Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02409
• Subject: NM_025812.3
• Aligned Length: 1041
• Identities: 951
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGAAAACTTGATGACTAGCTCCACCCTACCGCCCCTTTTTGCAGATGAAGACGGTTCCAAGGAGAGTAATGA  74
            |||||.|.|||||||.|.||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGAGAGCTTGATGGCCAGTTCTACCCTGCCGCCCCTGTTTGCAGATGAAGATGGCTCCAAGGAGAGCAATGA  74

Query   75  TCTGGCTACCACTGGGTTAAATCACCCAGAGGTTCCATACAGTAGTGGCGCCACATCATCCACCAACAATCCAG  148
            |||||||||..|||||||||..|||||.||||.|||.||..|.||||..|||||||||.|.||||||   ||||
Sbjct   75  TCTGGCTACATCTGGGTTAACACACCCCGAGGGTCCGTATGGCAGTGCAGCCACATCAACAACCAAC---CCAG  145

Query  149  AATTTGTGGAGGATCTCTCTCAAGGTCAGTTGCTTCAGAGTGAGTCTTCAAATGCAGCAGAAGGCAATGAACAG  222
            |.|||||||||||||||||.|||||.|||.||||||||||||||.||||.|||||.|.||||||||||||.||.
Sbjct  146  AGTTTGTGGAGGATCTCTCCCAAGGCCAGCTGCTTCAGAGTGAGGCTTCCAATGCTGTAGAAGGCAATGAGCAA  219

Query  223  AGGCATGAAGATGAGCAACGAAGTAAACGAGGAGGTTGGTCCAAAGGAAGAAAGAGGAAGAAACCTCTTCGAGA  296
            ||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  220  AGGCCTGAAGATGAGCAAAGAAGTAAACGAGGAGGTTGGTCCAAAGGGAGAAAAAGGAAGAAACCTCTTCGAGA  293

Query  297  CAGCAATGCACCCAAATCCCCCCTTACAGGATATGTTCGGTTCATGAATGAGCGTCGAGAACAACTTCGAGCAA  370
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||.||||||||||
Sbjct  294  CAGCAATGCACCTAAATCCCCCCTTACAGGATATGTTCGATTCATGAACGAGCGTAGAGAACAGCTTCGAGCAA  367

Query  371  AGAGACCAGAAGTCCCATTTCCAGAAATCACAAGGATGTTAGGCAATGAATGGAGTAAACTGCCTCCTGAGGAA  444
            ||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  AGAGACCAGAGGTTCCATTTCCAGAAATCACAAGGATGTTGGGCAATGAGTGGAGTAAACTGCCTCCTGAGGAA  441

Query  445  AAACAGCGCTACCTTGATGAAGCAGACAGAGATAAGGAGCGTTACATGAAGGAACTGGAACAGTATCAGAAAAC  518
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  442  AAGCAGCGCTACCTTGATGAAGCAGACAGAGATAAGGAGCGTTACATGAAGGAACTGGAGCAGTATCAGAAGAC  515

Query  519  AGAGGCCTACAAGGTCTTCAGTAGGAAAACCCAGGACCGTCAGAAAGGCAAATCTCATAGGCAAGATGCAGCCC  592
            .|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  CGAGGCCTACAAGGTCTTCAGTAGGAAAACACAGGACCGTCAGAAAGGCAAATCTCATAGGCAAGATGCAGCCC  589

Query  593  GGCAGGCCACTCATGATCATGAGAAAGAAACAGAGGTAAAGGAACGGTCTGTTTTTGACATCCCTATATTTACA  666
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  590  GACAGGCCACTCATGATCATGAGAAAGAAACAGAGGTAAAGGAACGCTCTGTTTTTGATATCCCTATATTTACC  663

Query  667  GAGGAATTCTTGAACCATAGCAAAGCTCGGGAAGCAGAGCTCCGCCAGCTTCGCAAATCCAACATGGAGTTTGA  740
            ||.||||||.|||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  664  GAAGAATTCCTGAACCACAGCAAAGCTCGTGAGGCAGAGCTCCGCCAGCTTCGTAAATCCAACATGGAGTTTGA  737

Query  741  GGAGAGGAATGCAGCCCTGCAAAAGCACGTGGAGAGCATGCGCACAGCAGTGGAGAAGCTGGAGGTGGATGTGA  814
            .||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  738  AGAGAGGAACGCAGCCCTACAGAAGCACGTGGAGAGCATGCGCACAGCAGTGGAGAAGCTGGAGGTTGACGTGA  811

Query  815  TCCAGGAGCGGAGCCGCAACACAGTCTTACAGCAGCACCTGGAGACCCTGCGGCAGGTGCTGACCAGCAGCTTT  888
            ||||||||||||||||.|||||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||.
Sbjct  812  TCCAGGAGCGGAGCCGAAACACCGTCCTTCAGCAGCACCTGGAGACCCTGCGGCAGATGTTGACCAGCAGCTTC  885

Query  889  GCCAGCATGCCCTTGCCTGGAAGTGGAGAGACACCTACAGTGGACACCATTGACTCATATATGAACAGACTGCA  962
            |||||||||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct  886  GCCAGCATGCCCTTGCCTGGAAGTGGAGAAATACCAACAGTGGACACCATTGACTCATACATGAACAGATTGCA  959

Query  963  CAGTATTATTTTAGCTAATCCCCAAGACAATGAAAACTTCATAGCTACAGTTCGAGAAGTTGTGAACAGACTCG  1036
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  960  CAGTATAATTTTAGCTAATCCCCAAGACAACGAAAACTTCATAGCTACAGTCCGAGAGGTTGTGAACAGGCTTG  1033

Query 1037  ATCGT  1041
            |||||
Sbjct 1034  ATCGT  1038