Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02460
- Subject:
- NM_028835.4
- Aligned Length:
- 2109
- Identities:
- 1736
- Gaps:
- 96
Alignment
Query 1 ATGGCGGCAGCTACGGGGGATCCTGGACTCTCTAAACTGCAGTTTGCCCCTTTTAGTAGTGCCTTGGATGTTGG 74
|.||||||.||||||||..|.||..|||||||.|||||.||||.|||||||.||||.|||||
Sbjct 1 ------------ATGGGGGACCCTGGACTGGCCAAGTTGCAGTTCGCCCCCTTTAATAGTGCCCTGGACGTTGG 62
Query 75 GTTTTGGCATGAGTTGACCCAGAAGAAGCTGAACGAGTATCGGCTGGATGAAGCTCCCAAGGACATTAAGGGTT 148
.||.|||||.||..||||||||||||||.||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct 63 CTTCTGGCACGAACTGACCCAGAAGAAGTTGAACGAGTACCGCCTGGACGAGGCACCCAAAGACATCAAGGGCT 136
Query 149 ATTACTACAATGGTGACTCTGCTGGGCTGCCAGCTCGCTTAACATTGGAGTTCAGTGCTTTTGACATGAGTGCT 222
|||||||||||||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 137 ATTACTACAATGGTGACTCTGCTGGTCTGCCCACCCGCTTGACGTTGGAGTTCAGTGCTTTTGACATGAGTGCC 210
Query 223 CCCACCCCAGCCCGTTGCTGCCCAGCTATTGGAACACTGTATAACACCAACACACTCGAGTCTTTCAAGACTGC 296
.||||.||.||||..||||||||.||.||.|||||.|||.|.||||||||||||||.|||.||||.|||||.||
Sbjct 211 TCCACGCCTGCCCACTGCTGCCCGGCCATGGGAACCCTGCACAACACCAACACACTTGAGGCTTTTAAGACAGC 284
Query 297 AGATAAGAAGCTCCTTTTGGAACAAGCAGCAAATGAGATATGGGAATCCATAAAATCAGGCACTGCTCTTGAAA 370
|||.||||||||||||.||||.||..|||||||||||||.||||||.|||||||.|||||..|||||||.||||
Sbjct 285 AGACAAGAAGCTCCTTCTGGAGCAGTCAGCAAATGAGATCTGGGAAGCCATAAAGTCAGGTGCTGCTCTCGAAA 358
Query 371 ACCCTGTACTCCTCAACAAGTTCCTCCTCTTGACATTTGCAGATCTAAAGAAGTACCACTTCTACTATTGGTTT 444
||||..|.||||||||||||||.||.|||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 359 ACCCCATGCTCCTCAACAAGTTTCTGCTCCTGACCTTCGCGGACCTAAAGAAGTACCACTTCTACTACTGGTTT 432
Query 445 TGCTATCCTGCCCTCTGTCTTCCAGAGAGTTTACCTCTCATTCAGGGGCCAGTGGGTTTGGATCAAAGGTTTTC 518
||||..||.||||||||||||||.|||||..|.|||||.||.|.|||.||.|||.|.||||||||||||.||||
Sbjct 433 TGCTGCCCCGCCCTCTGTCTTCCTGAGAGCATCCCTCTAATCCGGGGACCTGTGAGCTTGGATCAAAGGCTTTC 506
Query 519 ACTAAAACAGATTGAAGCACTAGAGTGTGCATATGATAATCTTTGTCAAACAGAAGGAGTCACAGCTCTTCCTT 592
||.|||||||||..|.||.||.|||..|||.||||||.||||.||||.|.|.|||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 507 ACCAAAACAGATCCAGGCCCTGGAGCATGCCTATGATGATCTGTGTCGAGCCGAAGGCGTCACGGCCCTGCCCT 580
Query 593 ACTTCTTAATCAAGTATGATGAGAACATGGTGCTGGTTTCCTTGCTTAAACACTACAGTGATTTCTTCCAAGGT 666
||||||||.|||||||.|||||..|||..||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 ACTTCTTATTCAAGTACGATGACGACACTGTTCTGGTCTCCTTGCTCAAACACTACAGTGATTTCTTCCAAGGT 654
