Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02397
• Subject: NM_001271487.1
• Aligned Length: 768
• Identities: 645
• Gaps: 60

Alignment

Query   1  ATGGCGGAGCCGTCGGCGGCCACTCAGTCCCATTCCATCTCCTCGTCGTCCTTCGGAGCCGAGCCGTCCGCGC-  73
           |||||||||.||||.||||||||||||||||..||..|||||||||||||||.|||.|||||||||||.||.| 
Sbjct   1  ATGGCGGAGTCGTCAGCGGCCACTCAGTCCCCGTCAGTCTCCTCGTCGTCCTCCGGGGCCGAGCCGTCAGCTCT  74

Query  74  --CCGGCGGCGGCGGGAGCCCAGGAGCCTGCCCCGCCCTGGGGACGAAGAGCTGCAGCTCCTCCTGTGCG----  141
             .||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.||||||    
Sbjct  75  CGGCGGCGGCGGCGGGAGCCCTGGAGCCTGCCCCGCCCTGGGGGCGAAGAGCTGCGGCTCCTCGTGTGCGGATT  148

Query 142  -----------------------------------------------------GTGCACGATCTGATTTTCTGG  162
                                                                |||||||||||||||||||||
Sbjct 149  CCTTTGTTTCTTCCTCTTCCTCTCAGCCTGTATCTATATTTTCGACCTCACAAGTGCACGATCTGATTTTCTGG  222

Query 163  AGAGATGTGAAGAAGACTGGGTTTGTCTTTGGCACCACGCTGATCATGCTGCTTTCCCTGGCAGCTTTCAGTGT  236
           .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 223  CGAGATGTGAAGAAGACTGGGTTTGTCTTTGGCACCACACTGATCATGCTGCTCTCTCTGGCAGCCTTCAGTGT  296

Query 237  CATCAGTGTGGTTTCTTACCTCATCCTGGCTCTTCTCTCTGTCACCATCAGCTTCAGGATCTACAAGTCCGTCA  310
           .|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||.||||
Sbjct 297  TATCAGTGTGGTCTCTTACCTCATCCTGGCTCTTCTCTCTGTCACCATCAGCTTCAGAGTCTATAAGTCTGTCA  370

Query 311  TCCAAGCTGTACAGAAGTCAGAAGAAGGCCATCCATTCAAAGCCTACCTGGACGTAGACATTACTCTGTCCTCA  384
           |.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.||||.||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 371  TTCAAGCTGTGCAGAAGTCAGAAGAAGGACATCCATTCAAGGCCTACTTGGATGTGGACATTACCCTGTCTTCA  444

Query 385  GAAGCTTTCCATAATTACATGAATGCTGCCATGGTGCACATCAACAGGGCCCTGAAACTCATTATTCGTCTCTT  458
           |||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||..||||||.||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GAAGCTTTCCACAACTACATGAATGCTGCGATGGTGCATGTCAACAAGGCCCTCAAACTCATTATTCGTCTCTT  518

Query 459  TCTGGTAGAAGATCTGGTTGACTCCTTGAAGCTGGCTGTCTTCATGTGGCTGATGACCTATGTTGGTGCTGTTT  532
           ||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  TCTGGTAGAAGACTTGGTTGACTCCTTGAAGCTGGCTGTCTTCATGTGGCTGATGACCTATGTTGGTGCTGTTT  592

Query 533  TTAACGGAATCACCCTTCTAATTCTTGCTGAACTGCTCATTTTCAGTGTCCCGATTGTCTATGAGAAGTACAAG  606
           ||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||..|.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 593  TTAATGGAATTACCCTTCTGATTCTCGCCGAGCTGCTTGTCTTCAGCGTCCCAATTGTCTATGAGAAGTATAAG  666

Query 607  ACCCAGATTGATCACTATGTTGGCATCGCCCGAGATCAGACCAAGTCAATTGTTGAAAAGATCCAAGCAAAACT  680
           ||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 667  ACACAGATTGACCACTATGTTGGGATTGCCCGGGATCAGACCAAGTCAATTGTTGAAAAGATCCAAGCAAAGCT  740

Query 681  CCCTGGAATCGCCAAAAAAAAGGCAGAA  708
           .|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  TCCTGGAATCGCCAAAAAAAAGGCAGAA  768