Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_02519
Subject:
NM_006612.6
Aligned Length:
1103
Identities:
1103
Gaps:
0

Alignment

Query    1  MAGASVKVAVRVRPFNARETSQDAKCVVSMQGNTTSIINPKQSKDAPKSFTFDYSYWSHTSTEDPQFASQQQVY  74
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Sbjct    1  MAGASVKVAVRVRPFNARETSQDAKCVVSMQGNTTSIINPKQSKDAPKSFTFDYSYWSHTSTEDPQFASQQQVY  74

Query   75  RDIGEEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGRQEPGQQGIVPQLCEDLFSRVSENQSAQLSYSVEVSYME  148
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Sbjct   75  RDIGEEMLLHAFEGYNVCIFAYGQTGAGKSYTMMGRQEPGQQGIVPQLCEDLFSRVSENQSAQLSYSVEVSYME  148

Query  149  IYCERVRDLLNPKSRGSLRVREHPILGPYVQDLSKLAVTSYADIADLMDCGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFT  222
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Sbjct  149  IYCERVRDLLNPKSRGSLRVREHPILGPYVQDLSKLAVTSYADIADLMDCGNKARTVAATNMNETSSRSHAVFT  222

Query  223  IVFTQRCHDQLTGLDSEKVSKISLVDLAGSERADSSGARGMRLKEGANINKSLTTLGKVISALADMQSKKRKSD  296
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Sbjct  223  IVFTQRCHDQLTGLDSEKVSKISLVDLAGSERADSSGARGMRLKEGANINKSLTTLGKVISALADMQSKKRKSD  296

Query  297  FIPYRDSVLTWLLKENLGGNSRTAMIAALSPADINYEETLSTLRYADRTKQIRCNAIINEDPNARLIRELQEEV  370
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Sbjct  297  FIPYRDSVLTWLLKENLGGNSRTAMIAALSPADINYEETLSTLRYADRTKQIRCNAIINEDPNARLIRELQEEV  370

Query  371  ARLRELLMAQGLSASALEGLKTEEGSVRGALPAVSSPPAPVSPSSPTTHNGELEPSFSPNTESQIGPEEAMERL  444
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Sbjct  371  ARLRELLMAQGLSASALEGLKTEEGSVRGALPAVSSPPAPVSPSSPTTHNGELEPSFSPNTESQIGPEEAMERL  444

Query  445  QETEKIIAELNETWEEKLRKTEALRMEREALLAEMGVAVREDGGTVGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYHI  518
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Sbjct  445  QETEKIIAELNETWEEKLRKTEALRMEREALLAEMGVAVREDGGTVGVFSPKKTPHLVNLNEDPLMSECLLYHI  518

Query  519  KDGVTRVGQVDMDIKLTGQFIREQHCLFRSIPQPDGEVVVTLEPCEGAETYVNGKLVTEPLVLKSGNRIVMGKN  592
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Sbjct  519  KDGVTRVGQVDMDIKLTGQFIREQHCLFRSIPQPDGEVVVTLEPCEGAETYVNGKLVTEPLVLKSGNRIVMGKN  592

Query  593  HVFRFNHPEQARLERERGVPPPPGPPSEPVDWNFAQKELLEQQGIDIKLEMEKRLQDLENQYRKEKEEADLLLE  666
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Sbjct  593  HVFRFNHPEQARLERERGVPPPPGPPSEPVDWNFAQKELLEQQGIDIKLEMEKRLQDLENQYRKEKEEADLLLE  666

Query  667  QQRLYADSDSGDDSDKRSCEESWRLISSLREQLPPTTVQTIVKRCGLPSSGKRRAPRRVYQIPQRRRLQGKDPR  740
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Sbjct  667  QQRLYADSDSGDDSDKRSCEESWRLISSLREQLPPTTVQTIVKRCGLPSSGKRRAPRRVYQIPQRRRLQGKDPR  740

Query  741  WATMADLKMQAVKEICYEVALADFRHGRAEIEALAALKMRELCRTYGKPDGPGDAWRAVARDVWDTVGEEEGGG  814
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Sbjct  741  WATMADLKMQAVKEICYEVALADFRHGRAEIEALAALKMRELCRTYGKPDGPGDAWRAVARDVWDTVGEEEGGG  814

Query  815  AGSGGGSEEGARGAEVEDLRAHIDKLTGILQEVKLQNSSKDRELQALRDRMLRMERVIPLAQDHEDENEEGGEV  888
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Sbjct  815  AGSGGGSEEGARGAEVEDLRAHIDKLTGILQEVKLQNSSKDRELQALRDRMLRMERVIPLAQDHEDENEEGGEV  888

Query  889  PWAPPEGSEAAEEAAPSDRMPSARPPSPPLSSWERVSRLMEEDPAFRRGRLRWLKQEQLRLQGLQGSGGRGGGL  962
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Sbjct  889  PWAPPEGSEAAEEAAPSDRMPSARPPSPPLSSWERVSRLMEEDPAFRRGRLRWLKQEQLRLQGLQGSGGRGGGL  962

Query  963  RRPPARFVPPHDCKLRFPFKSNPQHRESWPGMGSGEAPTPLQPPEEVTPHPATPARRPPSPRRSHHPRRNSLDG  1036
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Sbjct  963  RRPPARFVPPHDCKLRFPFKSNPQHRESWPGMGSGEAPTPLQPPEEVTPHPATPARRPPSPRRSHHPRRNSLDG  1036

Query 1037  GGRSRGAGSAQPEPQHFQPKKHNSYPQPPQPYPAQRPPGPRYPPYTTPPRMRRQRSAPDLKESGAAV  1103
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Sbjct 1037  GGRSRGAGSAQPEPQHFQPKKHNSYPQPPQPYPAQRPPGPRYPPYTTPPRMRRQRSAPDLKESGAAV  1103