379  CCAGTGAAGAAATCCATTCAGGAATCAGAAGCTTTTTTGCCTCAGAGCATACCTGAAGAGAGATACAAGATGAA  452

Query  741  GAGCAAGCCCCTAGGAATCTGCCTGATAATCGATTGCATTGGCAATGAGACAGAGCTTCTTCGAGACACCTTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  453  GAGCAAGCCCCTAGGAATCTGCCTGATAATCGATTGCATTGGCAATGAGACAGAGCTTCTTCGAGACACCTTCA  526

Query  815  CTTCCCTGGGCTATGAAGTCCAGAAATTCTTGCATCTCAGTATGCATGGTATATCCCAGATTCTTGGCCAATTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  527  CTTCCCTGGGCTATGAAGTCCAGAAATTCTTGCATCTCAGTATGCATGGTATATCCCAGATTCTTGGCCAATTT  600

Query  889  GCCTGTATGCCCGAGCACCGAGACTACGACAGCTTTGTGTGTGTCCTGGTGAGCCGAGGAGGCTCCCAGAGTGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  601  GCCTGTATGCCCGAGCACCGAGACTACGACAGCTTTGTGTGTGTCCTGGTGAGCCGAGGAGGCTCCCAGAGTGT  674

Query  963  GTATGGTGTGGATCAGACTCACTCAGGGCTCCCCCTGCATCACATCAGGAGGATGTTCATGGGAGATTCATGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  675  GTATGGTGTGGATCAGACTCACTCAGGGCTCCCCCTGCATCACATCAGGAGGATGTTCATGGGAGATTCATGCC  748

Query 1037  CTTATCTAGCAGGGAAGCCAAAGATGTTTTTTATTCAGAACTATGTGGTGTCAGAGGGCCAGCTGGAGGACAGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  749  CTTATCTAGCAGGGAAGCCAAAGATGTTTTTTATTCAGAACTATGTGGTGTCAGAGGGCCAGCTGGAGGACAGC  822

Query 1111  AGCCTCTTGGAGGTGGATGGGCCAGCGATGAAGAATGTGGAATTCAAGGCTCAGAAGCGAGGGCTGTGCACAGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  823  AGCCTCTTGGAGGTGGATGGGCCAGCGATGAAGAATGTGGAATTCAAGGCTCAGAAGCGAGGGCTGTGCACAGT  896

Query 1185  TCACCGAGAAGCTGACTTCTTCTGGAGCCTGTGTACTGCGGACATGTCCCTGCTGGAGCAGTCTCACAGCTCAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  897  TCACCGAGAAGCTGACTTCTTCTGGAGCCTGTGTACTGCGGACATGTCCCTGCTGGAGCAGTCTCACAGCTCAC  970

Query 1259  CATCCCTGTACCTGCAGTGCCTCTCCCAGAAACTGAGACAAGAAA----GAAAACGCCCACTCCTGGATCTTCA  1328
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||      |.|.|||.|||      
Sbjct  971  CATCCCTGTACCTGCAGTGCCTCTCCCAGAAACTGAGACAAGAAAGGGGGA------CAATTCCCGGA------  1032

Query 1329  CATTGAACTCAATGGCTACATGTATGATTGGAACAGCAGAGTTTCTGCCAAGGAGAAATATT----ATGTCT-G  1397
                                      |.|||||...||||||     |.|||||.|...|||    |.|.|| |
Sbjct 1033  --------------------------AGTGGAATTACAGAGT-----CAAAGGACATGCATTTTTCAAGCCTCG  1075

Query 1398  GCTGCAGCACACTCTGAGAAAGAAACTTATCCTCTCCTACACA  1440
            |.||||.|..|||   |||             |.|||||    
Sbjct 1076  GATGCATCTTACT---AGA-------------TGTCCTA----  1098