Query 667 CAAAGGACGAAGATAACAATTGGTGTATATGATCCCTGTAACTTAGCCCAGTACCCTGGATGGCCTTTGAGGAA 740
||||||||.|||||||||.|||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 CAAAGGACAAAGATAACAGTTGGTGTGTACGATCCCTGTAACCTAGCCCAGTACCCTGGATGGCCTTTGAGGAA 728
Query 741 TTTTTTGGTCCTAGCAGCCCACAGATGGAGTAGCAGTTTCCAGTCTGTTGAAGTTGTTTGCTTCCGTGACCGTA 814
||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||..|.|||||.||.|||||.|
Sbjct 729 TTTTTTGGTCCTGGCAGCCCACAGATGGAGCGGCAGTTTCCAGTCCGTTGAAGTCCTCTGCTTTCGGGACCGCA 802
Query 815 CCATGCAGGGGGCGAGAGACGTTGCCCACAGCATCATCTTCGAAGTGAAGCTTCCAGAAATGGCATTTAGCCCA 888
||||||||||.||.||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 803 CCATGCAGGGAGCTAGAGACGTGACACATAGCATCATCTTTGAAGTGAAACTTCCAGAAATGGCATTTAGCCCA 876
Query 889 GATTGTCCTAAAGCAGTTGGATGGGAAAAGAACCAGAAAGGAGGCATGGGACCAAGGATGGTGAACCTCAGTGA 962
||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||.
Sbjct 877 GATTGTCCTAAAGCTGTTGGCTGGGAGAAGAACCAGAAAGGAGGCATGGGTCCGAGGATGGTGAACCTCAGTGG 950
Query 963 ATGTATGGACCCTAAAAGGTTAGCTGAGTCATCAGTGGATCTAAATCTCAAACTGATGTGTTGGAGATTGGTTC 1036
||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||.|||||||.|
Sbjct 951 ATGTATGGACCCCAAAAGGCTGGCTGAGTCATCTGTGGATCTGAATCTCAAGCTGATGTGCTGGCGATTGGTCC 1024
Query 1037 CTACTTTAGACTTGGACAAGGTTGTGTCTGTCAAATGTCTGCTGCTTGGAGCCGGCACCTTGGGTTGCAATGTA 1110
|.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.
Sbjct 1025 CCACCTTGGACTTGGACAAGGTCGTGTCTGTCAAGTGCCTGCTGCTGGGAGCTGGTACCTTGGGGTGTAATGTG 1098
Query 1111 GCTAGGACGTTGATGGGTTGGGGCGTGAGACACATCACATTTGTGGACAATGCCAAGATCTCCTACTCCAATCC 1184
||||||||..|||||||.||||||||.|||||..||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099 GCTAGGACACTGATGGGCTGGGGCGTCAGACATGTCACCTTTGTGGATAACGCCAAGATCTCCTACTCCAATCC 1172
Query 1185 TGTGAGGCAGCCTCTCTATGAGTTTGAAGATTGCCTAGGGGGTGGTAAGCCCAAGGCTCTGGCAGCAGCGGACC 1258
.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 1173 CGTGAGGCAGCCTCTGTATGAATTTGAAGATTGTCTAGGGGGTGGCAAGCCCAAGGCCCTGGCTGCAGCAGAGC 1246
Query 1259 GGCTCCAGAAAATATTCCCCGGTGTGAATGCCAGAGGATTCAACATGAGCATACCTATGCCTGGGCATCCAGTG 1332
||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 1247 GGCTACAGAAAATATTTCCCGGAGTGAATGCCAGAGGGTTCAACATGAGCATCCCCATGCCAGGACACCCTGTG 1320
Query 1333 AACTTCTCCAGTGTCACTCTGGAGCAAGCCCGCAGAGATGTGGAGCAACTGGAGCAGCTCATCGAAAGCCATGA 1406
||||||||....|||||..|||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|.||||||
Sbjct 1321 AACTTCTCTGACGTCACGATGGAGCAGGCCCGCAGAGATGTGGAGCAGCTGGAGCAGCTCATTGATAACCATGA 1394
