Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02116
• Subject: NM_199122.2
• Aligned Length: 1893
• Identities: 1563
• Gaps: 330

Alignment

Query    1  ATGGCAGCTCACCTGGTAAAGCGATGCACGTGCCTCCTGAGAGAAGCTGCTCGTCAGGCCCCTGCCATGGCTCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGCTCACCTGGTAAAGCGATGCACGTGCCTCCTGAGAGAAGCTGCTCGTCAGGCCCCTGCCATGGCTCC  74

Query   75  AGTTGGCCGACTGAGACTTGCCTGGGTAGCCCATAAGACTCTGACTTCCTCAGCCACCTCACCCATTTCCCACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTTGGCCGACTGAGACTTGCCTGGGTAGCCCATAAGACTCTGACTTCCTCAGCCACCTCACCCATTTCCCACC  148

Query  149  TCCCAGGTTCCTTGATGGAGCCGGTGGAGAAGGAACGAGCATCTACTCCCTACATAGAGAAGCAGGTGGACCAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCCAGGTTCCTTGATGGAGCCGGTGGAGAAGGAACGAGCATCTACTCCCTACATAGAGAAGCAGGTGGACCAC  222

Query  223  CTCATCAAGAAGGCCACAAGGCCAGAGGAGCTCCTGGAGCTACTTGGTGGCAGTCACGACTTGGACAGCAATCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCATCAAGAAGGCCACAAGGCCAGAGGAGCTCCTGGAGCTACTTGGTGGCAGTCACGACTTGGACAGCAATCA  296

Query  297  AGCAGCAATGGTACTTATCCGGCTCTCTCACTTGCTGTCTGAGAAGCCAGAAGATAAAGGCTTGCTCATACAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGCAGCAATGGTACTTATCCGGCTCTCTCACTTGCTGTCTGAGAAGCCAGAAGATAAAGGCTTGCTCATACAGG  370

Query  371  ATGCCCACTTTCATCAACTTCTCTGTCTGCTCAACAGTCAGATTGCCTCGGTCTGGCATGGTACCCTCTCGAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGCCCACTTTCATCAACTTCTCTGTCTGCTCAACAGTCAGATTGCCTCGGTCTGGCATGGTACCCTCTCGAAG  444

Query  445  CTGCTGGGAAGCCTGTATGCTCTGGGCATCCCCAAGGCCTCCAAGGAGCTGCAGTCGGTGGAGCAGGAGGTCCG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGCTGGGAAGCCTGTATGCTCTGGGCATCCCCAAGGCCTCCAAGGAGCTGCAGTCGGTGGAGCAGGAGGTCCG  518

Query  519  CTGGCGCATGCGGAAGCTCAAGTACAAGCACCTGGCCTTCCTGGCAGAGTCCTGTGCCACCCTCTCACAGGAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGGCGCATGCGGAAGCTCAAGTACAAGCACCTGGCCTTCCTGGCAGAGTCCTGTGCCACCCTCTCACAGGAGC  592

Query  593  AGCACTCGCAGGAGCTGCTGGCTGAGCTGCTCACACACCTGGAAAGGCGTTGGACAGAAATTGAAGATTCCCAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCACTCGCAGGAGCTGCTGGCTGAGCTGCTCACACACCTGGAAAGGCGTTGGACAGAAATTGAAGATTCCCAC  666

Query  667  ACATTAGTGACCGTCATGATGAAGGTGGGACACCTCTCGGAGCCACTAATGAACCGCCTGGAAGACAAGTGCCT  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  667  ACATTAGTGACCGTCATGATGAAGGTGGGACACCTCTCGGAGCCACTAATGAACCGCCTGGAAGACA-------  733

Query  741  GGAGTTGGTGGAGCACTTTGGCCCCAATGAGCTGCGGAAGGTGCTGGTGATGCTGGCAGCTCAGAGCCGGCGGT  814
                                                                                      
Sbjct  734  --------------------------------------------------------------------------  733

Query  815  CCGTGCCCTTGCTGCGGGCCATCTCCTACCACCTGGTGCAGAAGCCCTTCTCTCTGACGAAAGATGTGCTCTTG  888
                                                                                      
Sbjct  734  --------------------------------------------------------------------------  733

Query  889  GACGTGGCCTATGCCTATGGCAAACTCAGCTTTCACCAGACCCAGGTGTCCCAGCGCCTGGCCACCGACCTGCT  962
                                                                                      
Sbjct  734  --------------------------------------------------------------------------  733

