Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02790
- Subject:
- NM_001286417.1
- Aligned Length:
- 1144
- Identities:
- 978
- Gaps:
- 101
Alignment
Query 1 ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT 74
Query 75 TACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACT 148
||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 75 TACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACT 148
Query 149 ATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAA 221
||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 149 ATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAA 221
Query 222 CTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGA 292
.||||||||||..||.|||||||||||.|| |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 222 TTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGA 295
Query 293 CACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTC 366
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 296 CACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTC 369
Query 367 CGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACG 440
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 370 CGAGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCG 443
Query 441 TGGCTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACG 514
.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 444 CGGCTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACG 517
Query 515 GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTC 588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 518 GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTC 591
Query 589 ACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATC 662
||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 592 ACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATC 665
Query 663 CAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTT 736
||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 666 CAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTT 739
Query 737 ACATTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTC 810
||||.|||.|||||| |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 740 ACATCCCTCTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTC 801
Query 811 AGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCC 884
.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 802 CGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCC 875
Query 885 CGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGAT 958
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 876 CGCCTATCCAGG----------------------------------------GGTGGATATGCAGCCTACAGAT 909
Query 959 ATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGC 1032
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 910 ATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACAGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGCGACGGTTACGGC 983
Query 1033 AGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTT 1106
||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 984 AGGGTGTACACAGCTGACCCCTACCATGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGCTATGGAGTTGGCGCTG---------- 1047
Query 1107 ATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC 1140
Sbjct 1048 ---------------------------------- 1047