Query 1407 TGTCGTCTTCCTATTGATGGACACCAGGGAGAGCCGGTGGCTTCCTGCCGTCATTGCTGCAAGCAAGAGAAAGC 1480
||||.|||||||..|.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||.||.||||||.||||||
Sbjct 1395 TGTCATCTTCCTGCTAATGGACACCAGGGAGAGCCGGTGGCTTCCTACTGTTATTGCAGCCAGCAAGCGAAAGC 1468
Query 1481 TGGTCATCAATGCTGCTTTGGGATTTGACACATTTGTTGTCATGAGACATGGTCTGAAGAAACCAAAGCAGCAA 1554
||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1469 TGGTCATCAACGCTGCCTTGGGGTTTGATACCTTTGTTGTCATGAGACATGGCCTGAAGAAACCCAAGCAGCAG 1542
Query 1555 GGAGCTGGGGACTTGTGTCCAAACCACCCTGTGGCATCTGCTGACCTCCTGGGCTCATCGCTTTTTGCCAACAT 1628
|||||.||.|||.|.||.||||.|||.|.|||.|||.||||||| |||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1543 GGAGCCGGAGACCTCTGCCCAAGCCATCTTGTAGCACCTGCTGA---CCTGGGCTCCTCACTTTTTGCCAACAT 1613
Query 1629 CCCTGGTTACAAGCTTGGCTGCTACTTCTGCAATGATGTGGTGGCCCCAGGAGATTCAACCAGAGACCGGACCT 1702
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 1614 CCCTGGATACAAGCTTGGCTGCTACTTCTGCAATGATGTGGTGGCTCCAGGAGATTCAACCAGAGACCGGACTC 1687
Query 1703 TGGACCAGCAGTGCACTGTGAGTCGTCCAGGACTGGCCGTGATTGCAGGAGCCCTGGCCGTGGAATTGATGGTA 1776
||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||..|||||||.
Sbjct 1688 TGGACCAGCAGTGCACAGTGAGCCGCCCAGGCCTGGCCGTGATTGCAGGTGCCCTGGCTGTGGAGCTGATGGTC 1761
Query 1777 TCTGTTTTGCAGCATCCAGAAGGGGGCTATGCCATTGCCAGCAGCAGTGACGATCGGATGAATGAGCCTCCAAC 1850
|||||..||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1762 TCTGTCCTGCAGCATCCTGAGGGGGGCTACGCCATCGCCAGCAGCAGTGATGACCGCATGAATGAGCCTCCCAC 1835
Query 1851 CTCTCTTGGGCTTGTGCCTCACCAG------------------------------------------------- 1875
|||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1836 CTCGCTGGGACTTGTGCCTCACCAGATCCGGGGTTTTCTGTCACGGTTCGATAATGTTCTTCCTGTCAGCCTGG 1909
Query 1876 --------------------------------GTTCTTGATCAATATGAACGAGAAGGATTTAACTTCCTAGCC 1917
|||||||||||.||.||.|||||||||||.|.|||||||||.
Sbjct 1910 CATTTGATAAATGTACAGCCTGTTCACCCAAAGTTCTTGATCAGTACGAGCGAGAAGGATTCACCTTCCTAGCG 1983
Query 1918 AAGGTGTTTAATTCTTCACATTCCTTCTTAGAAGACTTGACTGGTCTTACATTGCTGCATCAAGAAACCCAAGC 1991
|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||..||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1984 AAGGTTTTTAACTCCTCACATTCCTTCTTAGAAGACTTGACCGGTCTTACCCTGCTCCATCAAGAGACCCAAGC 2057
Query 1992 TGCTGAGATCTGGGACATGAGCGATGATGAGACCATC 2028
|||||||||||||||||||||.||.||.|||||..||
Sbjct 2058 TGCTGAGATCTGGGACATGAGTGACGAGGAGACTGTC 2094