Query  963  ATCCCTCATGCCCAGCCTGACTTCTGGTGAGGTGGCCCACTGTGCCAAGTCCTTCGCCTTACTCAAGTGGCTCA  1036
                                                                                      
Sbjct  734  --------------------------------------------------------------------------  733

Query 1037  GCCTGCCCCTGTTTGAGGCCTTTGCCCAGCACGTCCTGAACAGAGCGCAGGACATCACCCTGCCCCACCTGTGC  1110
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  734  ---------------------------AGCACGTCCTGAACAGAGCGCAGGACATCACCCTGCCCCACCTGTGC  780

Query 1111  AGCGTACTTCTGGCTTTTGCGCGTCTGAACTTCCATCCAGACCAAGAGGATCAGTTCTTCAGCCTGGTACATGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  781  AGCGTACTTCTGGCTTTTGCGCGTCTGAACTTCCATCCAGACCAAGAGGATCAGTTCTTCAGCCTGGTACATGA  854

Query 1185  GAAGCTGGGGTCAGAGCTGCCAGGCCTGGAGCCAGCCCTGCAGGTGGACCTGGTGTGGGCCCTGTGTGTGCTGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  855  GAAGCTGGGGTCAGAGCTGCCAGGCCTGGAGCCAGCCCTGCAGGTGGACCTGGTGTGGGCCCTGTGTGTGCTGC  928

Query 1259  AGCAGGCACGGGAAGCAGAGCTGCAAGCCGTCCTCCACCCTGAATTTCACATCCAATTTCTAGGGGGCAAGTCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  929  AGCAGGCACGGGAAGCAGAGCTGCAAGCCGTCCTCCACCCTGAATTTCACATCCAATTTCTAGGGGGCAAGTCT  1002

Query 1333  CAGAAGGATCAGAACACCTTCCAGAAGCTGCTCCACATCAACGCCACTGCCCTGCTGGAGTACCCCGAGTACTC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003  CAGAAGGATCAGAACACCTTCCAGAAGCTGCTCCACATCAACGCCACTGCCCTGCTGGAGTACCCCGAGTACTC  1076

Query 1407  GGGTCCCCTTCTGCCTGCCTCGGCTGTGGCCCCTGGGCCCTCAGCCCTTGACAGGAAGGTGACCCCCCTGCAAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077  GGGTCCCCTTCTGCCTGCCTCGGCTGTGGCCCCTGGGCCCTCAGCCCTTGACAGGAAGGTGACCCCCCTGCAAA  1150

Query 1481  AGGAGCTGCAGGAGACGCTGAAGGGGCTGCTGGGGAGCGCCGACAAGGGCAGCCTCGAGGTGGCCACGCAGTAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151  AGGAGCTGCAGGAGACGCTGAAGGGGCTGCTGGGGAGCGCCGACAAGGGCAGCCTCGAGGTGGCCACGCAGTAT  1224

Query 1555  GGCTGGGTGCTGGATGCTGAGGTGCTGCTGGACAGTGACGGCGAGTTTCTGCCCGTAAGGGACTTTGTGGCACC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1225  GGCTGGGTGCTGGATGCTGAGGTGCTGCTGGACAGTGACGGCGAGTTTCTGCCCGTAAGGGACTTTGTGGCACC  1298

Query 1629  TCACCTTGCCCAGCCAACTGGGAGCCAGTCACCACCTCCAGGGTCTAAGAGGCTAGCGTTCTTGCGGTGGGAGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1299  TCACCTTGCCCAGCCAACTGGGAGCCAGTCACCACCTCCAGGGTCTAAGAGGCTAGCGTTCTTGCGGTGGGAGT  1372

Query 1703  TCCCCAACTTCAACAGCCGAAGCAAGGACTTGCTGGGTCGCTTTGTTCTGGCCCGGCGACACATAGTGGCTGCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373  TCCCCAACTTCAACAGCCGAAGCAAGGACTTGCTGGGTCGCTTTGTTCTGGCCCGGCGACACATAGTGGCTGCA  1446

Query 1777  GGCTTCCTGATAGTGGACGTCCCATTCTATGAGTGGCTGGAACTCAAGTCTGAATGGCAGAAAGGCGCCTACCT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1447  GGCTTCCTGATAGTGGACGTCCCATTCTATGAGTGGCTGGAACTCAAGTCTGAATGGCAGAAAGGCGCCTACCT  1520

Query 1851  CAAGGACAAGATGCGCAAAGCGGTGGCTGAGGAGCTGGCCAAG  1893
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1521  CAAGGACAAGATGCGCAAAGCGGTGGCTGAGGAGCTGGCCAAG  1563