Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_02397
Subject:
XM_017318088.1
Aligned Length:
756
Identities:
588
Gaps:
96

Alignment

Query   1  ATGGCGGAGCCGTCGGCGGCCACTCAGTCCCATTCCATCTCCTCGTCGTCCTTCGGAGC---CGAGCCGTCCGC  71
                                           .|.||.||.||.||  .|||..|.|||   |||         
Sbjct   1  --------------------------------ATGCAGCTGCTGGT--ACCTAGGCAGCATGCGA---------  31

Query  72  GCCCGG----CGGCGGCGGGAGCCCAGGA-----GCCTGCCCCGC-----------CCTG--------GGGACG  117
              .||    |.||.||.||| |.|||.|     |.||||.||||           ||||        .|||.|
Sbjct  32  ---TGGGTAACTGCTGCTGGA-CGCAGTACTTTGGGCTGCACCGCAAGGAAGGGGGCCTGATGCAGACAGGAGG  101

Query 118  AAG-AGCTGCA-GCTCC------TCCTGTGCG---------GTGCACGATCTGATTTTCTGGAGAGATGTGAAG  174
           ||| || |||| |.|||      |...|.|||         |||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 102  AAGCAG-TGCAGGATCCAAGGGTTTTAGAGCGTGCCCGAGAGTGCACGATCTGATTTTCTGGCGAGATGTGAAG  174

Query 175  AAGACTGGGTTTGTCTTTGGCACCACGCTGATCATGCTGCTTTCCCTGGCAGCTTTCAGTGTCATCAGTGTGGT  248
           ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 175  AAGACTGGGTTTGTCTTTGGCACCACACTGATCATGCTGCTCTCTCTGGCAGCCTTCAGTGTTATCAGTGTGGT  248

Query 249  TTCTTACCTCATCCTGGCTCTTCTCTCTGTCACCATCAGCTTCAGGATCTACAAGTCCGTCATCCAAGCTGTAC  322
           .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 249  CTCTTACCTCATCCTGGCTCTTCTCTCTGTCACCATCAGCTTCAGAGTCTATAAGTCTGTCATTCAAGCTGTGC  322

Query 323  AGAAGTCAGAAGAAGGCCATCCATTCAAAGCCTACCTGGACGTAGACATTACTCTGTCCTCAGAAGCTTTCCAT  396
           ||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 323  AGAAGTCAGAAGAAGGACATCCATTCAAGGCCTACTTGGATGTGGACATTACCCTGTCTTCAGAAGCTTTCCAC  396

Query 397  AATTACATGAATGCTGCCATGGTGCACATCAACAGGGCCCTGAAACTCATTATTCGTCTCTTTCTGGTAGAAGA  470
           ||.||||||||||||||.||||||||..||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 397  AACTACATGAATGCTGCGATGGTGCATGTCAACAAGGCCCTCAAACTCATTATTCGTCTCTTTCTGGTAGAAGA  470

Query 471  TCTGGTTGACTCCTTGAAGCTGGCTGTCTTCATGTGGCTGATGACCTATGTTGGTGCTGTTTTTAACGGAATCA  544
           ..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 471  CTTGGTTGACTCCTTGAAGCTGGCTGTCTTCATGTGGCTGATGACCTATGTTGGTGCTGTTTTTAATGGAATTA  544

Query 545  CCCTTCTAATTCTTGCTGAACTGCTCATTTTCAGTGTCCCGATTGTCTATGAGAAGTACAAGACCCAGATTGAT  618
           |||||||.|||||.||.||.|||||..|.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 545  CCCTTCTGATTCTCGCCGAGCTGCTTGTCTTCAGCGTCCCAATTGTCTATGAGAAGTATAAGACACAGATTGAC  618

Query 619  CACTATGTTGGCATCGCCCGAGATCAGACCAAGTCAATTGTTGAAAAGATCCAAGCAAAACTCCCTGGAATCGC  692
           |||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 619  CACTATGTTGGGATTGCCCGGGATCAGACCAAGTCAATTGTTGAAAAGATCCAAGCAAAGCTTCCTGGAATCGC  692

Query 693  CAAAAAAAAGGCAGAA  708
           ||||||||||||||||
Sbjct 693  CAAAAAAAAGGCAGAA  708