Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02688
- Subject:
- NM_001164391.1
- Aligned Length:
- 1779
- Identities:
- 1302
- Gaps:
- 477
Alignment
Query 1 ATGAGAGACTCTACAGGGGCAGGTAATTCACTGGTCCACAAGCGGTCTCCTTTACGTCGAAACCAAAAGACCCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AACATCCTTGACCAAGCTGTCTTTACAGGATGGACATAAAGCCAAAAAGCCAGCATGTAAATTTGAAGAGGGTC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGGATGTCCTAGCTAGATGGTCAGATGGCTTGTTTTATCTTGGCACTATCAAAAAGATAAACATATTGAAACAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AGCTGCTTCATCATATTTGAAGACAGTTCTAAATCCTGGGTTCTCTGGAAGGACATTCAAACAGGAGCCACTGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AAGTGGGGAAATGGTCTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATTCAGAAGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGACA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------ATGGTCTGTACAATATGTCAAGAAGAGTATTCAGAAGCTCCCAATGAAATGGTTATATGTGACA 64
Query 371 AGTGTGGCCAAGGATATCATCAGTTGTGTCACACACCTCATATTGATTCCAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 65 AGTGTGGCCAAGGATATCATCAGTTGTGTCACACACCTCATATTGATTCCAGTGTGATTGATTCAGATGAAAAA 138
Query 445 TGGCTCTGTCGGCAGTGTGTTTTTGCAACAACAACAAAGAGGGGTGGTGCACTTAAGAAAGGACCAAATGCCAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 139 TGGCTCTGTCGGCAGTGTGTTTTTGCAACAACAACAAAGAGGGGTGGTGCACTTAAGAAAGGACCAAATGCCAA 212
Query 519 AGCATTGCAAGTCATGAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGGCAGACCTTGAATGGGATGCAGGTCATAAAACCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213 AGCATTGCAAGTCATGAAGCAGACATTACCCTATAGTGTGGCAGACCTTGAATGGGATGCAGGTCATAAAACCA 286
Query 593 ATGTCCAGCAGTGTTACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGACTGGTATTTGAAGATGCTACAGTGCTGCAAATGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 287 ATGTCCAGCAGTGTTACTGCTATTGTGGAGGCCCTGGAGACTGGTATTTGAAGATGCTACAGTGCTGCAAATGT 360
Query 667 AAGCAGTGGTTTCATGAGGCTTGTGTGCAATGCCTTCAAAAGCCAATGCTATTTGGAGACAGATTTTATACGTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 361 AAGCAGTGGTTTCATGAGGCTTGTGTGCAATGCCTTCAAAAGCCAATGCTATTTGGAGACAGATTTTATACGTT 434
Query 741 TATATGCTCTGTCTGCAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAACGTCTACCATTACAGTGGGTAGATATAGCACACC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 435 TATATGCTCTGTCTGCAGTTCTGGACCAGAATACCTCAAACGTCTACCATTACAGTGGGTAGATATAGCACACC 508
Query 815 TATGCCTTTACAACCTAAGTGTTATTCATAAGAAGAAATACTTTGATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 509 TATGCCTTTACAACCTAAGTGTTATTCATAAGAAGAAATACTTTGATTCTGAACTTGAGCTTATGACATACATT 582
Query 889 AATGAAAACTGGGATAGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGACACACCAAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 583 AATGAAAACTGGGATAGATTGCACCCTGGAGAGCTGGCAGACACACCAAAATCTGAAAGATATGAGCATGTTCT 656
Query 963 GGAGGCATTAAATGATTACAAGACCAT----------------------------------------------- 989
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 657 GGAGGCATTAAATGATTACAAGACCATGTTTATGTCTGGGAAAGAAATAAAGAAGAAGAAGCATTTGTTTGGGT 730
Query 990 -------------------------------------------------------------------------- 989
Sbjct 731 TGCGAATTCGTGTTCCTCCTGTGCCACCAAATGTGGCTTTCAAAGCAGAGAAAGAACCTGAAGGAACATCTCAT 804
Query 990 --------------------------------------------------GGAAGTAAGCAATGGCATAGAAAA 1013
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 805 GAATTTAAAATTAAAGGCAGAAAGGCATCCAAACCTATATCTGATTCAAGGGAAGTAAGCAATGGCATAGAAAA 878
Query 1014 AAAAGGAAAGAAAAAATCTGTAGGTCGTCCACCTGGCCCATATACAAGAAAAATGATTCAAAAAACTGCTGAGC 1087
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 879 AAAAGGAAAGAAAAAATCTGTAGGTCGTCCACCTGGCCCATATACAAGAAAAATGATTCAAAAAACTGCTGAGC 952
Query 1088 CACTTTTGGATAAGGAATCAATTTCAGAGAATCCTACTTTGGATTTACCTTGTTCTATAGGGAGAACTGAGGGA 1161
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 953 CACTTTTGGATAAGGAATCAATTTCAGAGAATCCTACTTTGGATTTACCTTGTTCTATAGGGAGAACTGAGGGA 1026
Query 1162 ACTGCACATTCATCCAATACCTCAGATGTGGATTTCACGGGTGCTTCCAGTGCAAAAGAAACTACCTCGTCTAG 1235
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027 ACTGCACATTCATCCAATACCTCAGATGTGGATTTCACGGGTGCTTCCAGTGCAAAAGAAACTACCTCGTCTAG 1100
Query 1236 CATTTCCAGGCATTATGGATTATCTGACTCCAGAAAAAGAACGCGTACAGGAAGATCTTGGCCTGCTGCAATAC 1309
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101 CATTTCCAGGCATTATGGATTATCTGACTCCAGAAAAAGAACGCGTACAGGAAGATCTTGGCCTGCTGCAATAC 1174
Query 1310 CACATTTGCGGAGAAGAAGAGGTCGTCTTCCAAGAAGAGCACTCCAGACTCAGAACTCAGAAATTGTAAAAGAT 1383
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175 CACATTTGCGGAGAAGAAGAGGTCGTCTTCCAAGAAGAGCACTCCAGACTCAGAACTCAGAAATTGTAAAAGAT 1248
Query 1384 GATGAAGGCAAAGAAGATTATCAGTTTGATGAACTCAACACAGAGATTCTGAATAACTTAGCAGATCAGGAGTT 1457
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249 GATGAAGGCAAAGAAGATTATCAGTTTGATGAACTCAACACAGAGATTCTGAATAACTTAGCAGATCAGGAGTT 1322
Query 1458 ACAACTCAATCATCTAAAGAACTCCATTACCAGTTATTTTGGTGCTGCAGGTAGAATAGCATGTGGCGAAAAAT 1531
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323 ACAACTCAATCATCTAAAGAACTCCATTACCAGTTATTTTGGTGCTGCAGGTAGAATAGCATGTGGCGAAAAAT 1396
Query 1532 ACCGAGTTTTGGCACGTCGGGTGACACTTGATGGAAAGGTGCAGTATCTTGTGGAATGGGAAGGAGCAACTGCA 1605
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397 ACCGAGTTTTGGCACGTCGGGTGACACTTGATGGAAAGGTGCAGTATCTTGTGGAATGGGAAGGAGCAACTGCA 1470
Query 1606 TCC 1608
|||
Sbjct 1471 TCC 1473
