Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02790
- Subject:
- XM_005261428.2
- Aligned Length:
- 1397
- Identities:
- 1120
- Gaps:
- 271
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGGAGGGCGCCCAGCCGCATCAGCCGCCTCAGCTCGGGCCCGGCGCCGCCGCCCGGGGCATGAAGCGGGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GTCGGAGCTGGAGCTGCCGGTGCCCGGAGCGGGAGGAGACGGAGCCGATCCCGGCCTGAGCAAGCGGCCGCGCA 148
Query 1 --------------------------------ATGGAGAAAAAG----------------AAAATGGTAACT-- 24
|||.||||..|| |..|||| |.|
Sbjct 149 CTGAGGAGGCGGCGGCCGACGGTGGCGGCGGGATGCAGAACGAGCCTCTGACTCCAGGTTATCATGG--ATTCC 220
Query 25 --------------CAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATC 84
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221 CAGCGCGGGACAGCCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACTACCATC 294
Query 85 CCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCA 158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 CCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGCCGGCCA 368
Query 159 GACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCA 232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 GACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCCCACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCACCCAGCA 442
Query 233 CACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGT 303
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443 CACAAAATGGATCTCTTACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACAAAGTAGT 516
Query 304 GAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGA 377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517 GAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGGACCCTGA 590
Query 378 CCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGG 451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 CCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGCTCTAAGG 664
Query 452 GATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTA 525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665 GATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCACCGTGGTA 738
Query 526 GAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGC 599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 739 GAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACACCATATGC 812
Query 600 AAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAG 673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 813 AAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGCTTTCAAG 886
Query 674 CAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTA 747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 CAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACATTCCTTTA 960
Query 748 ATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCA 821
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 961 ATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAGGAGCCCA 1022
Query 822 TTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAG 895
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023 TTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCCTATCCAG 1096
Query 896 GTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTAT--------------------------------G 937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct 1097 GTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATATAGAATCTGCAAACTGCTTCAGATCAAACAGG 1170
Query 938 GTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCC 1011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1171 GTGGATATGCAGCCTACAGATATGCACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCC 1244
Query 1012 GCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGG 1085
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1245 GCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGGTGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGG 1318
Query 1086 AGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC---------- 1140
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319 AGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATACCGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTACTGAAGTGACG 1383