Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02663
- Subject:
- XM_006530650.3
- Aligned Length:
- 1440
- Identities:
- 1040
- Gaps:
- 279
Alignment
Query 1 ATGGCCACTGACTCATGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAAGCTGCGGCTGAGTCGTTGAGCAACTTGCATCT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TAAGGAAGAGAAAATCAAACCAGATACCAATGGTGCTGTTGTCAAGACCAATGCCAATGCAGAGAAGACAGATG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AAGAAGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AACCAAGTGGAAGTCCTGCAGCGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAA---GTCTTTTGAAGAGCTTCG 293
.|| ||.| ||| |||| || ||.|
Sbjct 1 ---------------------------------------ATG---TCAG-GAACATGTCT----AA----TTAG 23
Query 294 GCTGAAACCACAGCTTCTCCAAGGAGTCTATGCCATGGGTTTCAATCGTCCATCCAAGATACAAGAGAACGCAT 367
||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.||..
Sbjct 24 ---GAAACCTCAGCTTCTCCAAGGAGTCTACGCCATGGGCTTCAATCGACCGTCCAAGATCCAGGAGAATGCTC 94
Query 368 TGCCACTGATGCTTGCTGAGCCCCCACAGAACTTAATTGCCCAATCTCAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCC 441
||||..|||||||||||||.||||||||||||.|.|||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 95 TGCCCATGATGCTTGCTGAACCCCCACAGAACCTGATTGCACAGTCCCAGTCTGGTACTGGGAAAACAGCTGCC 168
Query 442 TTCGTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTA 515
||.||.||.||.|||||.|||..|||.|||||.|||.|||.|||.||.||||||.|.||.||.||||||||.||
Sbjct 169 TTTGTCCTAGCTATGCTCAGCAGAGTGGAACCAGCAGACAGATATCCTCAGTGTTTGTGCCTGTCCCCAACATA 242
Query 516 TGAGCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAATTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATG 589
||||||.||..|.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||.||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct 243 TGAGCTGGCATTACAAACTGGAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAGTTTCACCCAGAATTGAAGCTAGCTTATG 316
Query 590 CTGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTG 663
||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 317 CTGTTCGAGGCAATAAATTGGAGAGAGGTCAGAAGGTGAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCCGGGACCGTC 390
Query 664 CTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGT 737
.|||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 391 TTGGACTGGTGCTCCAAGCTGAAGTTCATTGACCCCAAGAAGATCAAGGTGTTTGTTCTGGACGAGGCTGATGT 464
Query 738 CATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGC 811
.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 465 GATGATAGCGACTCAGGGCCACCAAGACCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGAAACTGCCAGATGC 538
Query 812 TGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATC 885
||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|.|||
Sbjct 539 TGCTTTTCTCGGCCACCTTTGAAGACTCGGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAGGTGGTCCCAGACCCCAACATCATC 612
Query 886 AAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAA 959
||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||..|.||||||.|||||
Sbjct 613 AAGCTAAAGCGTGAGGAGGAGACTCTGGACACCATCAAACAGTACTACGTCCTCTGCAATAACAGAGAGGAGAA 686
Query 960 GTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAA 1033
||||||||||.||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 687 GTTCCAGGCCCTGTGCAACCTGTATGGGGCCATCACCATCGCCCAAGCCATGATCTTCTGCCATACCCGCAAAA 760
Query 1034 CAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTG 1107
|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 761 CAGCTAGCTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAGGGCCACCAGGTGGCCCTGCTGAGTGGAGAGATGATGGTG 834
Query 1108 GAACAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGC 1181
||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 835 GAGCAGAGGGCTGCGGTGATCGAGCGCTTCCGAGAAGGCAAAGAGAAGGTTCTGGTGACCACCAACGTGTGTGC 908
Query 1182 CCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTG 1255
|||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 909 CCGTGGTATCGATGTTGAACAGGTGTCTGTCGTCATCAATTTTGACCTCCCTGTGGACAAGGATGGGAACCCAG 982
Query 1256 ACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTG 1329
||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 983 ACAATGAGACCTACCTGCACCGCATTGGGCGCACTGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGTCTGGCGGTGAACATGGTG 1056
Query 1330 GACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACAC 1403
||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1057 GACAGCAAGCACAGCATGAATATCCTCAACAGGATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGACTGGACAC 1130
Query 1404 AGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC 1437
|||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1131 AGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATCGCCAAC 1164