Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_02790
Subject:
NM_001286417.1
Aligned Length:
1144
Identities:
978
Gaps:
101

Alignment

Query    1  ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGAAAAAGAAAATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTT  74

Query   75  TACTACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACT  148
            ||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct   75  TACTACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACT  148

Query  149  ATGCCGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAA  221
            ||||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||
Sbjct  149  ATGCCGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAA  221

Query  222  CTCACCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGA  292
            .||||||||||..||.|||||||||||.||   |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  222  TTCACCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGA  295

Query  293  CACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTC  366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  296  CACAAAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTC  369

Query  367  CGGGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACG  440
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  370  CGAGACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCG  443

Query  441  TGGCTCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACG  514
            .|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  444  CGGCTCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACG  517

Query  515  GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTC  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  518  GCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTC  591

Query  589  ACACCATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATC  662
            ||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  592  ACGCCATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATC  665

Query  663  CAGCTTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTT  736
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  666  CAGCTTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTT  739

Query  737  ACATTCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTC  810
            ||||.|||.||||||            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  740  ACATCCCTCTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTC  801

Query  811  AGAGGAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCC  884
            .|||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  802  CGAGGAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCC  875

Query  885  CGCCTATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGAT  958
            ||||||||||||                                        ||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  CGCCTATCCAGG----------------------------------------GGTGGATATGCAGCCTACAGAT  909

Query  959  ATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGC  1032
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  910  ATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACAGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGCGACGGTTACGGC  983

Query 1033  AGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTT  1106
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||          
Sbjct  984  AGGGTGTACACAGCTGACCCCTACCATGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGCTATGGAGTTGGCGCTG----------  1047

Query 1107  ATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC  1140
                                              
Sbjct 1048  ----------------------------------  1047